FuNGI

C5MBW8

Protein Details

Accession

C5MBW8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-88	ETIKSRKISKDAKKLAKQLKNKRYKNGKSDPWSHHS	Hydrophilic
391-413	IHSYDKFKWYKKKVFRGHQVAGY	Hydrophilic
436-461	YFWDWKTCKLVKKLKLCDKPVKCIVF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
57-79	SRKISKDAKKLAKQLKNKRYKNG

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032847 PRPF17 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0034399 C:nuclear periphery GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0000386 F:second spliceosomal transesterification activity GO:0000350 P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step GO:0000389 P:mRNA 3'-splice site recognition GO:0000348 P:mRNA branch site recognition
KEGG	ctp:CTRG_03560 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MSIVQGYTSSEDESDLQEEEQQQHTIIEPPTKKVKTFSGEFQSLPITNLHDDETIKSRKISKDAKKLAKQLKNKRYKNGKSDPWSHHSSSNEEDDDQQPLIKEQQQEVVVEVEEKEESSSSDPLFEPSSEYVGSEEFDYQGRTYMNIPKYLSIDLTLPSGTNNECFVPKKIIHKFPGHSKGVNKLQFFPNSGHLLLSCGNDGLIKLWSIYGRSKDDNEDDDKKYELLRIFKGHTMAVKDIKFNSKGDKFLSCGYDKRIHLWDTKTGNVLKTINVKAIPNVLLFNPKNEDEFIVGLNNFKIEHYKFSSIQYRIPIQIYDHHQGGIIDLVNLKNSNLFISSSDDKTVRFWKWQINIPEKVITDPSQHSLPSIQPHPMARYIALQSMDNSVKVIHSYDKFKWYKKKVFRGHQVAGYGIEIGFSPDGKIIMSGDSKGSAYFWDWKTCKLVKKLKLCDKPVKCIVFHPQESSKVAVAGSSGEIYYCD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.15
3	0.14
4	0.17
5	0.2
6	0.22
7	0.24
8	0.22
9	0.21
10	0.2
11	0.21
12	0.24
13	0.24
14	0.29
15	0.28
16	0.33
17	0.43
18	0.45
19	0.45
20	0.44
21	0.48
22	0.47
23	0.49
24	0.52
25	0.51
26	0.51
27	0.5
28	0.47
29	0.43
30	0.37
31	0.33
32	0.26
33	0.21
34	0.19
35	0.19
36	0.2
37	0.18
38	0.18
39	0.2
40	0.26
41	0.28
42	0.28
43	0.3
44	0.35
45	0.38
46	0.46
47	0.53
48	0.56
49	0.62
50	0.71
51	0.78
52	0.8
53	0.85
54	0.86
55	0.85
56	0.85
57	0.85
58	0.85
59	0.86
60	0.85
61	0.85
62	0.86
63	0.86
64	0.86
65	0.85
66	0.84
67	0.82
68	0.85
69	0.82
70	0.77
71	0.74
72	0.66
73	0.61
74	0.53
75	0.5
76	0.44
77	0.42
78	0.37
79	0.31
80	0.32
81	0.28
82	0.28
83	0.24
84	0.21
85	0.16
86	0.16
87	0.19
88	0.2
89	0.22
90	0.21
91	0.26
92	0.26
93	0.26
94	0.26
95	0.23
96	0.18
97	0.16
98	0.15
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.08
103	0.07
104	0.08
105	0.1
106	0.12
107	0.11
108	0.14
109	0.14
110	0.15
111	0.16
112	0.15
113	0.16
114	0.14
115	0.16
116	0.14
117	0.14
118	0.13
119	0.11
120	0.12
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.09
125	0.1
126	0.09
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.14
131	0.21
132	0.23
133	0.26
134	0.26
135	0.26
136	0.27
137	0.27
138	0.24
139	0.17
140	0.16
141	0.12
142	0.13
143	0.11
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.12
152	0.14
153	0.16
