Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MAP5

Protein Details
Accession C5MAP5    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-156SSSSNRHGNNDKKKKNKHAPSESSSHydrophilic
272-324VNKPYFLKRSDKRKVLQKAKFDSMKPKQREKAMERKRKKRLGKEFKQLEFRPNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-159KKKKNKHAPSESSSKRP
278-317LKRSDKRKVLQKAKFDSMKPKQREKAMERKRKKRLGKEFK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ctp:CTRG_03137  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MLAIMVRFYQSQSEKSAHNTKKIYSDNHQLLISFINSKALQTMAKTIRPSYYDDDDISSEDDFTYSSKTNKKSRGDEEDDELSSISFGALNRAQAKLSKRDSDDDEEEEEEEESADDGFFEDSDSDGPPEESSSSNRHGNNDKKKKNKHAPSESSSKRPVSRIRDIPGLPSRREQTLHTDIRFDAAYGKADLRKIRKDYAFLDDYRKQEISNMEGILRDKKNRLNDDEREEIKLQLQSLKSRMDTLKNRDLEESILKNYKKQQMDDFKSGKVNKPYFLKRSDKRKVLQKAKFDSMKPKQREKAMERKRKKRLGKEFKQLEFRPNNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.37
3 0.46
4 0.44
5 0.49
6 0.5
7 0.48
8 0.55
9 0.59
10 0.58
11 0.54
12 0.59
13 0.56
14 0.56
15 0.53
16 0.44
17 0.39
18 0.35
19 0.29
20 0.21
21 0.16
22 0.18
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.24
30 0.24
31 0.28
32 0.3
33 0.31
34 0.33
35 0.34
36 0.37
37 0.35
38 0.35
39 0.33
40 0.32
41 0.33
42 0.3
43 0.29
44 0.25
45 0.2
46 0.14
47 0.11
48 0.11
49 0.08
50 0.08
51 0.11
52 0.12
53 0.17
54 0.23
55 0.3
56 0.38
57 0.47
58 0.54
59 0.58
60 0.64
61 0.68
62 0.69
63 0.65
64 0.62
65 0.57
66 0.5
67 0.42
68 0.34
69 0.24
70 0.17
71 0.14
72 0.08
73 0.06
74 0.06
75 0.1
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.2
82 0.24
83 0.28
84 0.32
85 0.34
86 0.35
87 0.39
88 0.43
89 0.45
90 0.44
91 0.38
92 0.35
93 0.3
94 0.28
95 0.24
96 0.2
97 0.13
98 0.1
99 0.08
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.14
121 0.17
122 0.22
123 0.23
124 0.26
125 0.33
126 0.41
127 0.5
128 0.57
129 0.61
130 0.66
131 0.73
132 0.8
133 0.83
134 0.83
135 0.82
136 0.82
137 0.81
138 0.76
139 0.78
140 0.7
141 0.65
142 0.59
143 0.52
144 0.43
145 0.4
146 0.42
147 0.4
148 0.45
149 0.45
150 0.44
151 0.46
152 0.45
153 0.46
154 0.46
155 0.42
156 0.35
157 0.34
158 0.32
159 0.29
160 0.3
161 0.26
162 0.27
163 0.32
164 0.35
165 0.32
166 0.32
167 0.3
168 0.3
169 0.28
170 0.21
171 0.14
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.15
178 0.19
179 0.22
180 0.28
181 0.3
182 0.36
183 0.36
184 0.38
185 0.38
186 0.4
187 0.38
188 0.33
189 0.37
190 0.36
191 0.35
192 0.35
193 0.33
194 0.26
195 0.27
196 0.27
197 0.23
198 0.21
199 0.2
200 0.17
201 0.18
202 0.2
203 0.23
204 0.24
205 0.24
206 0.25
207 0.29
208 0.37
209 0.41
210 0.47
211 0.49
212 0.52
213 0.55
214 0.59
215 0.55
216 0.51
217 0.47
218 0.4
219 0.35
220 0.31
221 0.25
222 0.23
223 0.24
224 0.23
225 0.25
226 0.27
227 0.25
228 0.28
229 0.3
230 0.34
231 0.4
232 0.44
233 0.5
234 0.49
235 0.5
236 0.47
237 0.45
238 0.39
239 0.37
240 0.32
241 0.28
242 0.32
243 0.31
244 0.34
245 0.41
246 0.46
247 0.44
248 0.45
249 0.5
250 0.54
251 0.61
252 0.66
253 0.61
254 0.56
255 0.59
256 0.6
257 0.57
258 0.56
259 0.51
260 0.47
261 0.54
262 0.59
263 0.58
264 0.62
265 0.65
266 0.64
267 0.72
268 0.77
269 0.76
270 0.75
271 0.79
272 0.82
273 0.82
274 0.82
275 0.81
276 0.78
277 0.79
278 0.78
279 0.72
280 0.72
281 0.72
282 0.74
283 0.72
284 0.75
285 0.72
286 0.75
287 0.81
288 0.78
289 0.79
290 0.8
291 0.83
292 0.84
293 0.87
294 0.9
295 0.9
296 0.92
297 0.92
298 0.92
299 0.92
300 0.92
301 0.92
302 0.91
303 0.89
304 0.89
305 0.8
306 0.79