Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MIV2

Protein Details
Accession C5MIV2    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-211DVSTELKPKPRRKSSIKYGRRRSDAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-35PGIRKGGGKTVGKKLKKTIPRK
192-207KPKPRRKSSIKYGRRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_05995  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MGQSNKTSRKSVTPGIRKGGGKTVGKKLKKTIPRKTIDWSKYNVSSDDDDDEDEQDEDEDEEDDNNNSDEDNSRSMNSDNEESEHYNLDGLYSLIDKSNKSVDSDASSSVDDEEKSNAGYSSSESDDIMYSSSSDEDVDFVKLQIARARKGLKSKPKNDIAIASDSESEAESHSESGVDGESEVADVSTELKPKPRRKSSIKYGRRRSDAVLPELKFEFDNPEQDEVSSVEEFHAAPVDQQEEEDLGEDLGEEVDVDFSSNIPLDTFDFEHQLMDVPRIGEEELNSDAEYEFNEDELIATLAENDDDDGLLDTPTTNTTPKEVSRHNSISSSNVEDFDDDDDDNDPFLKEEEKFLVKEFEDNGFDEEEGDGDDFDLFETEFNTNEPIVKYESNHSSTSDDELINLDFNTNPSKKKNHHSEDFDDNTYLFNYFFSSDNESSSDEIDINMADADELFREGIADDNTTTATPNQNPNQTPSNKSPAEASEDSNYDLHKTLFDNDGFDGYESGESTEEELDLPQPNKKIQSFTKPSEVISNGADPRPPVIGTWVTSNYKPFKVIDGSSVLSLVSPQNNPRKGVIVQSPHIASSEDSAIGLDELLNVELIDDGNIDENDIKIWREFNNDNKKKIPLGAFRNKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.68
3 0.72
4 0.66
5 0.62
6 0.62
7 0.59
8 0.56
9 0.56
10 0.6
11 0.63
12 0.67
13 0.69
14 0.68
15 0.7
16 0.73
17 0.77
18 0.77
19 0.77
20 0.78
21 0.77
22 0.78
23 0.79
24 0.77
25 0.72
26 0.67
27 0.63
28 0.63
29 0.61
30 0.53
31 0.46
32 0.42
33 0.38
34 0.36
35 0.3
36 0.26
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.17
41 0.15
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.12
57 0.14
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.24
65 0.24
66 0.22
67 0.23
68 0.26
69 0.26
70 0.27
71 0.26
72 0.22
73 0.19
74 0.17
75 0.15
76 0.12
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.21
86 0.21
87 0.23
88 0.24
89 0.23
90 0.26
91 0.28
92 0.27
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.13
129 0.13
130 0.15
131 0.18
132 0.21
133 0.21
134 0.27
135 0.31
136 0.32
137 0.4
138 0.48
139 0.55
140 0.62
141 0.68
142 0.71
143 0.74
144 0.74
145 0.66
146 0.62
147 0.54
148 0.48
149 0.4
150 0.32
151 0.25
152 0.22
153 0.2
154 0.15
155 0.12
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.06
175 0.08
176 0.11
177 0.11
178 0.19
179 0.29
180 0.37
181 0.48
182 0.55
183 0.62
184 0.69
185 0.78
186 0.82
187 0.84
188 0.86
189 0.86
190 0.87
191 0.86
192 0.82
193 0.75
194 0.67
195 0.64
196 0.59
197 0.55
198 0.52
199 0.44
200 0.41
201 0.39
202 0.36
203 0.27
204 0.22
205 0.22
206 0.16
207 0.2
208 0.2
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.16
214 0.17
215 0.12
216 0.1
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.1
307 0.12
308 0.16
309 0.19
310 0.22
311 0.28
312 0.3
313 0.3
314 0.3
315 0.28
316 0.27
317 0.25
318 0.25
319 0.18
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.11
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.11
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.09
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.17
378 0.22
379 0.24
380 0.24
381 0.24
382 0.22
383 0.22
384 0.24
385 0.22
386 0.17
387 0.13
388 0.14
389 0.13
390 0.12
391 0.11
392 0.09
393 0.06
394 0.08
395 0.14
396 0.15
397 0.17
398 0.21
399 0.29
400 0.34
401 0.43
402 0.53
403 0.55
404 0.61
405 0.65
406 0.66
407 0.67
408 0.66
409 0.57
410 0.47
411 0.39
412 0.31
413 0.25
414 0.2
415 0.11
416 0.08
417 0.07
418 0.08
419 0.09
420 0.11
421 0.17
422 0.17
423 0.18
424 0.2
425 0.2
426 0.19
427 0.18
428 0.17
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.09
454 0.13
455 0.16
456 0.23
457 0.27
458 0.34
459 0.35
460 0.39
461 0.45
462 0.45
463 0.47
464 0.45
465 0.49
466 0.43
467 0.42
468 0.4
469 0.33
470 0.38
471 0.34
472 0.31
473 0.26
474 0.26
475 0.28
476 0.26
477 0.24
478 0.18
479 0.18
480 0.15
481 0.13
482 0.13
483 0.15
484 0.18
485 0.19
486 0.19
487 0.18
488 0.19
489 0.18
490 0.16
491 0.14
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.1
504 0.14
505 0.15
506 0.18
507 0.2
508 0.23
509 0.28
510 0.3
511 0.35
512 0.37
513 0.47
514 0.51
515 0.53
516 0.59
517 0.55
518 0.53
519 0.53
520 0.48
521 0.39
522 0.33
523 0.33
524 0.27
525 0.27
526 0.27
527 0.21
528 0.21
529 0.21
530 0.19
531 0.14
532 0.16
533 0.18
534 0.18
535 0.23
536 0.26
537 0.28
538 0.29
539 0.35
540 0.35
541 0.34
542 0.35
543 0.31
544 0.3
545 0.32
546 0.32
547 0.3
548 0.29
549 0.29
550 0.26
551 0.26
552 0.2
553 0.15
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.17
558 0.24
559 0.34
560 0.38
561 0.41
562 0.41
563 0.42
564 0.4
565 0.44
566 0.45
567 0.42
568 0.41
569 0.44
570 0.43
571 0.38
572 0.38
573 0.31
574 0.23
575 0.19
576 0.19
577 0.14
578 0.13
579 0.12
580 0.12
581 0.11
582 0.11
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.05
594 0.06
595 0.09
596 0.09
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.12
601 0.13
602 0.14
603 0.12
604 0.16
605 0.17
606 0.24
607 0.29
608 0.38
609 0.48
610 0.54
611 0.58
612 0.6
613 0.62
614 0.58
615 0.6
616 0.59
617 0.57
618 0.6