154	0.2
155	0.22
156	0.3
157	0.37
158	0.43
159	0.47
160	0.51
161	0.52
162	0.56
163	0.62
164	0.56
165	0.52
166	0.46
167	0.49
168	0.52
169	0.53
170	0.45
171	0.4
172	0.42
173	0.41
174	0.41
175	0.34
176	0.3
177	0.27
178	0.26
179	0.22
180	0.17
181	0.17
182	0.16
183	0.15
184	0.11
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.07
195	0.09
196	0.11
197	0.14
198	0.17
199	0.18
200	0.2
201	0.22
202	0.24
203	0.25
204	0.28
205	0.3
206	0.28
207	0.27
208	0.27
209	0.24
210	0.22
211	0.23
212	0.2
213	0.18
214	0.19
215	0.2
216	0.21
217	0.23
218	0.23
219	0.2
220	0.19
221	0.18
222	0.18
223	0.2
224	0.19
225	0.19
226	0.2
227	0.23
228	0.22
229	0.21
230	0.25
231	0.23
232	0.24
233	0.24
234	0.24
235	0.22
236	0.23
237	0.25
238	0.2
239	0.2
240	0.23
241	0.28
242	0.27
243	0.28
244	0.3
245	0.28
246	0.31
247	0.31
248	0.34
249	0.29
250	0.3
251	0.3
252	0.28
253	0.26
254	0.25
255	0.23
256	0.18
257	0.22
258	0.21
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.18
263	0.19
264	0.18
265	0.13
266	0.13
267	0.11
268	0.18
269	0.18
270	0.19
271	0.19
272	0.19
273	0.19
274	0.19
275	0.19
276	0.13
277	0.13
278	0.12
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.11
287	0.1
288	0.15
289	0.19
290	0.23
291	0.24
292	0.28
293	0.36
294	0.33
295	0.36
296	0.35
297	0.33
298	0.31
299	0.31
300	0.27
301	0.2
302	0.25
303	0.28
304	0.27
305	0.25
306	0.23
307	0.23
308	0.22
309	0.21
310	0.16
311	0.1
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.15
325	0.18
326	0.18
327	0.2
328	0.2
329	0.2
330	0.23
331	0.27
332	0.24
333	0.25
334	0.28
335	0.33
336	0.37
337	0.44
338	0.49
339	0.51
340	0.52
341	0.5
342	0.51
343	0.44
344	0.41
345	0.36
346	0.29
347	0.26
348	0.24
349	0.25
350	0.22
351	0.22
352	0.21
353	0.2
354	0.21
355	0.23
356	0.23
357	0.23
358	0.24
359	0.27
360	0.29
361	0.3
362	0.28
363	0.23
364	0.25
365	0.24
366	0.25
367	0.23
368	0.21
369	0.19
370	0.23
371	0.23
372	0.19
373	0.18
374	0.14
375	0.14
376	0.14
377	0.15
378	0.15
379	0.18
380	0.24
381	0.28
382	0.38
383	0.42
384	0.49
385	0.58
386	0.62
387	0.68
388	0.72
389	0.8
390	0.8
391	0.85
392	0.89
393	0.88
394	0.83
395	0.77
396	0.68
397	0.59
398	0.49
399	0.39
400	0.29
401	0.19
402	0.14
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.14
418	0.14
419	0.14
420	0.14
421	0.12
422	0.13
423	0.21
424	0.23
425	0.31
426	0.32
427	0.35
428	0.43
429	0.47
430	0.52
431	0.54
432	0.61
433	0.61
434	0.7
435	0.78
436	0.81
437	0.85
438	0.85
439	0.86
440	0.82
441	0.82
442	0.81
443	0.75
444	0.65
445	0.61
446	0.63
447	0.62
448	0.58
449	0.56
450	0.52
451	0.53
452	0.54
453	0.51
454	0.42
455	0.33
456	0.3
457	0.23
458	0.19
459	0.15
460	0.14
461	0.12
462	0.1

C5MBW8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer