FuNGI

C5MGE2

Protein Details

Accession

C5MGE2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-69	STTTSNKKRSRESDEQSKKESKTNDIKKTKKHEDIKPVVFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
360-369	RNGKKGKTFK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0031499 C:TRAMP complex GO:0034458 F:3'-5' RNA helicase activity GO:0005524 F:ATP binding GO:0008143 F:poly(A) binding GO:0004532 F:RNA exonuclease activity GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0006397 P:mRNA processing GO:0043629 P:ncRNA polyadenylation GO:0071031 P:nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing GO:0071042 P:nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process GO:0071035 P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process GO:0071038 P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process GO:0071051 P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing GO:0000292 P:RNA fragment catabolic process GO:0034475 P:U4 snRNA 3'-end processing GO:0034476 P:U5 snRNA 3'-end processing
KEGG	ctp:CTRG_05135 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18024 DEXHc_Mtr4-like cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MDDLFDVFDEAPQTAPPKIEEIKEDIPASTTTSNKKRSRESDEQSKKESKTNDIKKTKKHEDIKPVVFDSVEIETSREVKASEGLLSKPSTSDADNKLKLRHQVRHQVAIPPSYPYIPIGEHKRKEDARTYPFVLDPFQDTAISCIDRNESVLVSAHTSAGKTVVAEYAIAQSLRDKQRVIYTSPIKALSNQKYRELQAIFGDVGLMTGDVTINPDAGCLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEVHYMRDKSRGVVWEETIILLPDKVHYVFLSATIPNAMEFAEWIVKIHNQPCHVVYTDFRPTPLQHYLFPAGGDGIHLVVDEKGTFREENFQKAMATIGDNTGDDPASADKSRNGKKGKTFKGGNKDGKSDIYKIVKMIYMKKYNPVIVFSFSKRECESLALKMSKLDFNTDEEREALVKIFNNAIELLPENDRELPQIKNILPLLKRGIGIHHSGLLPILKEIIEILFQEGFLKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTSVRKWDGVGFRWVSGGEYIQMSGRAGRRGLDDRGIVIMMIDEKMEPQVAKGMVKGQADRLDSAFHLGYNMIVNLMRVEGISPEFMLENSFFQFQKAASVPVMEDKMLTYKKELEDIHINDEGIIKEYYELQQQLDKYNSDVQKVITHPGNSLPFLQDGRVIKVKIGNQDYGWGMVTTFVKRNRKSQQEEFTPHEAYVVEVFITSMFIDSPVNLIKKFNPLLPEGIRPAKSGEQTRAEFISITLDSIEKISTVRLRVPDDYKSSTAKRTLVKTLKDLPKKLPDGIPLIDPVGSMKITDEDFKKLLNKIDILESKISANPLHNSARLKDLYEQYSYKVKLETQIKQLKEKIFQAEAVVQLEQLGNMKRVLKKLELTGPNDIVELKGRVAAEISTGDELMITELLFSGFFNDLTPQQICGLLSCFIFQERAKELPKLKPELAEPAKFIHETASKIAKISKNCNLEIVEKDYVESFNLALVEVVFAWSNNASFSSICKMTDIYEGSIIRALRREIELLKQLVDAAKIIGNQELVDKFDKCTELLNRDFVQVSSLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.16
3	0.16
4	0.21
5	0.24
6	0.27
7	0.28
8	0.33
9	0.35
10	0.39
11	0.38
12	0.32
13	0.31
14	0.29
15	0.29
16	0.26
17	0.27
18	0.31
19	0.39
20	0.49
21	0.54
22	0.6
23	0.66
24	0.7
25	0.75
26	0.77
27	0.77
28	0.79
29	0.83
30	0.82
31	0.79
32	0.79
33	0.71
34	0.67
35	0.63
36	0.61
37	0.61
38	0.66
39	0.69
40	0.72
41	0.77
42	0.8
43	0.86
44	0.87
45	0.86
46	0.85
47	0.84
48	0.84
49	0.86
50	0.84
51	0.79
52	0.71
53	0.61
54	0.52
55	0.43
56	0.34
57	0.27
58	0.21
59	0.16
60	0.15
61	0.15
62	0.17
63	0.17
64	0.15
65	0.12
66	0.12
67	0.14
68	0.15
69	0.18
70	0.19
71	0.2
72	0.23
73	0.24
74	0.23
75	0.21
76	0.21
77	0.19
78	0.19
79	0.25
80	0.3
81	0.38
82	0.44
83	0.47
84	0.5
85	0.53
86	0.59
87	0.6
88	0.61
89	0.6
90	0.65
91	0.68
92	0.72
93	0.7
94	0.68
95	0.64
96	0.59
97	0.51
98	0.44
99	0.39
100	0.31
101	0.29
102	0.22
103	0.21
104	0.19
105	0.25
106	0.31
107	0.4
108	0.44
109	0.46
110	0.54
111	0.56
112	0.59
113	0.61
114	0.6
115	0.58
116	0.59
117	0.59
118	0.53
119	0.51
120	0.46
121	0.39
122	0.31
123	0.28
124	0.23
125	0.21
126	0.19
127	0.17
128	0.17
129	0.19
130	0.19
131	0.15
132	0.15
133	0.16
134	0.16
135	0.17
136	0.17
137	0.13
138	0.13
139	0.15
140	0.14
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.11
156	0.12
157	0.12
158	0.11
159	0.12
160	0.21
161	0.26
162	0.28
163	0.27
164	0.27
165	0.36
166	0.39
167	0.4
168	0.41
169	0.41
170	0.43
171	0.45
172	0.45
173	0.37
174	0.4
175	0.46
176	0.46
177	0.49
178	0.48
179	0.51
180	0.53
181	0.54
182	0.56
183	0.47
184	0.4
185	0.32
186	0.32
187	0.26
188	0.21
189	0.2
190	0.12
191	0.11
192	0.09
193	0.06
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.13
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.12
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.09
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.11
235	0.1
236	0.12
237	0.13
238	0.14
239	0.14
240	0.18
241	0.19
242	0.18
243	0.22
244	0.25
245	0.28
246	0.3
247	0.3
248	0.27
249	0.27
250	0.25
251	0.21
252	0.16
253	0.12
254	0.09
255	0.08
256	0.07
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.13
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.09
270	0.09
271	0.08
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.12
280	0.16
281	0.2
282	0.22
283	0.22
284	0.24
285	0.25
286	0.27
287	0.26
288	0.23
289	0.2
290	0.23
291	0.29
292	0.27
293	0.26
294	0.26
295	0.25
296	0.3
297	0.36
298	0.31
299	0.26
300	0.3
301	0.31
302	0.3
303	0.28
304	0.23
305	0.15
306	0.13
307	0.12
308	0.07
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.18
322	0.2
323	0.25
324	0.26
325	0.26
326	0.24
327	0.24
328	0.24
329	0.15
330	0.14
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.15
345	0.23
346	0.29
347	0.36
348	0.4
349	0.42
350	0.51
351	0.61
352	0.64
353	0.64
354	0.65
355	0.65
356	0.71
357	0.75
358	0.74
359	0.67
360	0.62
361	0.55
362	0.52
363	0.48
364	0.4
365	0.36
366	0.31
367	0.29
368	0.26
369	0.26
370	0.24
371	0.24
372	0.29
373	0.31
374	0.34
375	0.34
376	0.39
377	0.41
378	0.42
379	0.4
380	0.36
381	0.29
382	0.26
383	0.29
384	0.24
385	0.28
386	0.25
387	0.27
388	0.25
389	0.24
390	0.21
391	0.22
392	0.22
393	0.2
394	0.26
395	0.24
396	0.23
397	0.24
398	0.25
399	0.23
400	0.21
401	0.2
402	0.15
403	0.18
404	0.22
405	0.21
406	0.2
407	0.19
408	0.19
409	0.16
