Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHK3

Protein Details
Accession C5MHK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MTRSKNFKSWTKKKSTSTTTSTHydrophilic
259-297IHGEPERTKHHHHRHHQNGRRSYRERDSYRPRRNNDDDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
KEGG ctp:CTRG_05557  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MTRSKNFKSWTKKKSTSTTTSTASTTTSQYQRAEQTTRMSAEPEVAPYGGFMVKSLEEETKQLNDLTNHQYEITTLEGKTETIRPESLKIIGVDNLSTKNIENYINYYINYNQIEYEEVDLITNELIKGKKFQLKENQDCIDFKIEWINDESVNVTFRNIQDSNKVLKELRIEELKGSFEDEITRDEYLKNCIIETPAKSYNPIIEFEKIQNLNGSNETKQEGVDMEEDESSIELIIRQSFQSDRKVKNAREYSRYYLIHGEPERTKHHHHRHHQNGRRSYRERDSYRPRRNNDDDDDEEDLFADKLGKTNPTNRHNNHVDEEEDLFADKLKHANRDRSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.82
4 0.78
5 0.74
6 0.67
7 0.6
8 0.53
9 0.43
10 0.37
11 0.31
12 0.27
13 0.28
14 0.29
15 0.31
16 0.32
17 0.36
18 0.39
19 0.43
20 0.43
21 0.39
22 0.41
23 0.41
24 0.42
25 0.38
26 0.33
27 0.28
28 0.28
29 0.26
30 0.22
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.13
35 0.15
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.13
43 0.14
44 0.14
45 0.16
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.2
51 0.19
52 0.24
53 0.28
54 0.27
55 0.26
56 0.25
57 0.24
58 0.21
59 0.21
60 0.19
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.18
68 0.17
69 0.17
70 0.2
71 0.2
72 0.22
73 0.24
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.15
91 0.19
92 0.2
93 0.2
94 0.2
95 0.19
96 0.23
97 0.23
98 0.2
99 0.15
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.05
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.11
116 0.16
117 0.21
118 0.23
119 0.3
120 0.37
121 0.47
122 0.54
123 0.57
124 0.55
125 0.51
126 0.5
127 0.45
128 0.38
129 0.28
130 0.21
131 0.2
132 0.17
133 0.16
134 0.18
135 0.17
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.09
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.2
150 0.23
151 0.22
152 0.23
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.17
163 0.14
164 0.13
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.21
188 0.23
189 0.21
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.25
196 0.21
197 0.2
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.21
202 0.22
203 0.16
204 0.17
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.09
227 0.12
228 0.15
229 0.24
230 0.31
231 0.33
232 0.42
233 0.5
234 0.51
235 0.59
236 0.65
237 0.61
238 0.61
239 0.63
240 0.6
241 0.6
242 0.58
243 0.5
244 0.46
245 0.41
246 0.42
247 0.38
248 0.37
249 0.32
250 0.35
251 0.39
252 0.38
253 0.45
254 0.48
255 0.57
256 0.62
257 0.69
258 0.76
259 0.82
260 0.88
261 0.9
262 0.89
263 0.89
264 0.87
265 0.87
266 0.8
267 0.77
268 0.75
269 0.76
270 0.72
271 0.71
272 0.75
273 0.76
274 0.82
275 0.84
276 0.8
277 0.8
278 0.82
279 0.8
280 0.76
281 0.73
282 0.66
283 0.62
284 0.6
285 0.5
286 0.42
287 0.34
288 0.28
289 0.19
290 0.15
291 0.12
292 0.08
293 0.11
294 0.14
295 0.19
296 0.22
297 0.31
298 0.4
299 0.47
300 0.57
301 0.58
302 0.65
303 0.65
304 0.67
305 0.63
306 0.57
307 0.49
308 0.42
309 0.41
310 0.32
311 0.27
312 0.22
313 0.17
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.18
318 0.22
319 0.31
320 0.38
321 0.48
322 0.54