FuNGI

C5MH50

Protein Details

Accession

C5MH50

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MGKQQKKHSKGRLDRYYYLA	Hydrophilic
363-389	LMQKMEKQKQKRVKKLREIKAQSKQAS	Hydrophilic
545-595	LEAVARKKMKMQKKFEKLKSIEDVSDYNKMVKKISKKPQKKKVTVIVARGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
370-381	QKQKRVKKLREI
531-563	KKALKNKRSLSKKALEAVARKKMKMQKKFEKLK
574-632	MVKKISKKPQKKKVTVIVARGSNRGLSGRPKGVKGKYKMVDGVSKNEQRALKRIAKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002877 RNA_MeTrfase_FtsJ_dom IPR015507 rRNA-MeTfrase_E IPR012920 rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C IPR024576 rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381 IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0016435 F:rRNA (guanine) methyltransferase activity GO:0008650 F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	ctp:CTRG_05404 -
Pfam	View protein in Pfam PF11861 DUF3381 PF01728 FtsJ PF07780 Spb1_C

Amino Acid Sequences

MGKQQKKHSKGRLDRYYYLAKEKGYRARSSFKIIQINEKYGHFLEKSKVVIDLCAAPGSWCQVASQLCPVNSLIIGVDIVPIKPLPNVITFQSDITTEDCRSRLRGHMKTWKADTVLHDGAPNVGLGWVQDAFTQSQLTLQALKLAVENLAAGGTFVTKIFRSRDYNNLMWVFQQLFEKVEATKPPASRNVSAEIFVVCKGFKAPKKLDPRLLDPKEVFEELGAEKQNNEAKVFNPEKFASTRQRQGYEEGDYTLYHTMPIMEFIKEEDPIDKLGTLNKFDIPDKNEDHEWKIITKSKIFTPELAECAKDLKVLGKKEFKHLIRFRQKARDLLGLNDKVDKTPIDVEEELNDEEKIDRELQELMQKMEKQKQKRVKKLREIKAQSKQASKNVFEFDSIFAGLESFGDDIFIQNEMDNKAAAESGDIDAGIEIDEDDSKSKNGADEEDEEELEEFDGPDQDDLGDLPDIDPIPSSARGATLDEDSPEFFTLAHKVALGQKHDVIDSSFNRNWGFEDERAITDGISNAALLSKKALKNKRSLSKKALEAVARKKMKMQKKFEKLKSIEDVSDYNKMVKKISKKPQKKKVTVIVARGSNRGLSGRPKGVKGKYKMVDGVSKNEQRALKRIAKKRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.78
3	0.77
4	0.7
5	0.67
6	0.59
7	0.52
8	0.5
9	0.54
10	0.57
11	0.54
12	0.57
13	0.55
14	0.59
15	0.6
16	0.62
17	0.61
18	0.59
19	0.62
20	0.57
21	0.62
22	0.6
23	0.61
24	0.55
25	0.49
26	0.46
27	0.38
28	0.41
29	0.32
30	0.3
31	0.29
32	0.31
33	0.32
34	0.28
35	0.31
36	0.26
37	0.25
38	0.24
39	0.22
40	0.19
41	0.18
42	0.17
43	0.14
44	0.15
45	0.17
46	0.16
47	0.13
48	0.11
49	0.16
50	0.18
51	0.19
52	0.25
53	0.27
54	0.26
55	0.28
56	0.28
57	0.24
58	0.22
59	0.2
60	0.13
61	0.09
62	0.09
63	0.07
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.1
71	0.12
72	0.12
73	0.14
74	0.16
75	0.17
76	0.22
77	0.22
78	0.22
79	0.21
80	0.19
81	0.18
82	0.18
83	0.19
84	0.16
85	0.18
86	0.19
87	0.2
88	0.23
89	0.25
90	0.31
91	0.38
92	0.43
93	0.49
94	0.58
95	0.62
96	0.66
97	0.67
98	0.62
99	0.54
100	0.51
101	0.45
102	0.43
103	0.39
104	0.33
105	0.29
106	0.25
107	0.24
108	0.21
109	0.17
110	0.08
111	0.06
112	0.06
113	0.05
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.11
121	0.11
122	0.09
123	0.1
124	0.11
125	0.11
126	0.12
127	0.11
128	0.14
129	0.13
130	0.14
131	0.13
132	0.12
133	0.11
134	0.1
135	0.09
136	0.06
137	0.05
138	0.05
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.05
144	0.06
145	0.07
146	0.1
147	0.13
148	0.19
149	0.24
150	0.27
151	0.36
152	0.41
153	0.42
154	0.45
155	0.44
156	0.38
157	0.33
158	0.32
159	0.24
160	0.19
161	0.19
162	0.14
163	0.13
164	0.14
165	0.14
166	0.13
167	0.15
168	0.16
169	0.19
170	0.23
171	0.24
172	0.27
173	0.33
174	0.37
175	0.37
176	0.37
177	0.38
178	0.33
179	0.32
180	0.3
181	0.23
182	0.19
183	0.16
184	0.14
185	0.09
186	0.08
187	0.1
188	0.16
189	0.19
190	0.27
191	0.31
192	0.39
193	0.5
194	0.55
195	0.61
196	0.59
197	0.63
198	0.65
199	0.63
200	0.6
201	0.5
202	0.47
203	0.41
204	0.37
205	0.29
206	0.18
207	0.18
208	0.13
209	0.16
210	0.14
211	0.12
212	0.11
213	0.15
214	0.18
215	0.17
216	0.18
217	0.15
218	0.15
219	0.24
220	0.27
221	0.24
222	0.25
223	0.25
224	0.26
225	0.27
226	0.32
227	0.31
228	0.34
229	0.41
230	0.41
231	0.44
232	0.42
233	0.44
234	0.41
235	0.36
236	0.32
237	0.25
238	0.22
239	0.18
240	0.19
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.1
259	0.09
260	0.08
261	0.12
262	0.13
263	0.14
264	0.14
265	0.15
266	0.16
267	0.17
268	0.21
269	0.2
270	0.23
271	0.24
272	0.25
273	0.26
274	0.26
275	0.28
276	0.26
277	0.24
278	0.2
279	0.21
280	0.25
281	0.24
282	0.25
283	0.24
284	0.24
285	0.3
286	0.3
287	0.28
288	0.26
289	0.26
290	0.26
291	0.24
292	0.22
293	0.15
294	0.16
295	0.15
296	0.1
297	0.09
298	0.11
299	0.16
300	0.19
301	0.23
302	0.29
303	0.3
304	0.35
305	0.43
306	0.39
307	0.45
308	0.47
309	0.53
310	0.56
311	0.61
312	0.59
313	0.61
314	0.62
315	0.56
316	0.54
317	0.5
318	0.4
319	0.38
320	0.41
321	0.33
322	0.3
323	0.3
324	0.27
325	0.2
326	0.2
327	0.17
328	0.11
329	0.13
330	0.13
331	0.14
332	0.15
333	0.15
334	0.15
335	0.16
336	0.15
337	0.13
338	0.12
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.14
349	0.15
350	0.15
351	0.17
352	0.19
353	0.21
354	0.28
355	0.33
356	0.35
357	0.43
358	0.52
359	0.59
360	0.68
361	0.76
362	0.78
363	0.83
364	0.88
365	0.88
366	0.89
367	0.87
368	0.85
369	0.83
370	0.81
371	0.75
372	0.72
373	0.66
374	0.61
375	0.59
376	0.51
377	0.45
378	0.4
379	0.36
380	0.29
381	0.27
382	0.21
383	0.17
384	0.15
385	0.11
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.05
415	0.06
416	0.05
417	0.04
418	0.03
419	0.03
420	0.04
421	0.05
422	0.06
423	0.07
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.1
428	0.11
429	0.12
430	0.14
431	0.17
432	0.19
433	0.2
434	0.19
435	0.18
436	0.17
437	0.15
438	0.12
439	0.09
440	0.06
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.1
459	0.1
460	0.11
461	0.09
462	0.1
463	0.11
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.14
472	0.13
473	0.12
474	0.09
475	0.1
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.11
480	0.12
481	0.17
482	0.22
483	0.24
484	0.23
485	0.24
486	0.25
487	0.25
488	0.24
489	0.21
490	0.22
491	0.22
492	0.28
493	0.26
494	0.28
495	0.28
496	0.28
497	0.28
498	0.27
499	0.29
500	0.22
501	0.26
502	0.26
503	0.26
504	0.28
505	0.26
506	0.2
507	0.16
508	0.16
509	0.12
510	0.09
511	0.08
512	0.06
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.12
517	0.18
518	0.23
519	0.32
520	0.41
521	0.44
522	0.54
523	0.63
524	0.7
525	0.72
526	0.76
527	0.76
528	0.75
529	0.75
530	0.71
531	0.67
532	0.63
533	0.62
534	0.63
535	0.64
536	0.6
537	0.54
538	0.57
539	0.6
540	0.64
541	0.65
542	0.68
543	0.68
544	0.76
545	0.86
546	0.86
547	0.87
548	0.81
549	0.79
550	0.76
551	0.69
552	0.6
553	0.52
554	0.47
555	0.4
556	0.43
557	0.35
558	0.33
559	0.33
560	0.32
561	0.34
562	0.38
563	0.44
564	0.48
565	0.58
566	0.64
567	0.71
568	0.81
569	0.87
570	0.92
571	0.91
572	0.9
573	0.89
574	0.89
575	0.85
576	0.83
577	0.8
578	0.76
579	0.7
580	0.62
581	0.53
582	0.43
583	0.37
584	0.31
585	0.27
586	0.28
587	0.33
588	0.4
589	0.43
590	0.47
591	0.54
592	0.61
593	0.67
594	0.66
595	0.69
596	0.64
597	0.66
598	0.65
599	0.61
600	0.61
601	0.54
602	0.55
603	0.54
604	0.56
605	0.51
606	0.52
607	0.53
608	0.47
609	0.52
610	0.53
611	0.54
612	0.58

C5MH50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer