Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHJ8

Protein Details
Accession C5MHJ8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MRGKKKKILQPKDNPNFFFFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) E.R. 6, pero 4, golg 4, nucl 3, mito 3, mito_nucl 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013947  Mediator_Med14  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_05552  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08638  Med14  
Amino Acid Sequences MRGKKKKILQPKDNPNFFFFFSFLISLFLHPFLYSPILFYRRTHLSVDQQHTIVRMDQHSNGSPNGKLEATSSSTPDIPHVTANILPLSNILKFYTQEAYKQLTTAVENLSMNVEDESDIKRKKYFLDIIISLRQDFIKVYTLIKWASISKDVSKFIDLLNWFRLQEFQFENLMFQLNGLTGYSGAKLPNSDILTALEVLYKGRPTLPSYNHIKIKNLSSEKILEVLEDLNLVLMTRFALMDVPKKFQYEIKDGRVYITVSNEFEVSITVGNDMIIDKKEDYYKSPFYFIDFKFLFGINPETSMITYHDDKVFTRLPASSHGKLEKIANQVLLKEGLEGLYDLLHRYSTSFKIYLIAKQFKELLNTRWRNNVQINYQTGKSLIIVNYWSSHYLSKNWKSFLELGIDRNSNLSYRWFKNGQYCVDEELNKIFHIIPQDNLNDTGNASNNSNSNNNNSNTNEDGVDEESYSDDLNVDLILNVVVNKHAELLMGMIYEQLLDKFGEDEVSMVTPHQLLLQISPNKSTVFAINPLTGVLLFH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.76
3 0.68
4 0.59
5 0.5
6 0.4
7 0.3
8 0.24
9 0.22
10 0.18
11 0.18
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.16
21 0.14
22 0.15
23 0.2
24 0.24
25 0.26
26 0.26
27 0.3
28 0.33
29 0.36
30 0.37
31 0.36
32 0.42
33 0.5
34 0.55
35 0.53
36 0.47
37 0.46
38 0.44
39 0.4
40 0.33
41 0.28
42 0.26
43 0.26
44 0.28
45 0.32
46 0.35
47 0.36
48 0.36
49 0.34
50 0.31
51 0.29
52 0.28
53 0.23
54 0.2
55 0.18
56 0.19
57 0.22
58 0.22
59 0.22
60 0.22
61 0.23
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.22
83 0.2
84 0.22
85 0.25
86 0.29
87 0.28
88 0.27
89 0.26
90 0.21
91 0.21
92 0.21
93 0.18
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.09
104 0.12
105 0.18
106 0.2
107 0.21
108 0.24
109 0.25
110 0.27
111 0.34
112 0.36
113 0.34
114 0.39
115 0.4
116 0.42
117 0.45
118 0.43
119 0.35
120 0.3
121 0.26
122 0.19
123 0.16
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.17
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.16
134 0.18
135 0.21
136 0.2
137 0.23
138 0.27
139 0.28
140 0.28
141 0.27
142 0.25
143 0.21
144 0.25
145 0.21
146 0.19
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.19
151 0.23
152 0.18
153 0.21
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.18
161 0.13
162 0.1
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.14
193 0.21
194 0.24
195 0.3
196 0.37
197 0.43
198 0.47
199 0.47
200 0.45
201 0.41
202 0.41
203 0.43
204 0.39
205 0.34
206 0.3
207 0.3
208 0.28
209 0.27
210 0.23
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.07
216 0.06
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.05
227 0.06
228 0.12
229 0.14
230 0.17
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.21
235 0.25
236 0.27
237 0.31
238 0.34
239 0.36
240 0.35
241 0.36
242 0.34
243 0.3
244 0.22
245 0.19
246 0.15
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.1
267 0.11
268 0.14
269 0.19
270 0.24
271 0.24
272 0.26
273 0.25
274 0.25
275 0.32
276 0.29
277 0.31
278 0.26
279 0.26
280 0.24
281 0.24
282 0.21
283 0.15
284 0.19
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.18
299 0.19
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.15
304 0.22
305 0.28
306 0.26
307 0.27
308 0.28
309 0.28
310 0.28
311 0.29
312 0.27
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.22
317 0.22
318 0.22
319 0.2
320 0.15
321 0.11
322 0.1
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.1
335 0.11
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.18
340 0.2
341 0.23
342 0.28
343 0.33
344 0.3
345 0.31
346 0.34
347 0.31
348 0.35
349 0.33
350 0.32
351 0.36
352 0.4
353 0.4
354 0.47
355 0.46
356 0.46
357 0.5
358 0.49
359 0.43
360 0.45
361 0.48
362 0.42
363 0.41
364 0.36
365 0.3
366 0.25
367 0.2
368 0.17
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.15
376 0.13
377 0.15
378 0.16
379 0.21
380 0.3
381 0.37
382 0.41
383 0.42
384 0.41
385 0.42
386 0.43
387 0.38
388 0.36
389 0.3
390 0.28
391 0.3
392 0.31
393 0.26
394 0.26
395 0.24
396 0.17
397 0.17
398 0.2
399 0.22
400 0.24
401 0.31
402 0.32
403 0.35
404 0.43
405 0.48
406 0.45
407 0.42
408 0.4
409 0.39
410 0.4
411 0.38
412 0.31
413 0.28
414 0.25
415 0.21
416 0.21
417 0.17
418 0.15
419 0.2
420 0.2
421 0.18
422 0.22
423 0.24
424 0.24
425 0.26
426 0.25
427 0.19
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.17
432 0.17
433 0.17
434 0.18
435 0.21
436 0.24
437 0.23
438 0.26
439 0.31
440 0.31
441 0.34
442 0.35
443 0.36
444 0.35
445 0.35
446 0.29
447 0.23
448 0.23
449 0.2
450 0.19
451 0.14
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.09
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.12
502 0.15
503 0.24
504 0.29
505 0.3
506 0.33
507 0.33
508 0.31
509 0.31
510 0.3
511 0.25
512 0.22
513 0.26
514 0.27
515 0.26
516 0.26
517 0.24
518 0.23