Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6N5

Protein Details
Accession C5M6N5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-200RDFLKYKPVNNLKRRPNWDNHydrophilic
240-260ITCFKYLQERFKKQGKSKKLIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG ctp:CTRG_01516  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MDYKAHISNLKFFTNSNYQSEFVFATILLIGYLNDGISSKDLEWISVDLQDNYGIEASITLEKLIDYKMIRVINESSGDFLSSLGLTKQKKKAIPDELDIEEDKNIGISGGRDAFRSNYTLINKFWNLHPFEDEDAEQQDMNESGTNESTNLLDLYPNPSFALPGNTVPLLYRFVESLYFRDFLKYKPVNNLKRRPNWDNLGVNTMFAGDTVDLNLEKVNDDKSEYLVIVIIGGITRSEITCFKYLQERFKKQGKSKKLIVLTNGIVNSNKLWKFMSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.39
4 0.38
5 0.35
6 0.35
7 0.37
8 0.3
9 0.21
10 0.18
11 0.12
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.18
34 0.2
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.08
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.17
56 0.18
57 0.18
58 0.2
59 0.22
60 0.21
61 0.22
62 0.21
63 0.17
64 0.15
65 0.16
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.12
73 0.15
74 0.22
75 0.28
76 0.33
77 0.37
78 0.41
79 0.48
80 0.52
81 0.54
82 0.5
83 0.49
84 0.44
85 0.43
86 0.38
87 0.3
88 0.21
89 0.17
90 0.13
91 0.08
92 0.07
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.06
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.15
106 0.18
107 0.2
108 0.2
109 0.23
110 0.23
111 0.22
112 0.24
113 0.25
114 0.24
115 0.22
116 0.23
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.18
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.14
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.17
169 0.18
170 0.16
171 0.25
172 0.27
173 0.26
174 0.36
175 0.46
176 0.52
177 0.61
178 0.7
179 0.69
180 0.75
181 0.8
182 0.76
183 0.73
184 0.69
185 0.67
186 0.63
187 0.56
188 0.52
189 0.44
190 0.38
191 0.31
192 0.25
193 0.17
194 0.11
195 0.11
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.08
226 0.1
227 0.14
228 0.17
229 0.17
230 0.19
231 0.28
232 0.33
233 0.41
234 0.5
235 0.54
236 0.59
237 0.67
238 0.74
239 0.75
240 0.8
241 0.8
242 0.78
243 0.78
244 0.79
245 0.78
246 0.73
247 0.68
248 0.64
249 0.56
250 0.53
251 0.46
252 0.39
253 0.32
254 0.28
255 0.27
256 0.28
257 0.27
258 0.23