Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M2W3

Protein Details
Accession C5M2W3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-131PDGACKLRRKGKPGQKERKLSNVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-126RRKGKPGQKERK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040204  UBR7  
IPR047506  UBR7-like_UBR-box  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR003126  Znf_UBR  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ctp:CTRG_00402  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02207  zf-UBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51157  ZF_UBR  
CDD cd19677  UBR-box_UBR7  
Amino Acid Sequences MNESETISTNEKDEGVLTAVDYIESQKELEKEARELMPYDPNECTYEQGELRQPLFACLTCSSQNDNQPIGVCYSCSIQCHSQHELVELFTKRSFVCDCGTTRMKNTPDGACKLRRKGKPGQKERKLSNVSTSSGSGTYLELPAEDVPSESNRYNQNYHGKFCGCKQLYNPLEETGHMIQCYFGFTCGEDWYHDRCVMGVKSLGSVASKDKMKIEGENMLDKGISPGVDAKIQPKEEKEEDSLEQLRYFPKLEKFDEFICWKCVDQFKEIFEELDKKFPGVIMTKLPRYDDIVTVDDWYNKREESLQPKAKKIKTEGSSSSLAAEQTYSIFLGNDFRYKLLDEYPSLDKDSKLYKFLTNNSYLFKDDPIFKPPEDESEDDWSTSDMGAAEALDSLPRDRAIESIQAYDKIRSKLREFFKPFAEQGKIVTEDEVRNFFGHIDDKTQDSKQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.13
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.14
14 0.15
15 0.19
16 0.24
17 0.25
18 0.26
19 0.31
20 0.33
21 0.3
22 0.31
23 0.3
24 0.33
25 0.31
26 0.31
27 0.28
28 0.28
29 0.29
30 0.28
31 0.28
32 0.21
33 0.24
34 0.22
35 0.25
36 0.29
37 0.31
38 0.31
39 0.32
40 0.31
41 0.28
42 0.3
43 0.26
44 0.23
45 0.21
46 0.24
47 0.23
48 0.26
49 0.29
50 0.32
51 0.38
52 0.39
53 0.39
54 0.36
55 0.34
56 0.33
57 0.3
58 0.24
59 0.18
60 0.14
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.2
65 0.23
66 0.29
67 0.34
68 0.37
69 0.38
70 0.36
71 0.37
72 0.34
73 0.29
74 0.3
75 0.26
76 0.23
77 0.2
78 0.21
79 0.19
80 0.21
81 0.22
82 0.18
83 0.19
84 0.21
85 0.23
86 0.29
87 0.34
88 0.33
89 0.34
90 0.4
91 0.39
92 0.39
93 0.41
94 0.4
95 0.41
96 0.45
97 0.47
98 0.49
99 0.54
100 0.58
101 0.64
102 0.62
103 0.62
104 0.68
105 0.72
106 0.74
107 0.78
108 0.8
109 0.81
110 0.84
111 0.81
112 0.81
113 0.76
114 0.67
115 0.63
116 0.56
117 0.49
118 0.42
119 0.39
120 0.3
121 0.24
122 0.23
123 0.15
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.12
137 0.11
138 0.15
139 0.19
140 0.23
141 0.25
142 0.3
143 0.38
144 0.38
145 0.4
146 0.41
147 0.38
148 0.36
149 0.36
150 0.4
151 0.31
152 0.3
153 0.3
154 0.36
155 0.37
156 0.38
157 0.37
158 0.28
159 0.27
160 0.25
161 0.27
162 0.19
163 0.18
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.12
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.14
183 0.17
184 0.16
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.19
204 0.21
205 0.2
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.08
211 0.07
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.09
216 0.09
217 0.12
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.17
222 0.22
223 0.22
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.22
228 0.25
229 0.26
230 0.21
231 0.2
232 0.18
233 0.17
234 0.15
235 0.16
236 0.15
237 0.18
238 0.22
239 0.24
240 0.26
241 0.28
242 0.28
243 0.31
244 0.3
245 0.26
246 0.24
247 0.22
248 0.2
249 0.21
250 0.25
251 0.23
252 0.24
253 0.25
254 0.24
255 0.27
256 0.27
257 0.24
258 0.2
259 0.24
260 0.2
261 0.23
262 0.22
263 0.18
264 0.18
265 0.18
266 0.19
267 0.16
268 0.17
269 0.18
270 0.22
271 0.25
272 0.26
273 0.26
274 0.24
275 0.26
276 0.26
277 0.21
278 0.21
279 0.2
280 0.19
281 0.21
282 0.21
283 0.21
284 0.2
285 0.19
286 0.17
287 0.15
288 0.15
289 0.17
290 0.23
291 0.27
292 0.37
293 0.45
294 0.47
295 0.55
296 0.63
297 0.62
298 0.62
299 0.59
300 0.57
301 0.52
302 0.55
303 0.51
304 0.47
305 0.46
306 0.4
307 0.36
308 0.28
309 0.24
310 0.17
311 0.14
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.11
320 0.12
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.18
327 0.17
328 0.19
329 0.17
330 0.2
331 0.24
332 0.25
333 0.26
334 0.26
335 0.23
336 0.23
337 0.29
338 0.27
339 0.27
340 0.28
341 0.3
342 0.34
343 0.4
344 0.43
345 0.41
346 0.41
347 0.41
348 0.41
349 0.37
350 0.33
351 0.29
352 0.26
353 0.27
354 0.27
355 0.3
356 0.31
357 0.29
358 0.33
359 0.31
360 0.34
361 0.33
362 0.33
363 0.31
364 0.35
365 0.36
366 0.32
367 0.31
368 0.26
369 0.21
370 0.18
371 0.15
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.15
388 0.21
389 0.21
390 0.25
391 0.27
392 0.3
393 0.31
394 0.35
395 0.38
396 0.37
397 0.42
398 0.43
399 0.45
400 0.51
401 0.56
402 0.61
403 0.62
404 0.61
405 0.61
406 0.62
407 0.59
408 0.58
409 0.55
410 0.45
411 0.4
412 0.41
413 0.37
414 0.31
415 0.31
416 0.28
417 0.27
418 0.31
419 0.31
420 0.27
421 0.24
422 0.24
423 0.23
424 0.22
425 0.22
426 0.2
427 0.22
428 0.22
429 0.26
430 0.3