Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MBS0

Protein Details
Accession C5MBS0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-211LNKIEDARTRERKKKEVKKVVRTFNLKEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-201RERKKKEVKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, E.R. 8, mito_nucl 7.5, plas 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021013  ATPase_Vma12  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:1990871  C:Vma12-Vma22 assembly complex  
GO:0007035  P:vacuolar acidification  
GO:0070072  P:vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly  
KEGG ctp:CTRG_03512  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11712  Vma12  
Amino Acid Sequences MTQFEITLKLKETISNSSLDKDQKTKILSDSYIAHQDLVKFYQTCHPTSSLLQLIQQTKLHVPKFETHKQPKTKEFLKSMERLRLEAKEQEYRKLINPTPQFSTLYEEKLNEYDLTPQQAAKELKNQLTTIVNIIISVASVAYAIWYWTETSWGLPLSYRVLLSVFFGILVLVAEVVVYMGYLNKIEDARTRERKKKEVKKVVRTFNLKED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.28
4 0.28
5 0.33
6 0.34
7 0.34
8 0.32
9 0.34
10 0.36
11 0.37
12 0.37
13 0.36
14 0.37
15 0.33
16 0.32
17 0.32
18 0.3
19 0.33
20 0.3
21 0.27
22 0.23
23 0.24
24 0.23
25 0.22
26 0.22
27 0.17
28 0.18
29 0.25
30 0.26
31 0.26
32 0.27
33 0.27
34 0.25
35 0.26
36 0.3
37 0.25
38 0.23
39 0.24
40 0.26
41 0.26
42 0.27
43 0.26
44 0.23
45 0.25
46 0.31
47 0.3
48 0.27
49 0.28
50 0.32
51 0.39
52 0.45
53 0.51
54 0.54
55 0.61
56 0.67
57 0.71
58 0.7
59 0.7
60 0.67
61 0.64
62 0.59
63 0.56
64 0.54
65 0.54
66 0.51
67 0.51
68 0.46
69 0.41
70 0.38
71 0.34
72 0.31
73 0.29
74 0.29
75 0.29
76 0.3
77 0.32
78 0.31
79 0.31
80 0.32
81 0.33
82 0.31
83 0.31
84 0.34
85 0.33
86 0.34
87 0.34
88 0.32
89 0.27
90 0.3
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.19
107 0.2
108 0.17
109 0.23
110 0.24
111 0.27
112 0.28
113 0.28
114 0.24
115 0.24
116 0.23
117 0.18
118 0.15
119 0.12
120 0.1
121 0.1
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.03
126 0.02
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.03
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.16
175 0.22
176 0.32
177 0.42
178 0.51
179 0.58
180 0.66
181 0.74
182 0.8
183 0.84
184 0.86
185 0.86
186 0.88
187 0.9
188 0.92
189 0.93
190 0.91
191 0.88