Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MAR3

Protein Details
Accession C5MAR3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
514-534DSKKYKDLKYHPKKNFIKNLIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ctp:CTRG_03155  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MDNSMKRSRDEFEEDDSRGGQFEGSHYNNFESKRQHIDPAQELTNNICKDIRRLGETGDVENLIADTNYISNPIVAEFEKMDTLRNAILPTIYALITEQPHKISAISNLILICNAKNFVVAKYVIEFLHSKIQSLLDSQKGSPFNHIKNVLKFLSTLTPIIEDYGIIQIYKQFLNFAIDLQKEKESRDGVAQEIYYNVLIAIPYLLSNDKSDDLKTYINELIDLAKEFKVVSQPASVLFPFDTRLGNFDLPYVPKQMVDLILPALLGLQENEWNFDLFLDFKQHLDPVIESCLANNSISSELIKHKLPQFSLPTITEESFTPDSIDKLWQENPRYLFQVYNNTTSFETVPPIESYYGLFFKDIAFDILTNLSFNKNETAIELSILDMFFSQKLFAPPGTSIDQLNEINKDNESGNNDPRLSTWKIEDVAVESILTMIFQLPAPLEVEMYYYAVLISCCRESTESIAPVFGRAIRFLYNHLESLDYELKLRFLDWMSIQLSNFEFSWKWDEWVDDSKKYKDLKYHPKKNFIKNLIAKEIRLSNKKRIKDSFLEMVDDQIVNLDEFYQYLDISMVPDVQDYILKYDTELYGGSEDKFKELLEQKKLQLSEKSTTTAQDEIFFNFTNNELPFHEVGSKVYDFILTHFKSNTDFNELYKSVISEVEVPNPERFVVNMILQTYAYIGSRSIYSVVSILSRDINKLKFLSGAAIDYVGEEAQFQDLHLTEEQKQDRQIWIIDAIFRIWIHQPQVVFLILEYLIEFGIIKPKYLLQKALESNLIIDNVSCMESINRVLANSKSKELILQLSSGIISNLNQLELPNDKTVSIEEINDSNASEVDKQWLFYEYLGLLKSYFRKYIYHNNEYTEEIKEIFNQLENVPAKEEILSWIIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.42
4 0.35
5 0.28
6 0.25
7 0.18
8 0.12
9 0.14
10 0.2
11 0.23
12 0.25
13 0.26
14 0.3
15 0.33
16 0.35
17 0.38
18 0.35
19 0.37
20 0.44
21 0.45
22 0.49
23 0.49
24 0.54
25 0.55
26 0.54
27 0.52
28 0.45
29 0.43
30 0.4
31 0.44
32 0.36
33 0.32
34 0.29
35 0.26
36 0.3
37 0.38
38 0.37
39 0.34
40 0.35
41 0.35
42 0.41
43 0.42
44 0.39
45 0.33
46 0.28
47 0.24
48 0.22
49 0.2
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.16
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.15
75 0.16
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.2
92 0.23
93 0.21
94 0.22
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.2
99 0.16
100 0.12
101 0.13
102 0.11
103 0.13
104 0.15
105 0.14
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.18
110 0.2
111 0.17
112 0.19
113 0.19
114 0.17
115 0.26
116 0.24
117 0.23
118 0.22
119 0.24
120 0.22
121 0.25
122 0.27
123 0.23
124 0.25
125 0.25
126 0.3
127 0.32
128 0.33
129 0.38
130 0.4
131 0.39
132 0.44
133 0.5
134 0.5
135 0.51
136 0.56
137 0.48
138 0.41
139 0.38
140 0.33
141 0.31
142 0.27
143 0.23
144 0.18
145 0.18
146 0.17
147 0.18
148 0.15
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.1
160 0.11
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.19
165 0.2
166 0.22
167 0.23
168 0.27
169 0.25
170 0.26
171 0.3
172 0.25
173 0.25
174 0.28
175 0.27
176 0.24
177 0.25
178 0.24
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.12
183 0.1
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.17
201 0.19
202 0.19
203 0.21
204 0.21
205 0.2
206 0.19
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.15
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.18
223 0.17
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.13
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.2
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.12
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.08
265 0.09
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.12
289 0.15
290 0.16
291 0.18
292 0.23
293 0.26
294 0.27
295 0.3
296 0.32
297 0.32
298 0.34
299 0.31
300 0.29
301 0.28
302 0.27
303 0.22
304 0.18
305 0.2
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.16
313 0.12
314 0.14
315 0.2
316 0.24
317 0.26
318 0.3
319 0.32
320 0.31
321 0.32
322 0.3
323 0.27
324 0.24
325 0.31
326 0.29
327 0.31
328 0.29
329 0.28
330 0.28
331 0.27
332 0.26
333 0.16
334 0.15
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.08
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.13
385 0.15
386 0.14
387 0.13
388 0.13
389 0.15
390 0.14
391 0.15
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.12
399 0.16
400 0.17
401 0.19
402 0.21
403 0.21
404 0.2
405 0.2
406 0.24
407 0.21
408 0.19
409 0.17
