Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MH60

Protein Details
Accession C5MH60    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-330VQNSGPFRKKKNYKRNSMILKDHydrophilic
459-484NNNNHGKQAKRRSTYNPNNNSKRNSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031398  She3  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048309  P:endoplasmic reticulum inheritance  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG ctp:CTRG_05414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17078  SHE3  
Amino Acid Sequences MPDTPVSPSKNNVKTSSTPVSSSTKVIDSLHSKIDELTDELTTLKQSHQELTKKHSIVAKKNDSFVDQLANAKHENDMLSALLKRKERRILDLEDQYNDLNSQIENLSLSNKNMKIRCENLQNNSNASIAEFERLKISYDALIASQMEYKNHYQQELNTLQTSFDKYRTENTKRYEDLQSSISSNDKDIDTLLDSLTNKRKTMDNIYVNKNNKILQLLTSLASLIKLHAEDTKGQVEQNVDVIKILMEKYPDLQEKILEKEKVEVDLDEIISHSNEILANTSFEEDATLINSPDLDSQSNLNSGAATPVQNSGPFRKKKNYKRNSMILKDSPSGIPENSVPSSLPKKPQVNNNIINIPKNRSKFNTPPTTPRQFSNQSTDFEVTHQWNGNNNQHNNSGHYNNNNHRRTTSYDARSDNGGNRRQHSQGSNYNNNNNNNNNNNNGFVRRSGSVRNGSNNNNNNNHGKQAKRRSTYNPNNNSKRNSQIFDSNFALNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.61
4 0.53
5 0.47
6 0.46
7 0.47
8 0.43
9 0.41
10 0.35
11 0.29
12 0.28
13 0.28
14 0.3
15 0.29
16 0.3
17 0.34
18 0.31
19 0.3
20 0.28
21 0.29
22 0.24
23 0.22
24 0.2
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.17
33 0.18
34 0.24
35 0.31
36 0.38
37 0.4
38 0.48
39 0.55
40 0.5
41 0.52
42 0.53
43 0.53
44 0.56
45 0.62
46 0.64
47 0.58
48 0.62
49 0.6
50 0.56
51 0.5
52 0.41
53 0.36
54 0.26
55 0.28
56 0.25
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.18
62 0.18
63 0.14
64 0.14
65 0.11
66 0.13
67 0.15
68 0.19
69 0.23
70 0.28
71 0.32
72 0.38
73 0.46
74 0.47
75 0.52
76 0.54
77 0.56
78 0.59
79 0.63
80 0.59
81 0.51
82 0.49
83 0.42
84 0.36
85 0.28
86 0.2
87 0.12
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.21
98 0.24
99 0.3
100 0.32
101 0.36
102 0.38
103 0.41
104 0.46
105 0.49
106 0.53
107 0.53
108 0.57
109 0.55
110 0.51
111 0.48
112 0.41
113 0.31
114 0.25
115 0.2
116 0.13
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.15
136 0.18
137 0.24
138 0.25
139 0.26
140 0.23
141 0.24
142 0.31
143 0.31
144 0.3
145 0.25
146 0.24
147 0.23
148 0.23
149 0.26
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.27
155 0.35
156 0.41
157 0.43
158 0.47
159 0.51
160 0.5
161 0.53
162 0.51
163 0.43
164 0.39
165 0.34
166 0.3
167 0.24
168 0.23
169 0.21
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.15
183 0.23
184 0.23
185 0.22
186 0.23
187 0.26
188 0.28
189 0.34
190 0.39
191 0.4
192 0.44
193 0.5
194 0.56
195 0.56
196 0.54
197 0.48
198 0.41
199 0.33
200 0.29
201 0.22
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.09
218 0.12
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.14
226 0.12
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.17
243 0.21
244 0.24
245 0.21
246 0.2
247 0.22
248 0.22
249 0.21
250 0.2
251 0.15
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.13
299 0.19
300 0.27
301 0.32
302 0.36
303 0.45
304 0.55
305 0.64
306 0.73
307 0.76
308 0.78
309 0.81
310 0.85
311 0.85
312 0.8
313 0.76
314 0.69
315 0.64
316 0.54
317 0.47
318 0.38
319 0.3
320 0.27
321 0.19
322 0.16
323 0.13
324 0.16
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.16
329 0.22
330 0.25
331 0.3
332 0.33
333 0.4
334 0.44
335 0.53
336 0.57
337 0.6
338 0.62
339 0.6
340 0.58
341 0.53
342 0.53
343 0.47
344 0.44
345 0.42
346 0.39
347 0.4
348 0.39
349 0.46
350 0.49
351 0.56
352 0.61
353 0.58
354 0.64
355 0.68
356 0.72
357 0.65
358 0.58
359 0.57
360 0.52
361 0.53
362 0.53
363 0.49
364 0.42
365 0.45
366 0.44
367 0.36
368 0.31
369 0.32
370 0.25
371 0.25
372 0.26
373 0.23
374 0.28
375 0.34
376 0.41
377 0.45
378 0.45
379 0.45
380 0.47
381 0.47
382 0.46
383 0.44
384 0.4
385 0.36
386 0.4
387 0.45
388 0.49
389 0.58
390 0.57
391 0.54
392 0.52
393 0.51
394 0.51
395 0.52
396 0.52
397 0.49
398 0.52
399 0.53
400 0.53
401 0.52
402 0.48
403 0.47
404 0.45
405 0.46
406 0.44
407 0.44
408 0.47
409 0.47
410 0.49
411 0.47
412 0.47
413 0.48
414 0.53
415 0.59
416 0.61
417 0.66
418 0.68
419 0.68
420 0.67
421 0.64
422 0.62
423 0.59
424 0.57
425 0.55
426 0.49
427 0.47
428 0.44
429 0.41
430 0.36
431 0.31
432 0.31
433 0.28
434 0.29
435 0.31
436 0.36
437 0.4
438 0.42
439 0.48
440 0.51
441 0.56
442 0.62
443 0.65
444 0.66
445 0.63
446 0.63
447 0.63
448 0.58
449 0.58
450 0.55
451 0.55
452 0.57
453 0.63
454 0.68
455 0.67
456 0.71
457 0.73
458 0.78
459 0.82
460 0.82
461 0.82
462 0.82
463 0.86
464 0.88
465 0.85
466 0.8
467 0.78
468 0.75
469 0.69
470 0.63
471 0.63
472 0.58
473 0.58
474 0.55