Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PGA0

Protein Details
Accession A0A5N5PGA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-47SSPPPHPPSLLKKRTQNPSISPPPLKRKRLPGSSSPHydrophilic
293-316AKVAKFGVKKRSRRFWRRDADAPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-309RAKAAKVAKFGVKKRSRRFWR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MSSSDSDFSPTSSPPPHPPSLLKKRTQNPSISPPPLKRKRLPGSSSPASTTTPTSTTPHPTISSHLSTSAAIEAGRMQITDHLSHFTALLTSHLLSPFPPLLPRLPIPSYADLYTSSTSNPHGAHFVVHQHDHPIAGVHYDLRLQINGTSSASWAIMKGLPGDANSTRLGRNATETRVHCLWNHLIETGSRETGSLLVWDMGRYEVLPGREVEEEQRRRRAVETESEGESQEHVAGGGRGKAGEGMTEQEKLARAFKERKIRLRLHGTRLPRGYTVHMRLSVEDDVEGRAKAAKVAKFGVKKRSRRFWRRDADAPETSGSEDEYDDGTSTTMGDYESRMGEAEDGLSAMEREIRETEDVMVRNTNAYPGADNTIGSVHQRRWFLSLDRAGSGFVKQREKGKVTWVRDVTRPPDEKEDNNRWTYPFYIRGSEHERSIVTGRLGDEILRDEGVTDFVHRKGWRPILN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.42
3 0.44
4 0.46
5 0.52
6 0.58
7 0.64
8 0.69
9 0.68
10 0.7
11 0.76
12 0.81
13 0.81
14 0.78
15 0.74
16 0.75
17 0.77
18 0.75
19 0.74
20 0.73
21 0.76
22 0.79
23 0.8
24 0.77
25 0.78
26 0.8
27 0.83
28 0.8
29 0.78
30 0.78
31 0.76
32 0.72
33 0.63
34 0.56
35 0.48
36 0.43
37 0.37
38 0.3
39 0.25
40 0.25
41 0.26
42 0.27
43 0.32
44 0.33
45 0.34
46 0.33
47 0.32
48 0.34
49 0.37
50 0.36
51 0.3
52 0.29
53 0.26
54 0.24
55 0.24
56 0.2
57 0.14
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.12
66 0.15
67 0.17
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.14
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.17
89 0.21
90 0.22
91 0.24
92 0.24
93 0.26
94 0.29
95 0.31
96 0.31
97 0.27
98 0.27
99 0.22
100 0.23
101 0.21
102 0.17
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.14
109 0.15
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.18
121 0.14
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.13
158 0.19
159 0.19
160 0.21
161 0.26
162 0.27
163 0.31
164 0.31
165 0.32
166 0.26
167 0.27
168 0.27
169 0.23
170 0.23
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.19
175 0.16
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.15
200 0.23
201 0.3
202 0.32
203 0.38
204 0.37
205 0.37
206 0.38
207 0.38
208 0.31
209 0.3
210 0.32
211 0.29
212 0.3
213 0.3
214 0.29
215 0.25
216 0.22
217 0.15
218 0.1
219 0.07
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.14
240 0.13
241 0.17
242 0.23
243 0.29
244 0.38
245 0.42
246 0.5
247 0.55
248 0.58
249 0.6
250 0.65
251 0.65
252 0.62
253 0.62
254 0.58
255 0.57
256 0.55
257 0.49
258 0.4
259 0.35
260 0.32
261 0.33
262 0.33
263 0.3
264 0.3
265 0.28
266 0.27
267 0.29
268 0.25
269 0.19
270 0.15
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.11
279 0.16
280 0.17
281 0.18
282 0.21
283 0.27
284 0.33
285 0.37
286 0.45
287 0.49
288 0.56
289 0.63
290 0.71
291 0.75
292 0.79
293 0.83
294 0.83
295 0.84
296 0.81
297 0.81
298 0.77
299 0.73
300 0.64
301 0.57
302 0.48
303 0.39
304 0.32
305 0.24
306 0.17
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.07
337 0.07
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.2
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.17
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.16
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.18
364 0.19
365 0.23
366 0.26
367 0.26
368 0.28
369 0.31
370 0.32
371 0.36
372 0.38
373 0.35
374 0.34
375 0.34
376 0.32
377 0.29
378 0.29
379 0.26
380 0.26
381 0.31
382 0.32
383 0.39
384 0.47
385 0.49
386 0.48
387 0.53
388 0.56
389 0.55
390 0.61
391 0.6
392 0.55
393 0.57
394 0.62
395 0.57
396 0.57
397 0.56
398 0.5
399 0.53
400 0.54
401 0.57
402 0.6
403 0.64
404 0.61
405 0.62
406 0.6
407 0.52
408 0.51
409 0.47
410 0.43
411 0.41
412 0.37
413 0.38
414 0.37
415 0.42
416 0.47
417 0.46
418 0.43
419 0.38
420 0.35
421 0.32
422 0.33
423 0.31
424 0.24
425 0.24
426 0.23
427 0.22
428 0.22
429 0.19
430 0.18
431 0.17
432 0.18
433 0.15
434 0.14
435 0.13
436 0.13
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.16
441 0.17
442 0.24
443 0.24
444 0.29
445 0.36