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.17
414 0.14
415 0.12
416 0.11
417 0.1
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.12
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.15
455 0.15
456 0.12
457 0.08
458 0.07
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.11
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.13
469 0.18
470 0.19
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.09
478 0.07
479 0.09
480 0.08
481 0.12
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.12
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.14
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.16
498 0.24
499 0.26
500 0.26
501 0.29
502 0.29
503 0.34
504 0.36
505 0.35
506 0.35
507 0.42
508 0.48
509 0.56
510 0.65
511 0.66
512 0.75
513 0.8
514 0.81
515 0.81
516 0.74
517 0.73
518 0.68
519 0.67
520 0.64
521 0.57
522 0.48
523 0.41
524 0.42
525 0.38
526 0.4
527 0.39
528 0.41
529 0.48
530 0.52
531 0.57
532 0.55
533 0.56
534 0.53
535 0.54
536 0.51
537 0.45
538 0.43
539 0.36
540 0.33
541 0.27
542 0.22
543 0.16
544 0.1
545 0.09
546 0.06
547 0.06
548 0.05
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.05
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.07
565 0.07
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.1
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.12
579 0.12
580 0.12
581 0.13
582 0.12
583 0.17
584 0.23
585 0.3
586 0.34
587 0.38
588 0.39
589 0.43
590 0.45
591 0.41
592 0.39
593 0.37
594 0.34
595 0.32
596 0.33
597 0.28
598 0.28
599 0.27
600 0.25
601 0.2
602 0.19
603 0.18
604 0.17
605 0.19
606 0.18
607 0.16
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.12
614 0.16
615 0.16
616 0.16
617 0.17
618 0.14
619 0.14
620 0.17
621 0.16
622 0.13
623 0.13
624 0.13
625 0.12
626 0.13
627 0.21
628 0.18
629 0.2
630 0.2
631 0.2
632 0.21
633 0.24
634 0.24
635 0.22
636 0.22
637 0.21
638 0.27
639 0.27
640 0.26
641 0.24
642 0.22
643 0.16
644 0.15
645 0.15
646 0.14
647 0.14
648 0.19
649 0.21
650 0.23
651 0.23
652 0.23
653 0.22
654 0.17
655 0.17
656 0.14
657 0.14
658 0.14
659 0.15
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.12
665 0.1
666 0.09
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.09
680 0.12
681 0.13
682 0.16
683 0.2
684 0.21
685 0.23
686 0.24
687 0.23
688 0.21
689 0.21
690 0.2
691 0.16
692 0.16
693 0.13
694 0.12
695 0.11
696 0.1
697 0.1
698 0.07
699 0.06
700 0.05
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.08
706 0.08
707 0.11
708 0.13
709 0.15
710 0.17
711 0.26
712 0.29
713 0.3
714 0.32
715 0.32
716 0.33
717 0.33
718 0.31
719 0.25
720 0.25
721 0.23
722 0.22
723 0.2
724 0.18
725 0.17
726 0.15
727 0.15
728 0.15
729 0.17
730 0.18
731 0.2
732 0.19
733 0.19
734 0.21
735 0.2
736 0.17
737 0.13
738 0.13
739 0.1
740 0.1
741 0.09
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.07
746 0.05
747 0.13
748 0.13
749 0.13
750 0.14
751 0.19
752 0.26
753 0.29
754 0.34
755 0.3
756 0.38
757 0.41
758 0.43
759 0.41
760 0.34
761 0.32
762 0.29
763 0.26
764 0.17
765 0.14
766 0.11
767 0.1
768 0.11
769 0.09
770 0.08
771 0.08
772 0.1
773 0.11
774 0.13
775 0.13
776 0.12
777 0.16
778 0.2
779 0.28
780 0.29
781 0.3
782 0.29
783 0.29
784 0.3
785 0.3
786 0.31
787 0.24
788 0.22
789 0.2
790 0.18
791 0.19
792 0.17
793 0.14
794 0.09
795 0.08
796 0.12
797 0.12
798 0.12
799 0.12
800 0.12
801 0.15
802 0.18
803 0.21
804 0.2
805 0.2
806 0.19
807 0.2
808 0.21
809 0.23
810 0.21
811 0.18
812 0.18
813 0.18
814 0.2
815 0.2
816 0.19
817 0.14
818 0.13
819 0.14
820 0.13
821 0.13
822 0.18
823 0.18
824 0.19
825 0.19
826 0.21
827 0.2
828 0.18
829 0.21
830 0.15
831 0.17
832 0.17
833 0.16
834 0.14
835 0.18
836 0.24
837 0.25
838 0.28
839 0.27
840 0.3
841 0.37
842 0.48
843 0.53
844 0.56
845 0.54
846 0.55
847 0.56
848 0.56
849 0.51
850 0.43
851 0.35
852 0.27
853 0.25
854 0.23
855 0.23
856 0.21
857 0.21
858 0.2
859 0.19
860 0.26
861 0.27
862 0.26
863 0.26
864 0.25
865 0.23
866 0.22
867 0.22
868 0.17