Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M3W5

Protein Details
Accession C5M3W5    Localization Confidence Low Confidence Score 5.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
521-540YKKYVKSVERRNKRLKDDEKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 9.5, plas 4, cyto 2.5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018850  Mt_escape_2_C  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039627  Yme2_C  
IPR034260  Yme2_RRM  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_00754  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10443  RNA12  
CDD cd12433  RRM_Yme2p_like  
Amino Acid Sequences MLVQLVRRPIAWRPLLYPTSQLRFYSTDLEKLKKESDTTESDNSASTTGVIDKKHSEVLLYYDHIYPFTVSHNRLAQYLSRFTFPWVRKFDDEKLKQKVWNLSTPLPAGSTITEFVSLKRDSGVFVKFSYPPDVEATKFIEEIRQNVRNNDEKRSNANVVSRMLSYVWGTAPNVYSVKGVPWIEDMKRFPSTKISVKFEGDPLTEEELYVLFRRYGLINDIQPGPSEAFIYFHSMSAAVCAKHCITGMSLNGGKTVLHIQFVPIPRNNFLANVLSNHTKIAIPILIALLATFAVLIFDPIREWFIEYKILHSGKTFEQIKQNRWFKYLYVPYRTIVDWMYSGYDYIDQQIHEVARVTTNGGSSDGEEDDGSGDGPSVRDMQKESSMFWIERYEKSKQLQLWIMENANTFIVVKGPQGSGKEEFVLDHTLSRDDKLNKKVLVVECDKLGKSRSDNNLIDTAATQLGYFPVFTWTNTVSRFVDLGVQGLTGQKSGLSESKETQIKNMFSLATQAIRKITNSEYKKYVKSVERRNKRLKDDEKLEILREEDFLQQRPESKPVIVLNQFARRADVRSNDFVYPLLAEWASGLVQNNIAHVIILTADIGSVQLLNDALPNQVFKDISLSDASMTSSKQYVCDALKIKDTGPLDACLKPLGGRMLDLQSFIRRLKSGESPEQAVHEMITQAAELITTFFLSSHHKFGAGDSTWNAAQVWLIMKLLTQCETINFLELVKSPLFKANKETIETLTTLEKYDLISLQRDKGVLSKISTGRPLFKAAFENIIGDRRIWQLYETDYITALIGVEVTKIQKMEDELEKIYKIGKVDGRIEYLSKKIEASSAKIVEYEKKAAEVAADSQSKNTSFLGIKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.46
4 0.47
5 0.45
6 0.45
7 0.46
8 0.43
9 0.38
10 0.39
11 0.4
12 0.41
13 0.36
14 0.39
15 0.4
16 0.44
17 0.43
18 0.44
19 0.46
20 0.4
21 0.4
22 0.36
23 0.37
24 0.39
25 0.43
26 0.43
27 0.41
28 0.38
29 0.37
30 0.33
31 0.28
32 0.2
33 0.15
34 0.11
35 0.15
36 0.18
37 0.18
38 0.21
39 0.23
40 0.26
41 0.29
42 0.27
43 0.24
44 0.21
45 0.24
46 0.25
47 0.25
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.23
52 0.23
53 0.19
54 0.16
55 0.2
56 0.25
57 0.24
58 0.29
59 0.34
60 0.34
61 0.35
62 0.36
63 0.35
64 0.34
65 0.39
66 0.35
67 0.32
68 0.31
69 0.34
70 0.41
71 0.4
72 0.43
73 0.41
74 0.46
75 0.49
76 0.55
77 0.6
78 0.62
79 0.67
80 0.66
81 0.69
82 0.68
83 0.65
84 0.66
85 0.66
86 0.6
87 0.59
88 0.56
89 0.52
90 0.52
91 0.5
92 0.44
93 0.35
94 0.3
95 0.23
96 0.18
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.21
110 0.23
111 0.19
112 0.2
113 0.23
114 0.24
115 0.26
116 0.3
117 0.26
118 0.25
119 0.27
120 0.28
121 0.26
122 0.26
123 0.27
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.26
130 0.31
131 0.35
132 0.35
133 0.38
134 0.44
135 0.47
136 0.49
137 0.52
138 0.51
139 0.47
140 0.51
141 0.55
142 0.52
143 0.47
144 0.49
145 0.44
146 0.4
147 0.38
148 0.32
149 0.27
150 0.23
151 0.21
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.18
169 0.22
170 0.23
171 0.28
172 0.3
173 0.28
174 0.34
175 0.34
176 0.32
177 0.35
178 0.39
179 0.42
180 0.46
181 0.48
182 0.46
183 0.48
184 0.49
185 0.43
186 0.41
187 0.33
188 0.28
189 0.25
190 0.26
191 0.23
192 0.21
193 0.18
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.17
212 0.13
213 0.13
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.16
225 0.11
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.14
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.16
241 0.13
242 0.18
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.18
248 0.21
249 0.25
250 0.23
251 0.25
252 0.26
253 0.28
254 0.27
255 0.23
256 0.22
257 0.2
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.23
296 0.24
297 0.22
298 0.21
299 0.23
300 0.18
301 0.26
302 0.26
303 0.22
304 0.31
305 0.36
306 0.42
307 0.5
308 0.55
309 0.49
310 0.49
311 0.47
312 0.39
313 0.43
314 0.45
315 0.41
316 0.41
317 0.41
318 0.39
319 0.4
320 0.39
321 0.31
322 0.22
323 0.17
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.09
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.2
373 0.19
374 0.18
375 0.21
376 0.19
377 0.22
