FuNGI

C5M8S8

Protein Details

Accession

C5M8S8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
534-574	TLIPTRKSKPIKAIVKKQNKITKKKKNPKFGPNKVLKDEKE	Hydrophilic
581-630	RWLPMKLRSYYKPTKKDKKKSSGGQQGFTETSTHSSSSSNNKKKKKKGKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
539-567	RKSKPIKAIVKKQNKITKKKKNPKFGPNK
595-600	KKDKKK
622-630	KKKKKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	ctp:CTRG_02800 -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like

Amino Acid Sequences

MSNSIADAFKKLNVSVDLSQSEHDKIFNVSYEYLSKVKKFNDLKAAKNCLVALINLDKYHKADQIIKKLNKSLVGPLILEISYIYYKIGKIDELIKLYESNEDLQEGASIGLKHVLAQSYYKIGDYEKALELHQQLISNNKYDDELDLMINERAIISQLNFQTGGKVNFSKKVEENSYDLLFNEALIELSKQNTFKALDLLEKAANLCQQELSGSDLESELLPIKLTIAYVYQLTNDQSKSLDILENVDVEKINDLMIKLIVKNNLYSYKDLNNANAIERDLNYQQSLHKLSQKLTVLQYETILKNSMMLKFLTGTLSQSQLNNQLINEFNKKFCGDVLPLSYKLMLKLDIDYKDLQDSSKLTVVGRKLVKFISTSSDEQLKVVATVLLTFVNSKSGSFDQSLPILEKLTEESLAQPVVSPGLVGTLIGVYEKTHSSKKLTDLLVKVLEKLLYTPQDLFKNINYYNFAKVVAFKALNQGRDENAKQLFEYLFEVNANDHLINSILTHSNRDLLPLNELTSKKSIDEIVGVDIDTLIPTRKSKPIKAIVKKQNKITKKKKNPKFGPNKVLKDEKELTLDEERWLPMKLRSYYKPTKKDKKKSSGGQQGFTETSTHSSSSSNNKKKKKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.28
3	0.32
4	0.31
5	0.3
6	0.31
7	0.29
8	0.29
9	0.25
10	0.22
11	0.18
12	0.18
13	0.19
14	0.21
15	0.21
16	0.2
17	0.21
18	0.23
19	0.25
20	0.28
21	0.3
22	0.31
23	0.33
24	0.35
25	0.42
26	0.45
27	0.49
28	0.55
29	0.57
30	0.62
31	0.66
32	0.71
33	0.63
34	0.6
35	0.52
36	0.44
37	0.4
38	0.31
39	0.26
40	0.24
41	0.25
42	0.24
43	0.26
44	0.25
45	0.27
46	0.31
47	0.29
48	0.27
49	0.34
50	0.41
51	0.5
52	0.59
53	0.61
54	0.61
55	0.64
56	0.63
57	0.58
58	0.52
59	0.47
60	0.43
61	0.39
62	0.35
63	0.3
64	0.28
65	0.24
66	0.22
67	0.15
68	0.12
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.1
74	0.13
75	0.14
76	0.11
77	0.13
78	0.18
79	0.22
80	0.23
81	0.23
82	0.22
83	0.22
84	0.22
85	0.23
86	0.19
87	0.17
88	0.15
89	0.15
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.1
94	0.09
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.11
99	0.1
100	0.11
101	0.13
102	0.14
103	0.12
104	0.14
105	0.15
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.15
110	0.15
111	0.17
112	0.18
113	0.2
114	0.19
115	0.2
116	0.2
117	0.23
118	0.23
119	0.23
120	0.22
121	0.2
122	0.18
123	0.24
124	0.26
125	0.24
126	0.24
127	0.21
128	0.21
129	0.19
130	0.2
131	0.15
132	0.15
133	0.12
134	0.12
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.1
139	0.07
140	0.06
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.12
145	0.13
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.18
150	0.21
151	0.22
152	0.2
153	0.23
154	0.24
155	0.3
156	0.32
157	0.33
158	0.32
159	0.36
160	0.38
161	0.36
162	0.38
163	0.35
164	0.34
165	0.3
166	0.27
167	0.22
168	0.17
169	0.14
170	0.11
171	0.08
172	0.06
173	0.06
174	0.08
175	0.06
176	0.08
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.14
181	0.14
182	0.14
183	0.16
184	0.16
185	0.16
186	0.17
187	0.19
188	0.17
189	0.16
190	0.15
191	0.14
192	0.15
193	0.12
194	0.11
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.11
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.1
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.09
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.08
238	0.09
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.12
