Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6IFW3

Protein Details
Accession A0A5N6IFW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-325ARLGKGAQKKPKWQNKHSKNRLKQNGDTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-264IRRAKEAAEKREADRK
301-316KGAQKKPKWQNKHSKN
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSGTQPRPKRAGEDFTRTHQHPEDDPNEPSGKKARFDLRNPSALAPDALEDDAVLDADEIGRRGQQVRRKAVNLDGYDSDSENEGFDARAEALAKKKQKEDAADDDDMFAELQEDFGAEEVDADEALGKNKKSVRFLRDDEIEGQVASSKGGGTLHADLTKGPDEVDDDDEAESESDVADEDRAMVDEDMDKELGAGSKKKHAPLLDAFNMRTEQEEGKFDDQGNYIRKAADPDAIYDSWLDGVSKKDIRRAKEAAEKREADRKEKDRMDDSVLTGDALKTLITHLDRGETILEALARLGKGAQKKPKWQNKHSKNRLKQNGDTGDTEMTEDDPKEVARKQAIDAITGAADILMTRGQADIYDTERELLTRQYRRETGENWVDPPSQDTDPVSSEQAPAMWEFRWSDARDGGIVHGPYDGTTMESWKNAGYFGEGVEFRRTTDEGGWNSQASFVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.67
4 0.61
5 0.6
6 0.54
7 0.51
8 0.46
9 0.51
10 0.49
11 0.46
12 0.46
13 0.45
14 0.45
15 0.4
16 0.39
17 0.39
18 0.38
19 0.35
20 0.41
21 0.46
22 0.5
23 0.57
24 0.64
25 0.62
26 0.64
27 0.64
28 0.58
29 0.51
30 0.43
31 0.38
32 0.27
33 0.21
34 0.17
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.06
42 0.04
43 0.04
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.11
50 0.15
51 0.22
52 0.28
53 0.37
54 0.46
55 0.53
56 0.54
57 0.56
58 0.58
59 0.6
60 0.54
61 0.49
62 0.41
63 0.37
64 0.35
65 0.33
66 0.26
67 0.19
68 0.17
69 0.13
70 0.12
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.09
77 0.1
78 0.12
79 0.18
80 0.25
81 0.32
82 0.34
83 0.38
84 0.43
85 0.47
86 0.51
87 0.52
88 0.53
89 0.53
90 0.51
91 0.47
92 0.42
93 0.36
94 0.3
95 0.23
96 0.14
97 0.08
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.08
114 0.12
115 0.11
116 0.16
117 0.21
118 0.25
119 0.31
120 0.39
121 0.43
122 0.47
123 0.51
124 0.53
125 0.52
126 0.5
127 0.44
128 0.39
129 0.32
130 0.24
131 0.2
132 0.16
133 0.12
134 0.1
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.14
147 0.15
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.14
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.09
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.19
186 0.22
187 0.23
188 0.26
189 0.25
190 0.28
191 0.3
192 0.36
193 0.34
194 0.33
195 0.32
196 0.3
197 0.3
198 0.25
199 0.21
200 0.16
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.14
225 0.13
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.05
230 0.07
231 0.1
232 0.14
233 0.15
234 0.21
235 0.26
236 0.29
237 0.34
238 0.35
239 0.37
240 0.42
241 0.48
242 0.47
243 0.5
244 0.48
245 0.44
246 0.5
247 0.47
248 0.43
249 0.45
250 0.43
251 0.46
252 0.47
253 0.48
254 0.44
255 0.44
256 0.44
257 0.38
258 0.34
259 0.26
260 0.23
261 0.2
262 0.17
263 0.14
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.04
268 0.04
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.09
288 0.16
289 0.23
290 0.33
291 0.37
292 0.47
293 0.58
294 0.67
295 0.74
296 0.78
297 0.82
298 0.83
299 0.89
300 0.9
301 0.91
302 0.9
303 0.91
304 0.91
305 0.87
306 0.8
307 0.78
308 0.74
309 0.66
310 0.58
311 0.49
312 0.4
313 0.33
314 0.29
315 0.19
316 0.14
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.13
323 0.14
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.26
329 0.26
330 0.24
331 0.23
332 0.19
333 0.15
334 0.14
335 0.12
336 0.06
337 0.06
338 0.04
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.07
347 0.08
348 0.11
349 0.13
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.15
354 0.14
355 0.19
356 0.25
357 0.29
358 0.33
359 0.38
360 0.42
361 0.47
362 0.5
363 0.46
364 0.46
365 0.5
366 0.48
367 0.44
368 0.44
369 0.4
370 0.35
371 0.35
372 0.31
373 0.22
374 0.21
375 0.2
376 0.19
377 0.21
378 0.23
379 0.23
380 0.19
381 0.19
382 0.18
383 0.17
384 0.16
385 0.14
386 0.14
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.17
391 0.23
392 0.24
393 0.26
394 0.27
395 0.28
396 0.26
397 0.25
398 0.24
399 0.23
400 0.22
401 0.18
402 0.17
403 0.15
404 0.15
405 0.15
406 0.13
407 0.09
408 0.1
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.16
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.18
421 0.17
422 0.2
423 0.25
424 0.25
425 0.22
426 0.26
427 0.26
428 0.23
429 0.28
430 0.33
431 0.32
432 0.38
433 0.39
434 0.36
435 0.36