410	0.16
411	0.12
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.11
429	0.12
430	0.11
431	0.12
432	0.16
433	0.16
434	0.18
435	0.19
436	0.22
437	0.21
438	0.23
439	0.24
440	0.21
441	0.21
442	0.18
443	0.19
444	0.17
445	0.18
446	0.17
447	0.16
448	0.14
449	0.13
450	0.14
451	0.12
452	0.09
453	0.07
454	0.07
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.05
474	0.05
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.09
481	0.1
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.1
491	0.13
492	0.19
493	0.2
494	0.19
495	0.19
496	0.21
497	0.22
498	0.23
499	0.25
500	0.2
501	0.19
502	0.2
503	0.19
504	0.16
505	0.13
506	0.11
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.05
513	0.08
514	0.09
515	0.1
516	0.1
517	0.11
518	0.14
519	0.17
520	0.18
521	0.17
522	0.16
523	0.15
524	0.15
525	0.14
526	0.11
527	0.08
528	0.06
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.03
533	0.04
534	0.04
535	0.05
536	0.04
537	0.04
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.11
543	0.15
544	0.16
545	0.16
546	0.15
547	0.19
548	0.19
549	0.19
550	0.17
551	0.14
552	0.13
553	0.15
554	0.13
555	0.08
556	0.08
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.04
565	0.05
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.07
580	0.09
581	0.09
582	0.09
583	0.1
584	0.09
585	0.12
586	0.12
587	0.12
588	0.1
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.13
593	0.09
594	0.08
595	0.07
596	0.12
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.16
601	0.16
602	0.22
603	0.22
604	0.21
605	0.27
606	0.28
607	0.3
608	0.27
609	0.27
610	0.22
611	0.23
612	0.19
613	0.14
614	0.12
615	0.08
616	0.08
617	0.09
618	0.1
619	0.11
620	0.12
621	0.1
622	0.13
623	0.14
624	0.17
625	0.18
626	0.17
627	0.16
628	0.23
629	0.23
630	0.22
631	0.22
632	0.2
633	0.22
634	0.23
635	0.25
636	0.21
637	0.2
638	0.2
639	0.23
640	0.23
641	0.2
642	0.2
643	0.17
644	0.15
645	0.15
646	0.15
647	0.15
648	0.15
649	0.18
650	0.21
651	0.2
652	0.19
653	0.23
654	0.26
655	0.29
656	0.3
657	0.28
658	0.24
659	0.26
660	0.26
661	0.22
662	0.2
663	0.12
664	0.09
665	0.1
666	0.12
667	0.11
668	0.16
669	0.22
670	0.3
671	0.32
672	0.41
673	0.47
674	0.55
675	0.61
676	0.65
677	0.67
678	0.67
679	0.7
680	0.68
681	0.63
682	0.55
683	0.47
684	0.39
685	0.29
686	0.21
687	0.17
688	0.11
689	0.07
690	0.06
691	0.06
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.04
696	0.04
697	0.04
698	0.05
699	0.05
700	0.06
701	0.1
702	0.11
703	0.11
704	0.13
705	0.14
706	0.2
707	0.22
708	0.22
709	0.21
710	0.22
711	0.26
712	0.27
713	0.29
714	0.27
715	0.3
716	0.29
717	0.27
718	0.28
719	0.27
720	0.3
721	0.3
722	0.32
723	0.33
724	0.34
725	0.35
726	0.33
727	0.3
728	0.25
729	0.21
730	0.2
731	0.13
732	0.12
733	0.1
734	0.09
735	0.09
736	0.1
737	0.09
738	0.06
739	0.06
740	0.08
741	0.11
742	0.13
743	0.16