249	0.12
250	0.13
251	0.15
252	0.2
253	0.21
254	0.21
255	0.21
256	0.22
257	0.26
258	0.26
259	0.25
260	0.22
261	0.21
262	0.21
263	0.19
264	0.16
265	0.12
266	0.12
267	0.14
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.12
273	0.15
274	0.18
275	0.17
276	0.21
277	0.22
278	0.23
279	0.28
280	0.29
281	0.27
282	0.26
283	0.26
284	0.22
285	0.21
286	0.2
287	0.18
288	0.17
289	0.15
290	0.14
291	0.12
292	0.13
293	0.14
294	0.14
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.11
308	0.15
309	0.16
310	0.15
311	0.14
312	0.14
313	0.15
314	0.18
315	0.22
316	0.18
317	0.18
318	0.19
319	0.19
320	0.17
321	0.16
322	0.16
323	0.12
324	0.13
325	0.17
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.19
330	0.16
331	0.15
332	0.14
333	0.11
334	0.09
335	0.1
336	0.14
337	0.14
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.16
342	0.16
343	0.14
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.13
348	0.13
349	0.12
350	0.15
351	0.16
352	0.21
353	0.23
354	0.22
355	0.21
356	0.21
357	0.22
358	0.19
359	0.19
360	0.18
361	0.19
362	0.2
363	0.2
364	0.24
365	0.22
366	0.22
367	0.21
368	0.16
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.06
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.11
383	0.11
384	0.14
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.16
389	0.17
390	0.15
391	0.14
392	0.13
393	0.11
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.03
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.06
419	0.07
420	0.1
421	0.13
422	0.15
423	0.19
424	0.23
425	0.27
426	0.32
427	0.33
428	0.37
429	0.35
430	0.37
431	0.39
432	0.36
433	0.32
434	0.26
435	0.24
436	0.18
437	0.18
438	0.18
439	0.15
440	0.16
441	0.18
442	0.21
443	0.24
444	0.25
445	0.25
446	0.23
447	0.28
448	0.27
449	0.28
450	0.28
451	0.27
452	0.29
453	0.27
454	0.26
455	0.2
456	0.21
457	0.2
458	0.2
459	0.19
460	0.16
461	0.25
462	0.28
463	0.3
464	0.3
465	0.29
466	0.27
467	0.33
468	0.33
469	0.3
470	0.29
471	0.27
472	0.25
473	0.26
474	0.24
475	0.19
476	0.21
477	0.15
478	0.14
479	0.13
480	0.14
481	0.11
482	0.12
483	0.12
484	0.09
485	0.09
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.12
492	0.13
493	0.16
494	0.16
495	0.19
496	0.19
497	0.22
498	0.22
499	0.19
500	0.23
501	0.21
502	0.22
503	0.25
504	0.26
505	0.26
506	0.27
507	0.26
508	0.22
509	0.23
510	0.22
511	0.17
512	0.19
513	0.17
514	0.16
515	0.15
516	0.15
517	0.13
518	0.11
519	0.1
520	0.08
521	0.08
522	0.07
523	0.09
524	0.12
525	0.16
526	0.24
527	0.31
528	0.37
529	0.46
530	0.54
531	0.63
532	0.71
533	0.77
534	0.8
535	0.85
536	0.85
537	0.85
538	0.84
539	0.83
540	0.84
541	0.84
542	0.85
543	0.86
544	0.91
545	0.91
546	0.92
547	0.93
548	0.93
549	0.93
550	0.92
551	0.91
552	0.91
553	0.89
554	0.85
555	0.84
556	0.74
557	0.71
558	0.65
559	0.57
560	0.51
561	0.44
562	0.42
563	0.38
564	0.38
565	0.31
566	0.3
567	0.28
568	0.25
569	0.26
570	0.23
571	0.23
572	0.3
573	0.34
574	0.39
575	0.44
576	0.52
577	0.62
578	0.7
579	0.75
580	0.77
581	0.83
582	0.86
583	0.91
584	0.92
585	0.92
586	0.93
587	0.92
588	0.92
589	0.92
590	0.87
591	0.82
592	0.73
593	0.68
594	0.58
595	0.49
596	0.39
597	0.29
598	0.27
599	0.24
600	0.22
601	0.17
602	0.18
603	0.22
604	0.32
605	0.42
606	0.48
607	0.55
608	0.65
609	0.75
610	0.84

C5M8S8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer