FuNGI

C5M3A0

Protein Details

Accession

C5M3A0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-41	TSIPTNKKKESENPKPEKKKKKKHRIYFKLSYTFYK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-30	KKKESENPKPEKKKKKKHR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 2, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014801 Mediator_Med5_fun
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	ctp:CTRG_00539 -
Pfam	View protein in Pfam PF08689 Med5

Amino Acid Sequences

MGFPPTSIPTNKKKESENPKPEKKKKKKHRIYFKLSYTFYKKHISMTEQVLSLSKLIEKAANQKLQPKLFISLFNQFSKRKQLQNSEYVNELLNIKPDNNSLKQRKWNEYQLNVVIELSFSSIENSHMFWSNLHQANDSFQCAYLLKLSRALVGVQHFDRDVLKNFISVEFMEYVHKYIQREKLSDKVLEHTVFLLSVIVQKFDKFIEEKTSGTVQDFIVKLIPFLRSVTGNENLSSMLLLKTKHILSKAQIDQLESTQHIRMERQGSIISLNPSIHANVASLTMINKLDEYYFRMRYIWIHKLFCHFNYNDTLNFFISNLVIASNQKNSYLIAYDFIKTVFTGMDMDGYCLFNAKNFILTRVPHLLNGLRYGEESLEKAVNDALQNLEIDDSFKQRFLKALEFPDEPVLQLRDKFNEKLLNINSEFTSLEESGLVELVNALPKLCQSHRTQQEVTQVILDIVDELGYSKDFEKLNRLLLTVMNNIELVNIVLFNSNLSLFYKLLDIIDNSNFRVDEDDENFQDQYSYCGIIMLSIVIIVQNFGVDLSKLTVKESFIINYLNDFYYRMCDNLSNVTPVNGDDEDRIIAENYHNLLNEWITALFDDRNEGLSDDLIKSLSIKQIYKLVPLIYKQGIIAADCNKIDWNILSNGLEYLSQPFLTPIVPIIIKFLVRDCNIDHELKLRIIKEMINDSSSLTVKMVISICGNDIIKLNPPAELKEQIQQCVHYSDTIDPFPRDYNVKDTFRSQLLGETRLSNKFVTTYVLGKRADVISSLVQEIYNFQKSNHEDSKMFINLMVFIILLDSVESRQDKDYWKREFSALSSTQLQKSSHTGFELTMDYHFSSIFNDSSSSIPLGQQQGQKLQVQDGMDGINDFLKGVTGGDDNDDDDAMMQDDDLFNEKPKTSDQLQNLLQKVHRYSCLINQFRKIRNESFNNSMFGKSVSLLNDKLMEEMNNWHF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.73
3	0.77
4	0.78
5	0.79
6	0.83
7	0.9
8	0.93
9	0.94
10	0.95
11	0.95
12	0.95
13	0.96
14	0.96
15	0.95
16	0.97
17	0.96
18	0.95
19	0.94
20	0.93
21	0.9
22	0.82
23	0.8
24	0.77
25	0.7
26	0.64
27	0.62
28	0.53
29	0.5
30	0.53
31	0.5
32	0.48
33	0.51
34	0.5
35	0.42
36	0.42
37	0.37
38	0.32
39	0.26
40	0.21
41	0.16
42	0.13
43	0.14
44	0.16
45	0.18
46	0.26
47	0.35
48	0.4
49	0.4
50	0.47
51	0.54
52	0.54
53	0.55
54	0.48
55	0.45
56	0.41
57	0.44
58	0.41
59	0.41
60	0.42
61	0.44
62	0.47
63	0.44
64	0.46
65	0.52
66	0.54
67	0.53
68	0.58
69	0.63
70	0.65
71	0.72
72	0.74
73	0.66
74	0.62
75	0.55
76	0.46
77	0.37
78	0.31
79	0.22
80	0.2
81	0.19
82	0.17
83	0.18
84	0.22
85	0.27
86	0.32
87	0.42
88	0.46
89	0.53
90	0.62
91	0.68
92	0.72
93	0.73
94	0.77
95	0.75
96	0.71
97	0.7
98	0.65
99	0.59
100	0.51
101	0.44
102	0.33
103	0.24
104	0.2
105	0.13
106	0.09
107	0.07
108	0.08
109	0.08
110	0.11
111	0.11
112	0.12
113	0.14
114	0.16
115	0.17
116	0.16
117	0.2
118	0.27
119	0.32
120	0.32
121	0.31
122	0.29
123	0.34
124	0.36
125	0.33
126	0.24
127	0.19
128	0.2
129	0.19
130	0.19
131	0.2
132	0.21
133	0.19
134	0.23
135	0.23
136	0.23
137	0.23
138	0.23
139	0.2
140	0.2
141	0.24
142	0.2
143	0.21
144	0.2
145	0.2
146	0.22
147	0.22
148	0.23
149	0.23
150	0.22
151	0.22
152	0.23
153	0.23
154	0.22
155	0.18
156	0.17
157	0.14
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.18
163	0.21
164	0.2
165	0.26
166	0.34
167	0.37
168	0.4
169	0.41
170	0.45
171	0.47
172	0.49
173	0.43
174	0.39
175	0.39
176	0.36
177	0.33
178	0.26
179	0.22
180	0.18
181	0.16
182	0.12
183	0.07
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.13
190	0.13
191	0.17
192	0.13
193	0.15
194	0.2
195	0.22
196	0.22
197	0.25
198	0.27
199	0.24
200	0.23
201	0.23
202	0.16
203	0.2
204	0.2
205	0.17
206	0.18
207	0.17
208	0.17
209	0.17
210	0.18
211	0.13
212	0.14
213	0.15
214	0.13
215	0.15
