Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M5G1

Protein Details
Accession C5M5G1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-35LSNEINQKRKKVVTKKRRKLTPAAASPTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-26KRKKVVTKKRRKL
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0071021  C:U2-type post-spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000386  F:second spliceosomal transesterification activity  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
KEGG ctp:CTRG_01091  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFSSLLSNEINQKRKKVVTKKRRKLTPAAASPTKTESLPKEITPQETEKPQVQEELTDKQLDHKLSEFGEEDSSLSQKDKVRKLELLLQQEVRNTKYKAWLDQEAPLYRDPSKQLMTVELITDIEHNTDKVYLMLRVYIKELVKQWEECDNEDPELLLETKKNLIKLLYKLRSHKLTQSMLISLSTIVYHIQQNEFNKANESYMKLSIGNVCWPIGVVNVGIHARNASSKITGASNVSNIMLNESTRRWIISIKRLISFKERMQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.58
3 0.66
4 0.68
5 0.71
6 0.74
7 0.81
8 0.87
9 0.9
10 0.92
11 0.88
12 0.87
13 0.86
14 0.85
15 0.83
16 0.81
17 0.76
18 0.68
19 0.64
20 0.58
21 0.49
22 0.38
23 0.34
24 0.29
25 0.31
26 0.32
27 0.31
28 0.35
29 0.36
30 0.4
31 0.4
32 0.4
33 0.37
34 0.38
35 0.4
36 0.38
37 0.38
38 0.35
39 0.34
40 0.3
41 0.3
42 0.29
43 0.3
44 0.27
45 0.25
46 0.24
47 0.26
48 0.3
49 0.27
50 0.25
51 0.22
52 0.22
53 0.21
54 0.24
55 0.19
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.13
65 0.17
66 0.24
67 0.3
68 0.35
69 0.39
70 0.4
71 0.42
72 0.47
73 0.49
74 0.47
75 0.44
76 0.4
77 0.37
78 0.38
79 0.37
80 0.3
81 0.3
82 0.25
83 0.24
84 0.3
85 0.31
86 0.33
87 0.35
88 0.37
89 0.33
90 0.36
91 0.4
92 0.33
93 0.33
94 0.29
95 0.26
96 0.23
97 0.23
98 0.21
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.13
128 0.15
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.2
134 0.22
135 0.24
136 0.23
137 0.24
138 0.22
139 0.2
140 0.19
141 0.18
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.19
154 0.25
155 0.35
156 0.37
157 0.41
158 0.45
159 0.49
160 0.52
161 0.5
162 0.49
163 0.46
164 0.41
165 0.4
166 0.37
167 0.32
168 0.28
169 0.26
170 0.2
171 0.13
172 0.11
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.16
181 0.19
182 0.24
183 0.26
184 0.25
185 0.26
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.25
190 0.22
191 0.21
192 0.22
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.19
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.07
206 0.06
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.18
229 0.16
230 0.15
231 0.17
232 0.17
233 0.2
234 0.19
235 0.2
236 0.17
237 0.23
238 0.3
239 0.37
240 0.44
241 0.45
242 0.5
243 0.51
244 0.54
245 0.55
246 0.54