Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PYM7

Protein Details
Accession A0A5N5PYM7    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-309AKAGAPKSPAKKRGRPAGRPKKTATAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-122KKRGRPSATPGKTPSTAKTNGTASKATSSRKRKAEEA
127-185ATPVKRPRGRPARGAAATASARLAVKDAKKAKVGRPKGSGSAPKATVPKRGGPKGASKK
256-340TRKPRAANGTAAPKAAKAPKATPTPKPAKAGAPKSPAKKRGRPAGRPKKTATAAAPAVLAASPAKKRGAPTARQAIRGWPVRRVK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MPPPLFPEHEHEHDDCLNLNGGDEGNDPAPFRVESDILNPGAGVGQSIVSLDEPDVVADMDIPEGDLADDELPAPEELPAAVASAKKRGRPSATPGKTPSTAKTNGTASKATSSRKRKAEEASEDEATPVKRPRGRPARGAAATASARLAVKDAKKAKVGRPKGSGSAPKATVPKRGGPKGASKKADSSNSEVVPKGEYEVEEILESVIDADTFEHLYRVKWKGYPLDEATWEPKTNLTHAAELIRAFDAKQVKQTRKPRAANGTAAPKAAKAPKATPTPKPAKAGAPKSPAKKRGRPAGRPKKTATAAAPAVLAASPAKKRGAPTARQAIRGWPVRRVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.31
3 0.26
4 0.24
5 0.18
6 0.18
7 0.14
8 0.12
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.12
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.22
24 0.2
25 0.2
26 0.18
27 0.15
28 0.15
29 0.13
30 0.1
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.09
70 0.1
71 0.18
72 0.21
73 0.25
74 0.29
75 0.35
76 0.4
77 0.42
78 0.5
79 0.53
80 0.55
81 0.57
82 0.56
83 0.55
84 0.52
85 0.49
86 0.44
87 0.39
88 0.38
89 0.34
90 0.34
91 0.34
92 0.34
93 0.35
94 0.32
95 0.26
96 0.29
97 0.31
98 0.32
99 0.36
100 0.41
101 0.47
102 0.52
103 0.54
104 0.54
105 0.57
106 0.61
107 0.59
108 0.58
109 0.54
110 0.49
111 0.45
112 0.41
113 0.36
114 0.28
115 0.23
116 0.19
117 0.2
118 0.24
119 0.26
120 0.37
121 0.45
122 0.49
123 0.52
124 0.54
125 0.57
126 0.53
127 0.52
128 0.42
129 0.35
130 0.31
131 0.25
132 0.19
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.18
140 0.22
141 0.24
142 0.29
143 0.33
144 0.39
145 0.45
146 0.5
147 0.49
148 0.5
149 0.49
150 0.47
151 0.48
152 0.47
153 0.4
154 0.38
155 0.33
156 0.31
157 0.34
158 0.32
159 0.34
160 0.31
161 0.33
162 0.35
163 0.37
164 0.37
165 0.34
166 0.43
167 0.46
168 0.52
169 0.49
170 0.44
171 0.46
172 0.48
173 0.51
174 0.43
175 0.39
176 0.36
177 0.34
178 0.34
179 0.3
180 0.25
181 0.21
182 0.18
183 0.14
184 0.1
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.14
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.23
210 0.29
211 0.31
212 0.36
213 0.33
214 0.33
215 0.33
216 0.33
217 0.33
218 0.3
219 0.27
220 0.21
221 0.21
222 0.19
223 0.19
224 0.23
225 0.21
226 0.2
227 0.2
228 0.21
229 0.2
230 0.19
231 0.18
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.13
236 0.17
237 0.17
238 0.26
239 0.33
240 0.39
241 0.49
242 0.58
243 0.65
244 0.7
245 0.74
246 0.73
247 0.74
248 0.73
249 0.69
250 0.65
251 0.63
252 0.54
253 0.5
254 0.42
255 0.33
256 0.32
257 0.32
258 0.31
259 0.26
260 0.29
261 0.35
262 0.45
263 0.49
264 0.51
265 0.56
266 0.6
267 0.62
268 0.62
269 0.58
270 0.57
271 0.62
272 0.63
273 0.61
274 0.61
275 0.63
276 0.68
277 0.74
278 0.75
279 0.74
280 0.75
281 0.76
282 0.78
283 0.82
284 0.83
285 0.86
286 0.87
287 0.88
288 0.86
289 0.82
290 0.81
291 0.74
292 0.7
293 0.61
294 0.58
295 0.5
296 0.44
297 0.39
298 0.29
299 0.26
300 0.19
301 0.17
302 0.1
303 0.13
304 0.15
305 0.18
306 0.21
307 0.22
308 0.25
309 0.35
310 0.42
311 0.44
312 0.51
313 0.59
314 0.61
315 0.63
316 0.62
317 0.59
318 0.58
319 0.61
320 0.54