216	0.19
217	0.22
218	0.22
219	0.21
220	0.21
221	0.19
222	0.17
223	0.15
224	0.12
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.15
230	0.16
231	0.19
232	0.2
233	0.22
234	0.23
235	0.32
236	0.34
237	0.36
238	0.35
239	0.34
240	0.33
241	0.31
242	0.3
243	0.22
244	0.21
245	0.17
246	0.18
247	0.18
248	0.18
249	0.22
250	0.23
251	0.22
252	0.22
253	0.21
254	0.2
255	0.2
256	0.22
257	0.18
258	0.17
259	0.16
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.13
264	0.11
265	0.09
266	0.07
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.15
279	0.18
280	0.2
281	0.2
282	0.21
283	0.21
284	0.25
285	0.31
286	0.35
287	0.35
288	0.35
289	0.36
290	0.41
291	0.43
292	0.4
293	0.4
294	0.31
295	0.28
296	0.31
297	0.32
298	0.28
299	0.26
300	0.25
301	0.18
302	0.18
303	0.16
304	0.11
305	0.09
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.08
311	0.09
312	0.12
313	0.13
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.14
319	0.12
320	0.11
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.09
327	0.09
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.09
333	0.08
334	0.1
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.08
341	0.1
342	0.09
343	0.13
344	0.13
345	0.16
346	0.18
347	0.19
348	0.22
349	0.26
350	0.26
351	0.21
352	0.23
353	0.23
354	0.2
355	0.22
356	0.19
357	0.13
358	0.13
359	0.13
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.09
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.1
380	0.09
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.15
385	0.17
386	0.21
387	0.21
388	0.25
389	0.27
390	0.26
391	0.27
392	0.27
393	0.24
394	0.2
395	0.17
396	0.15
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.19
402	0.19
403	0.21
404	0.25
405	0.24
406	0.28
407	0.28
408	0.3
409	0.27
410	0.27
411	0.24
412	0.2
413	0.2
414	0.13
415	0.15
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.09
432	0.09
433	0.14
434	0.17
435	0.27
436	0.33
437	0.39
438	0.4
439	0.4
440	0.47
441	0.43
442	0.39
443	0.3
444	0.24
445	0.18
446	0.17
447	0.13
448	0.05
449	0.04
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.05
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.15
461	0.16
462	0.2
463	0.2
464	0.2
465	0.17
466	0.17
467	0.19
468	0.15
469	0.14
470	0.11
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.08
475	0.06
476	0.04
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.03
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.07
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.07
494	0.08
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.12
499	0.11
500	0.11
501	0.12
502	0.12
503	0.12
504	0.14
505	0.16
506	0.16
507	0.17
508	0.17
509	0.15
510	0.14
511	0.11
512	0.1
513	0.09
514	0.09
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.07
519	0.07
520	0.05
521	0.04
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.03
527	0.03
528	0.02
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.05
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.1
539	0.1
540	0.11
541	0.12
542	0.11
543	0.11
544	0.12
545	0.11
546	0.11
547	0.12
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.08
552	0.1
553	0.11
554	0.1
555	0.09
556	0.1
557	0.11
558	0.15
559	0.15
560	0.15
561	0.14
562	0.14
563	0.14
564	0.13
565	0.15
566	0.11
567	0.1
568	0.09
569	0.09
570	0.09
571	0.09
572	0.09
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.08
585	0.06