744	0.19
745	0.23
746	0.27
747	0.3
748	0.32
749	0.35
750	0.37
751	0.36
752	0.37
753	0.37
754	0.37
755	0.38
756	0.38
757	0.37
758	0.37
759	0.45
760	0.47
761	0.47
762	0.48
763	0.54
764	0.59
765	0.61
766	0.6
767	0.57
768	0.59
769	0.59
770	0.57
771	0.5
772	0.45
773	0.42
774	0.39
775	0.34
776	0.26
777	0.23
778	0.2
779	0.16
780	0.13
781	0.11
782	0.09
783	0.08
784	0.07
785	0.09
786	0.1
787	0.14
788	0.15
789	0.18
790	0.18
791	0.2
792	0.24
793	0.25
794	0.28
795	0.28
796	0.27
797	0.24
798	0.32
799	0.32
800	0.32
801	0.3
802	0.26
803	0.24
804	0.24
805	0.24
806	0.18
807	0.18
808	0.17
809	0.21
810	0.23
811	0.26
812	0.27
813	0.27
814	0.32
815	0.3
816	0.3
817	0.31
818	0.34
819	0.33
820	0.35
821	0.34
822	0.31
823	0.37
824	0.36
825	0.32
826	0.28
827	0.26
828	0.3
829	0.36
830	0.39
831	0.42
832	0.48
833	0.49
834	0.54
835	0.59
836	0.55
837	0.53
838	0.52
839	0.47
840	0.42
841	0.4
842	0.36
843	0.33
844	0.3
845	0.26
846	0.22
847	0.16
848	0.15
849	0.14
850	0.12
851	0.12
852	0.12
853	0.12
854	0.14
855	0.2
856	0.22
857	0.26
858	0.3
859	0.31
860	0.33
861	0.37
862	0.44
863	0.45
864	0.46
865	0.48
866	0.45
867	0.41
868	0.38
869	0.32
870	0.24
871	0.21
872	0.18
873	0.12
874	0.14
875	0.13
876	0.13
877	0.14
878	0.13
879	0.11
880	0.11
881	0.12
882	0.1
883	0.1
884	0.1
885	0.09
886	0.09
887	0.08
888	0.07
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.05
893	0.05
894	0.05
895	0.07
896	0.07
897	0.07
898	0.08
899	0.1
900	0.11
901	0.15
902	0.16
903	0.14
904	0.15
905	0.16
906	0.16
907	0.15
908	0.16
909	0.14
910	0.14
911	0.13
912	0.13
913	0.12
914	0.16
915	0.15
916	0.18
917	0.2
918	0.26
919	0.29
920	0.35
921	0.39
922	0.44
923	0.51
924	0.53
925	0.51
926	0.48
927	0.47
928	0.52
929	0.53
930	0.47
931	0.41
932	0.37
933	0.38
934	0.35
935	0.33
936	0.28
937	0.25
938	0.25
939	0.29
940	0.32
941	0.3
942	0.31
943	0.38
944	0.37
945	0.4
946	0.46
947	0.49
948	0.48
949	0.48
950	0.51
951	0.47
952	0.46
953	0.43
954	0.42
955	0.36
956	0.3
957	0.3
958	0.27
959	0.25
960	0.22
961	0.19
962	0.12
963	0.11
964	0.11
965	0.1
966	0.09
967	0.08
968	0.08
969	0.07
970	0.08
971	0.06
972	0.06
973	0.08
974	0.08
975	0.08
976	0.09
977	0.1
978	0.1
979	0.1
980	0.13
981	0.18
982	0.19
983	0.19
984	0.19
985	0.19
986	0.2
987	0.26
988	0.26
989	0.22
990	0.26
991	0.26
992	0.26
993	0.29
994	0.27
995	0.23
996	0.24
997	0.23
998	0.21
999	0.23
1000	0.26
1001	0.25
1002	0.31
1003	0.36
1004	0.34
1005	0.34
1006	0.31
1007	0.3
1008	0.28
1009	0.26
1010	0.2
1011	0.14
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.15
1015	0.15
1016	0.14
1017	0.14
1018	0.18
1019	0.17
1020	0.18
1021	0.21
1022	0.21
1023	0.21
1024	0.26
1025	0.27
1026	0.22
1027	0.29
1028	0.33
1029	0.37
1030	0.4
1031	0.45
1032	0.41
1033	0.43
1034	0.44
1035	0.36
1036	0.31

C5MGE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer