Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MJL0

Protein Details
Accession C5MJL0    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MTEQPTKKRIKPITKPTRSFQGNHydrophilic
116-145IQYFKILSNKLKKFKKNKKLKLKLIKYSELHydrophilic
462-482EIPVPKSKHGHKYSQHSINKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-138KLKKFKKNKKLKLK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG ctp:CTRG_06253  -  
Amino Acid Sequences MTEQPTKKRIKPITKPTRSFQGNKKYLNFYNQFVDQTFKPQFQSSDLTSNFITNSGKTYPYNIDNITLGEEGTKWSSIEKEIFFNLLNKYSTISRILSNKDIWLINLPNKSMIEIIQYFKILSNKLKKFKKNKKLKLKLIKYSELPISFEISPFMLKFESLQSELISIRENYKLSERNDPLKKLNLELDSERSIIDINTIFKSIKNINNMSIDSLVLFEKLSKLIIKKIINNVLLYTNYSDDDDVKKKKNSIKAKDIRTGIECLNYNHPDIYFHIKNSLKLPDKLITISPFIDELQEEDDEKPKQNTIKSLMNLQQLKEDEKIEKEYSFLSEGGDSPLERYLNYKETQELERQDLENSRMYERGLIMMLMSDELRNEQGFNEEDEELANVWIDQVRKQQQEEESGVEMEEEETSDIENSDDEDMEIDDEIKRITNEAISTDDQEEQTEVVVAEEEDSDEPVEIPVPKSKHGHKYSQHSINKKLTKFSYKFASY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.88
3 0.83
4 0.83
5 0.79
6 0.76
7 0.75
8 0.75
9 0.72
10 0.74
11 0.74
12 0.72
13 0.69
14 0.71
15 0.65
16 0.57
17 0.54
18 0.5
19 0.46
20 0.39
21 0.39
22 0.3
23 0.34
24 0.34
25 0.31
26 0.31
27 0.32
28 0.32
29 0.32
30 0.37
31 0.32
32 0.37
33 0.35
34 0.35
35 0.33
36 0.32
37 0.28
38 0.25
39 0.23
40 0.14
41 0.18
42 0.17
43 0.2
44 0.2
45 0.24
46 0.27
47 0.29
48 0.33
49 0.29
50 0.29
51 0.27
52 0.27
53 0.25
54 0.2
55 0.16
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.16
65 0.2
66 0.2
67 0.21
68 0.22
69 0.23
70 0.23
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.23
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.22
79 0.22
80 0.21
81 0.21
82 0.26
83 0.3
84 0.32
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.29
89 0.26
90 0.26
91 0.26
92 0.28
93 0.29
94 0.28
95 0.27
96 0.27
97 0.27
98 0.22
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.19
107 0.22
108 0.19
109 0.25
110 0.33
111 0.4
112 0.49
113 0.58
114 0.64
115 0.73
116 0.81
117 0.84
118 0.85
119 0.88
120 0.9
121 0.92
122 0.93
123 0.93
124 0.91
125 0.9
126 0.86
127 0.8
128 0.7
129 0.64
130 0.58
131 0.48
132 0.4
133 0.32
134 0.28
135 0.23
136 0.21
137 0.18
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.12
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.19
160 0.25
161 0.26
162 0.35
163 0.36
164 0.43
165 0.48
166 0.5
167 0.47
168 0.48
169 0.47
170 0.39
171 0.4
172 0.33
173 0.3
174 0.29
175 0.29
176 0.24
177 0.23
178 0.21
179 0.16
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.15
190 0.18
191 0.21
192 0.25
193 0.26
194 0.27
195 0.3
196 0.29
197 0.27
198 0.22
199 0.18
200 0.12
201 0.12
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.12
212 0.19
213 0.21
214 0.24
215 0.29
216 0.34
217 0.34
218 0.33
219 0.3
220 0.25
221 0.23
222 0.2
223 0.16
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.12
230 0.17
231 0.21
232 0.25
233 0.26
234 0.31
235 0.36
236 0.43
237 0.5
238 0.52
239 0.58
240 0.62
241 0.66
242 0.67
243 0.64
244 0.57
245 0.49
246 0.43
247 0.33
248 0.28
249 0.24
250 0.19
251 0.23
252 0.23
253 0.21
254 0.19
255 0.18
256 0.16
257 0.17
258 0.23
259 0.18
260 0.17
261 0.24
262 0.25
263 0.26
264 0.28
265 0.34
266 0.3
267 0.3
268 0.33
269 0.29
270 0.29
271 0.28
272 0.27
273 0.21
274 0.19
275 0.17
276 0.15
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.13
287 0.14
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.2
292 0.21
293 0.25
294 0.26
295 0.32
296 0.31
297 0.36
298 0.38
299 0.42
300 0.42
301 0.37
302 0.37
303 0.32
304 0.33
305 0.29
306 0.26
307 0.21
308 0.21
309 0.25
310 0.22
311 0.21
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.18
316 0.16
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.13
328 0.15
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.23
334 0.26
335 0.29
336 0.28
337 0.27
338 0.29
339 0.28
340 0.28
341 0.28
342 0.28
343 0.27
344 0.26
345 0.24
346 0.22
347 0.22
348 0.21
349 0.19
350 0.18
351 0.13
352 0.11
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.11
366 0.12
367 0.14
368 0.16
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.05
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.19
382 0.27
383 0.31
384 0.33
385 0.38
386 0.39
387 0.45
388 0.44
389 0.39
390 0.33
391 0.3
392 0.28
393 0.22
394 0.19
395 0.13
396 0.1
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.08
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.19
425 0.19
426 0.22
427 0.22
428 0.24
429 0.21
430 0.21
431 0.2
432 0.16
433 0.14
434 0.12
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.12
450 0.14
451 0.2
452 0.22
453 0.26
454 0.33
455 0.41
456 0.49
457 0.54
458 0.62
459 0.63
460 0.71
461 0.77
462 0.81
463 0.81
464 0.77
465 0.79
466 0.8
467 0.8
468 0.73
469 0.71
470 0.68
471 0.71
472 0.67
473 0.64