586	0.05
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.08
592	0.07
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.1
599	0.08
600	0.09
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.09
605	0.13
606	0.14
607	0.14
608	0.15
609	0.23
610	0.23
611	0.24
612	0.24
613	0.23
614	0.22
615	0.22
616	0.26
617	0.19
618	0.19
619	0.16
620	0.17
621	0.15
622	0.13
623	0.15
624	0.13
625	0.15
626	0.15
627	0.15
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.11
632	0.11
633	0.1
634	0.12
635	0.12
636	0.12
637	0.12
638	0.11
639	0.11
640	0.08
641	0.1
642	0.09
643	0.09
644	0.08
645	0.09
646	0.09
647	0.09
648	0.08
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.1
654	0.11
655	0.11
656	0.11
657	0.13
658	0.16
659	0.17
660	0.18
661	0.17
662	0.22
663	0.25
664	0.26
665	0.24
666	0.22
667	0.23
668	0.24
669	0.26
670	0.2
671	0.19
672	0.19
673	0.2
674	0.21
675	0.24
676	0.23
677	0.21
678	0.2
679	0.19
680	0.21
681	0.2
682	0.17
683	0.11
684	0.12
685	0.1
686	0.13
687	0.13
688	0.11
689	0.12
690	0.12
691	0.12
692	0.14
693	0.14
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.16
698	0.18
699	0.18
700	0.18
701	0.19
702	0.21
703	0.23
704	0.26
705	0.23
706	0.27
707	0.29
708	0.3
709	0.3
710	0.28
711	0.27
712	0.25
713	0.24
714	0.19
715	0.18
716	0.19
717	0.21
718	0.22
719	0.23
720	0.21
721	0.22
722	0.23
723	0.24
724	0.22
725	0.21
726	0.26
727	0.31
728	0.34
729	0.34
730	0.35
731	0.37
732	0.35
733	0.35
734	0.27
735	0.26
736	0.26
737	0.26
738	0.25
739	0.25
740	0.27
741	0.29
742	0.3
743	0.24
744	0.21
745	0.2
746	0.19
747	0.18
748	0.17
749	0.2
750	0.22
751	0.28
752	0.27
753	0.26
754	0.28
755	0.26
756	0.24
757	0.2
758	0.18
759	0.14
760	0.16
761	0.16
762	0.14
763	0.13
764	0.13
765	0.14
766	0.17
767	0.21
768	0.19
769	0.19
770	0.27
771	0.31
772	0.4
773	0.42
774	0.41
775	0.36
776	0.37
777	0.44
778	0.37
779	0.34
780	0.26
781	0.21
782	0.18
783	0.18
784	0.16
785	0.09
786	0.07
787	0.07
788	0.06
789	0.05
790	0.04
791	0.05
792	0.05
793	0.09
794	0.1
795	0.12
796	0.15
797	0.18
798	0.26
799	0.35
800	0.44
801	0.47
802	0.51
803	0.51
804	0.52
805	0.51
806	0.45
807	0.44
808	0.37
809	0.34
810	0.36
811	0.37
812	0.38
813	0.4
814	0.38
815	0.31
816	0.35
817	0.35
818	0.31
819	0.29
820	0.27
821	0.23
822	0.25
823	0.24
824	0.19
825	0.16
826	0.16
827	0.15
828	0.14
829	0.14
830	0.11
831	0.11
832	0.13
833	0.13
834	0.11
835	0.12
836	0.13
837	0.14
838	0.16
839	0.16
840	0.14
841	0.14
842	0.18
843	0.22
844	0.26
845	0.29
846	0.3
847	0.34
848	0.37
849	0.4
850	0.36
851	0.34
852	0.32
853	0.29
854	0.26
855	0.21
856	0.18
857	0.15
858	0.14
859	0.12
860	0.1
861	0.09
862	0.08
863	0.07
864	0.07
865	0.07
866	0.07
867	0.08
868	0.08
869	0.09
870	0.11
871	0.12
872	0.12
873	0.13
874	0.12
875	0.1
876	0.1
877	0.1
878	0.08
879	0.08
880	0.07
881	0.07
882	0.08
883	0.09
884	0.12
885	0.13
886	0.15
887	0.19
888	0.19
889	0.2
890	0.23
891	0.28
892	0.3
893	0.37
894	0.39
895	0.45
896	0.51
897	0.57
898	0.56
899	0.55
900	0.52
901	0.49
902	0.5
903	0.46
904	0.43
905	0.4
906	0.4
907	0.45
908	0.53
909	0.55
910	0.55
911	0.59
912	0.64
913	0.68
914	0.73
915	0.71
916	0.68
917	0.7
918	0.72
919	0.7
920	0.69
921	0.65
922	0.6
923	0.55
924	0.48
925	0.39
926	0.31
927	0.26
928	0.19
929	0.19
930	0.2
931	0.23
932	0.23
933	0.24
934	0.27
935	0.25
936	0.26
937	0.24
938	0.21
939	0.18

C5M3A0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer