FuNGI

A0A5N5LK90

Protein Details

Accession

A0A5N5LK90

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
458-481	ADTPEPSKKSKKARVEAQPTPKTK	Hydrophilic
547-575	VEEPKTNGKAKKEKKSKTIKPEPASEAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
430-448	AKKSKSKDADTTDKKKKRK
465-470	KKSKKA
553-571	NGKAKKEKKSKTIKPEPAS

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAGPKAPIGSLKGHAEKSSALARGASNNKLASSSAATKRANLKEESESDSSSDSDSDASDSGDIDHDKVLRDIASKASGPKSKAETKVPAPATKKTSLKKEESSSDDSSSESECESDDESDDDKKKTAEPSKGANVEKKPEASSDKSKAKEVKKTASEDESENDSSSSDSSSEGESEEEETPAKKAVAKPTETKKQSKSDASSSSESSSEASSSDSDEEADESMAIDDRNGNGNNALVRNQVPEIVANEFHLRKAEDGTNAADVARFFSEAKKEGKQIWYFTAPASIPIEVVEKLEIPLERAQKGQSILSHNGDDYGVAFEDAATSRAIKLLIPGKPGDKYRMLDAPVAQTMHLKRVTQFSQDGESILSLTQTAAAPSRSYRPQPKGLKARFQPIGIPSSATAKIGSDASDEDVDMAEAPALPSSQKTPAKKSKSKDADTTDKKKKRKLDVATDEPAADTPEPSKKSKKARVEAQPTPKTKPEISSSQPGKVTPILPPAVPSIRLPSSSQAAPASTPSSSKAVKKESAIPLPSNFRRSSSSFSSQAVEEPKTNGKAKKEKKSKTIKPEPASEAPKKTTPVPVPNFPSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.35
3	0.33
4	0.33
5	0.34
6	0.29
7	0.24
8	0.24
9	0.24
10	0.31
11	0.35
12	0.35
13	0.33
14	0.32
15	0.32
16	0.31
17	0.3
18	0.24
19	0.25
20	0.3
21	0.32
22	0.38
23	0.39
24	0.42
25	0.51
26	0.55
27	0.54
28	0.48
29	0.47
30	0.46
31	0.49
32	0.5
33	0.44
34	0.38
35	0.34
36	0.33
37	0.29
38	0.23
39	0.19
40	0.13
41	0.11
42	0.11
43	0.11
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.14
53	0.15
54	0.16
55	0.16
56	0.16
57	0.14
58	0.16
59	0.16
60	0.17
61	0.2
62	0.2
63	0.24
64	0.3
65	0.34
66	0.34
67	0.38
68	0.42
69	0.46
70	0.5
71	0.52
72	0.52
73	0.51
74	0.59
75	0.57
76	0.57
77	0.53
78	0.55
79	0.54
80	0.54
81	0.57
82	0.55
83	0.61
84	0.61
85	0.64
86	0.64
87	0.64
88	0.64
89	0.63
90	0.63
91	0.56
92	0.51
93	0.44
94	0.38
95	0.33
96	0.27
97	0.21
98	0.15
99	0.12
100	0.09
101	0.11
102	0.12
103	0.11
104	0.11
105	0.12
106	0.14
107	0.19
108	0.22
109	0.22
110	0.22
111	0.22
112	0.24
113	0.31
114	0.37
115	0.39
116	0.4
117	0.45
118	0.52
119	0.58
120	0.58
121	0.56
122	0.53
123	0.51
124	0.5
125	0.45
126	0.38
127	0.36
128	0.38
129	0.38
130	0.42
131	0.45
132	0.49
133	0.48
134	0.53
135	0.57
136	0.58
137	0.61
138	0.59
139	0.6
140	0.59
141	0.62
142	0.6
143	0.55
144	0.51
145	0.43
146	0.39
147	0.35
148	0.3
149	0.26
150	0.22
151	0.18
152	0.16
153	0.15
154	0.12
155	0.08
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.12
171	0.12
172	0.16
173	0.24
174	0.3
175	0.33
176	0.4
177	0.47
178	0.57
179	0.58
180	0.61
181	0.58
182	0.59
183	0.62
184	0.61
185	0.58
186	0.54
187	0.54
188	0.53
189	0.49
190	0.43
191	0.38
192	0.32
193	0.27
194	0.21
195	0.16
196	0.11
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.1
217	0.11
218	0.11
219	0.1
220	0.11
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.1
225	0.11
226	0.12
227	0.12
228	0.12
229	0.1
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.11
241	0.14
242	0.15
243	0.13
244	0.14
245	0.15
246	0.14
247	0.14
248	0.13
249	0.11
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.09
256	0.12
257	0.14
258	0.18
259	0.18
260	0.2
261	0.23
262	0.28
263	0.29
264	0.28
265	0.28
266	0.27
267	0.25
268	0.23
269	0.23
270	0.16
271	0.16
272	0.15
273	0.11
274	0.09
275	0.09
276	0.11
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.08
283	0.07
284	0.08
285	0.12
286	0.14
287	0.15
288	0.15
289	0.16
290	0.17
291	0.18
292	0.17
293	0.16
294	0.18
295	0.2
296	0.22
297	0.21
298	0.19
299	0.18
300	0.17
301	0.13
302	0.09
303	0.07
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.09
318	0.14
319	0.16
320	0.18
321	0.19
322	0.2
323	0.23
324	0.24
325	0.25
326	0.23
327	0.22
328	0.23
329	0.26
330	0.26
331	0.25
332	0.24
333	0.22
334	0.2
335	0.19
336	0.16
337	0.17
338	0.16
339	0.19
340	0.2
341	0.18
342	0.17
343	0.23
344	0.25
345	0.24
346	0.26
347	0.22
348	0.24
349	0.23
350	0.22
351	0.17
352	0.15
353	0.12
354	0.1
355	0.08
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.05
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.15
366	0.17
367	0.23
368	0.31
369	0.36
370	0.45
371	0.52
372	0.6
373	0.66
374	0.67
375	0.7
376	0.65
377	0.67
378	0.6
379	0.53
380	0.47
381	0.39
382	0.37
383	0.28
384	0.26
385	0.18
386	0.2
387	0.2
388	0.16
389	0.14
390	0.11
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.08
395	0.08
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.08
412	0.16
413	0.23
414	0.26
415	0.36
416	0.45
417	0.55
418	0.62
419	0.64
420	0.67
421	0.71
422	0.72
423	0.71
424	0.68
425	0.69
426	0.72
427	0.77
428	0.77
429	0.75
430	0.77
431	0.76
432	0.77
433	0.76
434	0.77
435	0.76
436	0.76
437	0.78
438	0.79
439	0.76
440	0.68
441	0.57
442	0.48
443	0.39
444	0.3
445	0.2
446	0.13
447	0.12
448	0.19
449	0.22
450	0.26
451	0.34
452	0.39
453	0.5
454	0.59
455	0.66
456	0.68
457	0.74
458	0.8
459	0.82
460	0.83
461	0.84
462	0.83
463	0.76
464	0.72
465	0.67
466	0.62
467	0.55
468	0.5
469	0.46
470	0.45
471	0.46
472	0.51
473	0.5
474	0.5
475	0.5
476	0.45
477	0.43
478	0.38
479	0.34
480	0.27
481	0.3
482	0.26
483	0.25
484	0.26
485	0.27
486	0.27
487	0.27
488	0.24
489	0.24
490	0.24
491	0.27
492	0.27
493	0.26
494	0.28
495	0.27
496	0.28
497	0.24
498	0.22
499	0.21
500	0.22
501	0.2
502	0.16
503	0.17
504	0.17
505	0.21
506	0.24
507	0.28
508	0.33
509	0.37
510	0.41
511	0.44
512	0.5
513	0.53
514	0.58
515	0.57
516	0.53
517	0.51
518	0.57
519	0.58
520	0.55
521	0.48
522	0.43
523	0.44
524	0.44
525	0.46
526	0.45
527	0.46
528	0.43
529	0.44
530	0.44
531	0.39
532	0.4
533	0.38
534	0.33
535	0.28
536	0.29
537	0.33
538	0.37
539	0.43
540	0.44
541	0.48
542	0.56
543	0.64
544	0.71
545	0.76
546	0.79
547	0.83
548	0.88
549	0.89
550	0.89
551	0.91
552	0.9
553	0.85
554	0.85
555	0.82
556	0.8
557	0.79
558	0.75
559	0.71
560	0.66
561	0.64
562	0.58
563	0.54
564	0.55
565	0.55
566	0.58
567	0.58
568	0.61

A0A5N5LK90

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer