Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5M3W5

Protein Details
Accession C5M3W5    Localization Confidence Low Confidence Score 5.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
521-540YKKYVKSVERRNKRLKDDEKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 9.5, plas 4, cyto 2.5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018850  Mt_escape_2_C  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039627  Yme2_C  
IPR034260  Yme2_RRM  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_00754  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10443  RNA12  
CDD cd12433  RRM_Yme2p_like  
Amino Acid Sequences MLVQLVRRPIAWRPLLYPTSQLRFYSTDLEKLKKESDTTESDNSASTTGVIDKKHSEVLLYYDHIYPFTVSHNRLAQYLSRFTFPWVRKFDDEKLKQKVWNLSTPLPAGSTITEFVSLKRDSGVFVKFSYPPDVEATKFIEEIRQNVRNNDEKRSNANVVSRMLSYVWGTAPNVYSVKGVPWIEDMKRFPSTKISVKFEGDPLTEEELYVLFRRYGLINDIQPGPSEAFIYFHSMSAAVCAKHCITGMSLNGGKTVLHIQFVPIPRNNFLANVLSNHTKIAIPILIALLATFAVLIFDPIREWFIEYKILHSGKTFEQIKQNRWFKYLYVPYRTIVDWMYSGYDYIDQQIHEVARVTTNGGSSDGEEDDGSGDGPSVRDMQKESSMFWIERYEKSKQLQLWIMENANTFIVVKGPQGSGKEEFVLDHTLSRDDKLNKKVLVVECDKLGKSRSDNNLIDTAATQLGYFPVFTWTNTVSRFVDLGVQGLTGQKSGLSESKETQIKNMFSLATQAIRKITNSEYKKYVKSVERRNKRLKDDEKLEILREEDFLQQRPESKPVIVLNQFARRADVRSNDFVYPLLAEWASGLVQNNIAHVIILTADIGSVQLLNDALPNQVFKDISLSDASMTSSKQYVCDALKIKDTGPLDACLKPLGGRMLDLQSFIRRLKSGESPEQAVHEMITQAAELITTFFLSSHHKFGAGDSTWNAAQVWLIMKLLTQCETINFLELVKSPLFKANKETIETLTTLEKYDLISLQRDKGVLSKISTGRPLFKAAFENIIGDRRIWQLYETDYITALIGVEVTKIQKMEDELEKIYKIGKVDGRIEYLSKKIEASSAKIVEYEKKAAEVAADSQSKNTSFLGIKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.46
4 0.47
5 0.45
6 0.45
7 0.46
8 0.43
9 0.38
10 0.39
11 0.4
12 0.41
13 0.36
14 0.39
15 0.4
16 0.44
17 0.43
18 0.44
19 0.46
20 0.4
21 0.4
22 0.36
23 0.37
24 0.39
25 0.43
26 0.43
27 0.41
28 0.38
29 0.37
30 0.33
31 0.28
32 0.2
33 0.15
34 0.11
35 0.15
36 0.18
37 0.18
38 0.21
39 0.23
40 0.26
41 0.29
42 0.27
43 0.24
44 0.21
45 0.24
46 0.25
47 0.25
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.23
52 0.23
53 0.19
54 0.16
55 0.2
56 0.25
57 0.24
58 0.29
59 0.34
60 0.34
61 0.35
62 0.36
63 0.35
64 0.34
65 0.39
66 0.35
67 0.32
68 0.31
69 0.34
70 0.41
71 0.4
72 0.43
73 0.41
74 0.46
75 0.49
76 0.55
77 0.6
78 0.62
79 0.67
80 0.66
81 0.69
82 0.68
83 0.65
84 0.66
85 0.66
86 0.6
87 0.59
88 0.56
89 0.52
90 0.52
91 0.5
92 0.44
93 0.35
94 0.3
95 0.23
96 0.18
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.21
110 0.23
111 0.19
112 0.2
113 0.23
114 0.24
115 0.26
116 0.3
117 0.26
118 0.25
119 0.27
120 0.28
121 0.26
122 0.26
123 0.27
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.26
130 0.31
131 0.35
132 0.35
133 0.38
134 0.44
135 0.47
136 0.49
137 0.52
138 0.51
139 0.47
140 0.51
141 0.55
142 0.52
143 0.47
144 0.49
145 0.44
146 0.4
147 0.38
148 0.32
149 0.27
150 0.23
151 0.21
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.18
169 0.22
170 0.23
171 0.28
172 0.3
173 0.28
174 0.34
175 0.34
176 0.32
177 0.35
178 0.39
179 0.42
180 0.46
181 0.48
182 0.46
183 0.48
184 0.49
185 0.43
186 0.41
187 0.33
188 0.28
189 0.25
190 0.26
191 0.23
192 0.21
193 0.18
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.17
212 0.13
213 0.13
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.14
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.16
241 0.13
242 0.18
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.18
248 0.21
249 0.25
250 0.23
251 0.25
252 0.26
253 0.28
254 0.27
255 0.23
256 0.22
257 0.2
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.23
296 0.24
297 0.22
298 0.21
299 0.23
300 0.18
301 0.26
302 0.26
303 0.22
304 0.31
305 0.36
306 0.42
307 0.5
308 0.55
309 0.49
310 0.49
311 0.47
312 0.39
313 0.43
314 0.45
315 0.41
316 0.41
317 0.41
318 0.39
319 0.4
320 0.39
321 0.31
322 0.22
323 0.17
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.09
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.2
373 0.19
374 0.18
375 0.21
376 0.19
377 0.22
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.29
