Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MH15

Protein Details
Accession C5MH15    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33IHAKSEAKIFWKKEKKKKTKNINSFNIINPHydrophilic
90-109KDLGTNKKWNQKRIDKKVSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-23WKKEKKKKTK
96-106KKWNQKRIDKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 6.833, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ctp:CTRG_05369  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MRYIHAKSEAKIFWKKEKKKKTKNINSFNIINPFESGQSYMLLRRMNGVFAVYKPSGITSAKFIDKIQDKFTKSGVFAKDLQEMKEKIRKDLGTNKKWNQKRIDKKVSSAKIKIGHGGTLDPLASGVLVVGIGLGTKKLQYYLAECQKTYETKALLGISTTTGDSEGEIITQNKIDHITKELIDETVQKFIGNIKQTPPIFSALKVNGKPLYEYAREGLPLPTSIKVRDVTVNDIKVIEEDSLKTDHEFVKLQSELDENGVPKEHGLMNNPTLNDSPLYFSSQYLERAEKENLPKEVGKARLLPDGESLPEKLPMIHFVSDVSSGTYIRSLISDIGRAMESSAYMVELIRVKQSEWKLDQNVFKIEDFDRDEKVWGPVLKKVFDEGGDKIIDLQKEFEEMTKQVEQEEKEQGEVGEQDGDKDQSIPQKRPIDDVEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.72
3 0.74
4 0.81
5 0.85
6 0.88
7 0.94
8 0.94
9 0.95
10 0.95
11 0.95
12 0.94
13 0.89
14 0.82
15 0.77
16 0.73
17 0.63
18 0.53
19 0.44
20 0.35
21 0.29
22 0.26
23 0.22
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.19
29 0.2
30 0.19
31 0.23
32 0.23
33 0.22
34 0.21
35 0.21
36 0.19
37 0.18
38 0.25
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.17
47 0.22
48 0.24
49 0.25
50 0.25
51 0.3
52 0.36
53 0.38
54 0.41
55 0.43
56 0.44
57 0.45
58 0.48
59 0.43
60 0.37
61 0.42
62 0.37
63 0.34
64 0.33
65 0.35
66 0.39
67 0.36
68 0.37
69 0.37
70 0.35
71 0.38
72 0.41
73 0.39
74 0.35
75 0.41
76 0.4
77 0.4
78 0.49
79 0.53
80 0.58
81 0.66
82 0.7
83 0.72
84 0.76
85 0.78
86 0.77
87 0.77
88 0.78
89 0.8
90 0.83
91 0.76
92 0.78
93 0.8
94 0.78
95 0.75
96 0.67
97 0.62
98 0.57
99 0.55
100 0.53
101 0.44
102 0.36
103 0.29
104 0.27
105 0.22
106 0.16
107 0.15
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.02
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.09
128 0.13
129 0.22
130 0.31
131 0.32
132 0.32
133 0.33
134 0.35
135 0.35
136 0.33
137 0.28
138 0.2
139 0.18
140 0.21
141 0.19
142 0.16
143 0.15
144 0.13
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.14
165 0.16
166 0.14
167 0.16
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.18
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.24
183 0.24
184 0.26
185 0.25
186 0.24
187 0.22
188 0.21
189 0.23
190 0.2
191 0.26
192 0.24
193 0.25
194 0.23
195 0.23
196 0.23
197 0.2
198 0.21
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.17
216 0.17
217 0.21
218 0.23
219 0.23
220 0.21
221 0.21
222 0.19
223 0.16
224 0.15
225 0.1
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.14
244 0.15
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.14
254 0.17
255 0.19
256 0.22
257 0.22
258 0.22
259 0.2
260 0.19
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.11
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.16
270 0.19
271 0.18
272 0.19
273 0.17
274 0.21
275 0.23
276 0.26
277 0.3
278 0.33
279 0.32
280 0.33
281 0.33
282 0.32
283 0.36
284 0.34
285 0.3
286 0.28
287 0.28
288 0.3
289 0.3
290 0.28
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.19
295 0.18
296 0.14
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.11
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.22
340 0.25
341 0.31
342 0.33
343 0.4
344 0.42
345 0.47
346 0.51
347 0.48
348 0.5
349 0.44
350 0.39
351 0.35
352 0.31
353 0.31
354 0.32
355 0.31
356 0.29
357 0.28
358 0.29
359 0.28
360 0.29
361 0.28
362 0.26
363 0.26
364 0.28
365 0.31
366 0.32
367 0.31
368 0.31
369 0.27
370 0.26
371 0.27
372 0.24
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.22
377 0.24
378 0.23
379 0.2
380 0.2
381 0.17
382 0.18
383 0.19
384 0.18
385 0.18
386 0.18
387 0.23
388 0.24
389 0.24
390 0.24
391 0.29
392 0.3
393 0.3
394 0.38
395 0.33
396 0.3
397 0.31
398 0.28
399 0.26
400 0.24
401 0.2
402 0.18
403 0.17
404 0.18
405 0.19
406 0.21
407 0.19
408 0.19
409 0.21
410 0.25
411 0.32
412 0.36
413 0.42
414 0.5
415 0.5
416 0.55