Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PXD9

Protein Details
Accession A0A5N5PXD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-414EPEALERIKKRKDHNKLCNNHYLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-383KTNGTREAPKEKKPAPPPWNPGRRG
397-402RIKKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, cyto 12, nucl 10.5, mito_nucl 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MENDARMAFIQRFQALQAYRDSYTELAKDLILYNERITTDLAVQIEDLQRQLHISQLDLTDATNSRRELQLEVQNLTTAFSALNQHLQGRPHIGVKGSSERSIEAVLQSHNPYVVVLIDGDGLLFKDHFIRRGVEGGKKAALALKTAILKQCHGLATEIEVIGRVYVNLSGLTEAMRKSGSMEKESDLKNFSLGFTQGVPSFDFIDVGSDRPDAKIKDSATWHLRNYNCKHVILGVSHDAGYAAFVNGVMASAATEERVTVLEGTRTVHELLVTGVSVLSLSDTLFRSEKLVAKPSPKGQTLLSPIGSPGPALIAAVTPRPASTPATAEEQPVSYARAIKKAATPPPQMTLPIPLQPKKTNGTREAPKEKKPAPPPWNPGRRGLDPTLKVEPEALERIKKRKDHNKLCNNHYLRGPCSKGNDCVFEHKYKPTEDEIVAIAFLTRLNPCTSGQDCEIENCIYGHHCPTIKDNVCMHGYCKFRPEDHPPGCKLRKPSQTNDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.27
4 0.29
5 0.29
6 0.28
7 0.28
8 0.29
9 0.24
10 0.26
11 0.24
12 0.2
13 0.17
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.19
19 0.2
20 0.19
21 0.22
22 0.22
23 0.21
24 0.21
25 0.18
26 0.17
27 0.19
28 0.18
29 0.15
30 0.14
31 0.17
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.14
41 0.14
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.25
54 0.26
55 0.26
56 0.31
57 0.36
58 0.35
59 0.36
60 0.34
61 0.32
62 0.31
63 0.28
64 0.21
65 0.14
66 0.09
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.16
71 0.16
72 0.19
73 0.22
74 0.23
75 0.24
76 0.25
77 0.26
78 0.25
79 0.25
80 0.24
81 0.23
82 0.26
83 0.33
84 0.31
85 0.31
86 0.29
87 0.28
88 0.27
89 0.27
90 0.23
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.17
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.14
100 0.12
101 0.1
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.11
114 0.13
115 0.16
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.27
120 0.3
121 0.29
122 0.31
123 0.3
124 0.29
125 0.27
126 0.26
127 0.23
128 0.2
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.16
133 0.19
134 0.23
135 0.2
136 0.21
137 0.2
138 0.22
139 0.2
140 0.19
141 0.17
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.21
171 0.27
172 0.28
173 0.27
174 0.24
175 0.21
176 0.2
177 0.18
178 0.17
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.14
200 0.12
201 0.14
202 0.18
203 0.18
204 0.22
205 0.23
206 0.28
207 0.32
208 0.34
209 0.33
210 0.34
211 0.36
212 0.4
213 0.42
214 0.46
215 0.42
216 0.39
217 0.38
218 0.33
219 0.32
220 0.24
221 0.23
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.02
238 0.02
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.05
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.13
276 0.18
277 0.18
278 0.24
279 0.25
280 0.29
281 0.33
282 0.37
283 0.4
284 0.36
285 0.35
286 0.3
287 0.32
288 0.34
289 0.33
290 0.28
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.19
295 0.14
296 0.08
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.19
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.15
321 0.11
322 0.15
323 0.16
324 0.2
325 0.21
326 0.21
327 0.27
328 0.32
329 0.39
330 0.42
331 0.45
332 0.42
333 0.44
334 0.43
335 0.39
336 0.33
337 0.3
338 0.24
339 0.25
340 0.29
341 0.3
342 0.34
343 0.36
344 0.39
345 0.39
346 0.44
347 0.46
348 0.46
349 0.51
350 0.54
351 0.6
352 0.67
353 0.67
354 0.68
355 0.69
356 0.68
357 0.69
358 0.69
359 0.71
360 0.68
361 0.72
362 0.73
363 0.75
364 0.8
365 0.73
366 0.73
367 0.69
368 0.65
369 0.61
370 0.59
371 0.57
372 0.5
373 0.52
374 0.49
375 0.43
376 0.39
377 0.34
378 0.29
379 0.24
380 0.27
381 0.25
382 0.26
383 0.31
384 0.39
385 0.45
386 0.5
387 0.56
388 0.61
389 0.7
390 0.74
391 0.81
392 0.83
393 0.84
394 0.85
395 0.86
396 0.79
397 0.72
398 0.67
399 0.61
400 0.54
401 0.54
402 0.51
403 0.44
404 0.47
405 0.47
406 0.48
407 0.47
408 0.48
409 0.42
410 0.47
411 0.49
412 0.47
413 0.47
414 0.46
415 0.46
416 0.43
417 0.44
418 0.4
419 0.4
420 0.35
421 0.33
422 0.28
423 0.25
424 0.22
425 0.18
426 0.14
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.1
432 0.12
433 0.14
434 0.15
435 0.22
436 0.24
437 0.27
438 0.28
439 0.29
440 0.28
441 0.29
442 0.31
443 0.24
444 0.23
445 0.18
446 0.17
447 0.16
448 0.17
449 0.18
450 0.2
451 0.22
452 0.23
453 0.28
454 0.38
455 0.39
456 0.43
457 0.42
458 0.42
459 0.44
460 0.43
461 0.4
462 0.36
463 0.37
464 0.33
465 0.38
466 0.36
467 0.36
468 0.43
469 0.5
470 0.54
471 0.59
472 0.65
473 0.64
474 0.7
475 0.73
476 0.72
477 0.71
478 0.69
479 0.71
480 0.71
481 0.75