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.29
382 0.32
383 0.28
384 0.3
385 0.31
386 0.28
387 0.28
388 0.25
389 0.24
390 0.21
391 0.2
392 0.16
393 0.12
394 0.1
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.09
403 0.1
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.12
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.15
419 0.18
420 0.24
421 0.27
422 0.32
423 0.31
424 0.31
425 0.36
426 0.32
427 0.33
428 0.3
429 0.26
430 0.22
431 0.23
432 0.23
433 0.18
434 0.18
435 0.15
436 0.15
437 0.21
438 0.25
439 0.31
440 0.32
441 0.33
442 0.33
443 0.31
444 0.28
445 0.21
446 0.18
447 0.1
448 0.1
449 0.07
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.11
459 0.12
460 0.14
461 0.15
462 0.17
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.12
467 0.13
468 0.11
469 0.11
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.05
479 0.07
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.14
484 0.19
485 0.23
486 0.22
487 0.24
488 0.27
489 0.25
490 0.24
491 0.24
492 0.19
493 0.15
494 0.18
495 0.16
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.18
504 0.23
505 0.27
506 0.29
507 0.34
508 0.37
509 0.39
510 0.38
511 0.42
512 0.4
513 0.45
514 0.53
515 0.57
516 0.63
517 0.71
518 0.79
519 0.8
520 0.79
521 0.81
522 0.77
523 0.75
524 0.71
525 0.66
526 0.62
527 0.56
528 0.5
529 0.4
530 0.34
531 0.25
532 0.2
533 0.17
534 0.16
535 0.16
536 0.17
537 0.18
538 0.18
539 0.22
540 0.23
541 0.25
542 0.22
543 0.2
544 0.23
545 0.22
546 0.28
547 0.25
548 0.27
549 0.28
550 0.32
551 0.33
552 0.29
553 0.3
554 0.24
555 0.25
556 0.26
557 0.27
558 0.26
559 0.29
560 0.32
561 0.3
562 0.29
563 0.27
564 0.23
565 0.18
566 0.13
567 0.1
568 0.07
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.06
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.07
603 0.09
604 0.09
605 0.08
606 0.12
607 0.11
608 0.12
609 0.13
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.11
618 0.11
619 0.12
620 0.12
621 0.15
622 0.16
623 0.22
624 0.25
625 0.24
626 0.28
627 0.29
628 0.28
629 0.29
630 0.28
631 0.25
632 0.23
633 0.24
634 0.23
635 0.22
636 0.23
637 0.18
638 0.18
639 0.15
640 0.16
641 0.16
642 0.13
643 0.13
644 0.15
645 0.18
646 0.18
647 0.19
648 0.18
649 0.18
650 0.21
651 0.21
652 0.21
653 0.18
654 0.19
655 0.22
656 0.28
657 0.32
658 0.37
659 0.39
660 0.4
661 0.4
662 0.4
663 0.37
664 0.3
665 0.23
666 0.16
667 0.13
668 0.1
669 0.09
670 0.07
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.07
681 0.13
682 0.16
683 0.19
684 0.19
685 0.2
686 0.2
687 0.21
688 0.28
689 0.23
690 0.23
691 0.2
692 0.23
693 0.22
694 0.22
695 0.21
696 0.13
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.09
701 0.09
702 0.09
703 0.1
704 0.12
705 0.14
706 0.13
707 0.13
708 0.12
709 0.13
710 0.18
711 0.17
712 0.17
713 0.16
714 0.14
715 0.15
716 0.15
717 0.18
718 0.15
719 0.15
720 0.14
721 0.22
722 0.24
723 0.24
724 0.3
725 0.34
726 0.37
727 0.4
728 0.41
729 0.35
730 0.36
731 0.35
732 0.3
733 0.25
734 0.22
735 0.2
736 0.18
737 0.16
738 0.14
739 0.16
740 0.17
741 0.15
742 0.21
743 0.22
744 0.25
745 0.26
746 0.26
747 0.24
748 0.26
749 0.29
750 0.27
751 0.26
752 0.31
753 0.33
754 0.36
755 0.42
756 0.4
757 0.41
758 0.4
759 0.43
760 0.36
761 0.35
762 0.37
763 0.32
764 0.34
765 0.28
766 0.29
767 0.25
768 0.28
769 0.26
770 0.21
771 0.22
772 0.21
773 0.22
774 0.2
775 0.19
776 0.18
777 0.21
778 0.25
779 0.23
780 0.21
781 0.2
782 0.2
783 0.18
784 0.16
785 0.12
786 0.07
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.07
791 0.09
792 0.1
793 0.11
794 0.11
795 0.13
796 0.16
797 0.21
798 0.25
799 0.28
800 0.29
801 0.32
802 0.32
803 0.3
804 0.3
805 0.27
806 0.22
807 0.25
808 0.26
809 0.29
810 0.35
811 0.38
812 0.39
813 0.39
814 0.4
815 0.37
816 0.36
817 0.34
818 0.29
819 0.27
820 0.23
821 0.27
822 0.28
823 0.31
824 0.35
825 0.33
826 0.33
827 0.34
828 0.36
829 0.37
830 0.39
831 0.38
832 0.3
833 0.3
834 0.3
835 0.28
836 0.27
837 0.22
838 0.2
839 0.23
840 0.26
841 0.25
842 0.27
843 0.3
844 0.29
845 0.29
846 0.26
847 0.23