Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6E0

Protein Details
Accession C5M6E0    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-357HQEPPKVEFKKRGRKERRRRDDGRSVPLSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-348EFKKRGRKERRRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002716  PIN_dom  
KEGG ctp:CTRG_01421  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
Amino Acid Sequences MSIDLSSDESDDYFKDELLEPSGKFTPDFGSPTVRQVRLILDHTAFVRGIGNIKRWFNEEYITRNTTRTDEIIKLNIYVPSYTLHEFDFVKKGTSITATNAREAIRFIDNYLENEVESNSKKIIYDLSLESPQDKTPSWNKCLKYKVHSPKIKEFPNYKTKFDSSLIGQAPVSGHPSDENELDFIESFDNTLSLQQNKKLNDIQYENSNSYQNAAANSDNLAEMPVRLRYLIRTCVYKRFIENTKPKATNELEEWKLVTEDSIAKTWAKSFGIDCVNVNEAELLIFQNYDVNSFRLYNPYANDRDNFDPSTNILQNTIDTTLYSYSTAHQEPPKVEFKKRGRKERRRRDDGRSVPLSTEAVVHSAKNDTGSGVIKKEKFGAINYAPRGQGQLWRPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.16
4 0.17
5 0.22
6 0.25
7 0.21
8 0.26
9 0.29
10 0.27
11 0.25
12 0.24
13 0.22
14 0.22
15 0.25
16 0.22
17 0.27
18 0.28
19 0.36
20 0.43
21 0.4
22 0.37
23 0.36
24 0.38
25 0.36
26 0.38
27 0.34
28 0.27
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.23
33 0.19
34 0.17
35 0.13
36 0.19
37 0.2
38 0.26
39 0.3
40 0.33
41 0.34
42 0.35
43 0.37
44 0.33
45 0.34
46 0.31
47 0.32
48 0.36
49 0.38
50 0.36
51 0.35
52 0.36
53 0.33
54 0.32
55 0.29
56 0.26
57 0.27
58 0.29
59 0.31
60 0.3
61 0.29
62 0.27
63 0.26
64 0.23
65 0.19
66 0.16
67 0.14
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.19
75 0.23
76 0.2
77 0.21
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.21
82 0.19
83 0.18
84 0.26
85 0.25
86 0.26
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.23
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.19
96 0.2
97 0.21
98 0.22
99 0.19
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.18
115 0.2
116 0.2
117 0.21
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.17
123 0.23
124 0.3
125 0.34
126 0.4
127 0.41
128 0.46
129 0.52
130 0.53
131 0.51
132 0.55
133 0.61
134 0.64
135 0.68
136 0.67
137 0.7
138 0.73
139 0.71
140 0.67
141 0.62
142 0.59
143 0.64
144 0.61
145 0.54
146 0.5
147 0.46
148 0.43
149 0.39
150 0.34
151 0.25
152 0.29
153 0.27
154 0.23
155 0.22
156 0.19
157 0.18
158 0.16
159 0.16
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.07
179 0.08
180 0.11
181 0.12
182 0.17
183 0.22
184 0.23
185 0.26
186 0.27
187 0.27
188 0.28
189 0.3
190 0.27
191 0.27
192 0.29
193 0.28
194 0.26
195 0.25
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.13
218 0.19
219 0.2
220 0.25
221 0.27
222 0.35
223 0.38
224 0.36
225 0.36
226 0.36
227 0.4
228 0.44
229 0.51
230 0.5
231 0.55
232 0.55
233 0.53
234 0.54
235 0.5
236 0.43
237 0.39
238 0.38
239 0.31
240 0.3
241 0.3
242 0.23
243 0.21
244 0.18
245 0.13
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.16
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.2
262 0.19
263 0.2
264 0.18
265 0.18
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.14
281 0.15
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.22
286 0.27
287 0.29
288 0.3
289 0.31
290 0.32
291 0.34
292 0.34
293 0.34
294 0.28
295 0.25
296 0.25
297 0.31
298 0.28
299 0.25
300 0.22
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.2
305 0.13
306 0.1
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.16
314 0.18
315 0.21
316 0.24
317 0.28
318 0.29
319 0.35
320 0.42
321 0.42
322 0.46
323 0.51
324 0.57
325 0.64
326 0.72
327 0.78
328 0.8
329 0.86
330 0.93
331 0.94
332 0.95
333 0.94
334 0.92
335 0.9
336 0.9
337 0.87
338 0.86
339 0.79
340 0.7
341 0.6
342 0.55
343 0.46
344 0.35
345 0.28
346 0.19
347 0.17
348 0.16
349 0.15
350 0.14
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.15
357 0.19
358 0.21
359 0.23
360 0.3
361 0.3
362 0.32
363 0.35
364 0.36
365 0.34
366 0.34
367 0.38
368 0.38
369 0.45
370 0.47
371 0.48
372 0.44
373 0.42
374 0.43
375 0.36
376 0.36