382 0.32
383 0.28
384 0.3
385 0.31
386 0.28
387 0.28
388 0.25
389 0.24
390 0.21
391 0.2
392 0.16
393 0.12
394 0.1
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.09
403 0.1
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.12
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.15
419 0.18
420 0.24
421 0.27
422 0.32
423 0.31
424 0.31
425 0.36
426 0.32
427 0.33
428 0.3
429 0.26
430 0.22
431 0.23
432 0.23
433 0.18
434 0.18
435 0.15
436 0.15
437 0.21
438 0.25
439 0.31
440 0.32
441 0.33
442 0.33
443 0.31
444 0.28
445 0.21
446 0.18
447 0.1
448 0.1
449 0.07
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.11
459 0.12
460 0.14
461 0.15
462 0.17
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.12
467 0.13
468 0.11
469 0.11
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.05
479 0.07
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.14
484 0.19
485 0.23
486 0.22
487 0.24
488 0.27
489 0.25
490 0.24
491 0.24
492 0.19
493 0.15
494 0.18
495 0.16
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.18
504 0.23
505 0.27
506 0.29
507 0.34
508 0.37
509 0.39
510 0.38
511 0.42
512 0.4
513 0.45
514 0.53
515 0.57
516 0.63
517 0.71
518 0.79
519 0.8
520 0.79
521 0.81
522 0.77
523 0.75
524 0.71
525 0.66
526 0.62
527 0.56
528 0.5
529 0.4
530 0.34
531 0.25
532 0.2
533 0.17
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.18
538 0.18
539 0.22
540 0.23
541 0.25
542 0.22
543 0.2
544 0.23
545 0.22
546 0.28
547 0.25
548 0.27
549 0.28
550 0.32
551 0.33
552 0.29
553 0.3
554 0.24
555 0.25
556 0.26
557 0.27
558 0.26
559 0.29
560 0.32
561 0.3
562 0.29
563 0.27
564 0.23
565 0.18
566 0.13
567 0.1
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.06
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.07
603 0.09
604 0.09
605 0.08
606 0.12
607 0.11
608 0.12
609 0.13
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.11
618 0.11
619 0.12
620 0.12
621 0.15
622 0.16
623 0.22
624 0.25
625 0.24
626 0.28
627 0.29
628 0.28
629 0.29
630 0.28
631 0.25
632 0.23
633 0.24
634 0.23
635 0.22
636 0.23
637 0.18
638 0.18
639 0.15
640 0.16
641 0.16
642 0.13
643 0.13
644 0.15
645 0.18
646 0.18
647 0.19
648 0.18
649 0.18
650 0.21
651 0.21
652 0.21
653 0.18
654 0.19
655 0.22
656 0.28
657 0.32
658 0.37
659 0.39
660 0.4
661 0.4
662 0.4
663 0.37
664 0.3
665 0.23
666 0.16
667 0.13
668 0.1
669 0.09
670 0.07
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.07
681 0.13
682 0.16
683 0.19
684 0.19
685 0.2
686 0.2
687 0.21
688 0.28
689 0.23
690 0.23
691 0.2
692 0.23
693 0.22
694 0.22
695 0.21
696 0.13
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.09
701 0.09
702 0.09
703 0.1
704 0.12
705 0.14
706 0.13
707 0.13
708 0.12
709 0.13
710 0.18
711 0.17
712 0.17
713 0.16
714 0.14
715 0.15
716 0.15
717 0.18
718 0.15
719 0.15
720 0.14
721 0.22
722 0.24
723 0.24
724 0.3
725 0.34
726 0.37
727 0.4
728 0.41
729 0.35
730 0.36
731 0.35
732 0.3
733 0.25
734 0.22
735 0.2
736 0.18
737 0.16
738 0.14
739 0.16
740 0.17
741 0.15
742 0.21
743 0.22
744 0.25
745 0.26
746 0.26
747 0.24
748 0.26
749 0.29
750 0.27
751 0.26
752 0.31
753 0.33
754 0.36
755 0.42
756 0.4
757 0.41
758 0.4
759 0.43
760 0.36
761 0.35
762 0.37
763 0.32
764 0.34
765 0.28
766 0.29
767 0.25
768 0.28
769 0.26
770 0.21
771 0.22
772 0.21
773 0.22
774 0.2
775 0.19
776 0.18
777 0.21
778 0.25
779 0.23
780 0.21
781 0.2
782 0.2
783 0.18
784 0.16
785 0.12
786 0.07
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.07
791 0.09
792 0.1
793 0.11
794 0.11
795 0.13
796 0.16
797 0.21
798 0.25
799 0.28
800 0.29
801 0.32
802 0.32
803 0.3
804 0.3
805 0.27
806 0.22
807 0.25
808 0.26
809 0.29
810 0.35
811 0.38
812 0.39
813 0.39
814 0.4
815 0.37
816 0.36
817 0.34
818 0.29
819 0.27
820 0.23
821 0.27
822 0.28
823 0.31
824 0.35
825 0.33
826 0.33
827 0.34
828 0.36
829 0.37
830 0.39
831 0.38
832 0.3
833 0.3
834 0.3
835 0.28
836 0.27
837 0.22
838 0.2
839 0.23
840 0.26
841 0.25
842 0.27
843 0.3
844 0.29
845 0.29
846 0.26
847 0.23