Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9K0

Protein Details
Accession C5M9K0    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPKKKGNQPSDKAKAKSKAHydrophilic
23-49AEDKTFGLKNKNKSKKVQQHINQIKASHydrophilic
253-278ESFAKWKKEQIDKKANQKKENEKSGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-39PKKKGNQPSDKAKAKSKAKSAEDKTFGLKNKNKSKKV
53-72GLAKKKEAEAKRKAEEKKAQ
265-272KKANQKKE
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ctp:CTRG_02162  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKKGNQPSDKAKAKSKAKSAEDKTFGLKNKNKSKKVQQHINQIKASVDGGLAKKKEAEAKRKAEEKKAQEEAKREAAALFGIQQQKVPFGVDPKSILCEFFKNGVCTKGNKCKFSHDPNVGRKVAKKDLYTDSREEEKENDTMDNWDEEKLRKVILSKHGNPKTTTDIVCKYFIDAVENGKYGWFWVCPNGGNECKYRHSLPPGFVLKTKEQKKLERLAAENEPKITLEEFLELERSKLDKSKFTPITVESFAKWKKEQIDKKANQKKENEKSGKRILTGREVILEKFSDKYYTEEDDGETWDLSQFKKDLPETSDEVIKDYGDGSNAQEFYQQDDEKTSLDANKSEVTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.79
3 0.78
4 0.77
5 0.75
6 0.75
7 0.74
8 0.79
9 0.78
10 0.78
11 0.73
12 0.67
13 0.62
14 0.59
15 0.57
16 0.56
17 0.56
18 0.56
19 0.62
20 0.7
21 0.73
22 0.76
23 0.82
24 0.83
25 0.86
26 0.87
27 0.84
28 0.85
29 0.88
30 0.87
31 0.77
32 0.67
33 0.57
34 0.47
35 0.39
36 0.28
37 0.19
38 0.16
39 0.17
40 0.22
41 0.22
42 0.22
43 0.23
44 0.25
45 0.33
46 0.36
47 0.43
48 0.47
49 0.54
50 0.61
51 0.68
52 0.7
53 0.71
54 0.72
55 0.7
56 0.69
57 0.69
58 0.68
59 0.65
60 0.66
61 0.61
62 0.58
63 0.51
64 0.43
65 0.34
66 0.28
67 0.24
68 0.19
69 0.15
70 0.13
71 0.16
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.15
79 0.15
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.22
85 0.2
86 0.21
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.22
91 0.25
92 0.23
93 0.25
94 0.28
95 0.29
96 0.3
97 0.36
98 0.41
99 0.44
100 0.46
101 0.46
102 0.5
103 0.55
104 0.6
105 0.61
106 0.6
107 0.63
108 0.66
109 0.72
110 0.66
111 0.6
112 0.56
113 0.53
114 0.51
115 0.47
116 0.41
117 0.38
118 0.44
119 0.48
120 0.47
121 0.42
122 0.38
123 0.38
124 0.37
125 0.33
126 0.28
127 0.24
128 0.22
129 0.21
130 0.18
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.15
144 0.19
145 0.27
146 0.35
147 0.38
148 0.48
149 0.52
150 0.54
151 0.53
152 0.5
153 0.46
154 0.41
155 0.36
156 0.29
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.25
161 0.21
162 0.18
163 0.17
164 0.15
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.16
181 0.17
182 0.19
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.25
187 0.26
188 0.25
189 0.31
190 0.32
191 0.32
192 0.37
193 0.38
194 0.37
195 0.37
196 0.38
197 0.35
198 0.41
199 0.45
200 0.45
201 0.46
202 0.52
203 0.55
204 0.59
205 0.59
206 0.54
207 0.51
208 0.47
209 0.5
210 0.48
211 0.43
212 0.35
213 0.3
214 0.26
215 0.24
216 0.2
217 0.13
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.17
229 0.19
230 0.22
231 0.26
232 0.36
233 0.38
234 0.38
235 0.4
236 0.36
237 0.39
238 0.36
239 0.34
240 0.24
241 0.29
242 0.3
243 0.31
244 0.3
245 0.3
246 0.34
247 0.43
248 0.51
249 0.54
250 0.63
251 0.65
252 0.76
253 0.81
254 0.8
255 0.77
256 0.78
257 0.78
258 0.76
259 0.81
260 0.79
261 0.76
262 0.76
263 0.78
264 0.73
265 0.65
266 0.61
267 0.54
268 0.52
269 0.5
270 0.42
271 0.38
272 0.36
273 0.34
274 0.31
275 0.28
276 0.2
277 0.19
278 0.19
279 0.16
280 0.16
281 0.19
282 0.2
283 0.24
284 0.24
285 0.24
286 0.24
287 0.23
288 0.24
289 0.22
290 0.18
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.17
296 0.16
297 0.16
298 0.23
299 0.25
300 0.28
301 0.3
302 0.34
303 0.35
304 0.37
305 0.39
306 0.32
307 0.33
308 0.28
309 0.25
310 0.2
311 0.16
312 0.15
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.21
320 0.2
321 0.25
322 0.32
323 0.3
324 0.25
325 0.28
326 0.29
327 0.26
328 0.27
329 0.25
330 0.22
331 0.24
332 0.24
333 0.24