Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5MSX2

Protein Details
Accession A0A5N5MSX2    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-284APQPRIKLVKPPKPPKTPKTPKPRISLPPHydrophilic
456-479QASQAKPEKKSMRKRKRDSVAETDHydrophilic
707-728AALPARPVSRRQQKRPAPGVVSHydrophilic
735-754KSAVGRRKAAPKKKNAAASKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-279PRIKLVKPPKPPKTPKTPKPR
409-418RRPLKPKPSK
461-472KPEKKSMRKRKR
709-752LPARPVSRRQQKRPAPGVVSRTNSGGKSAVGRRKAAPKKKNAAA
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028651  ING_fam  
IPR024610  ING_N_histone-binding  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15505  PHD_ING  
Amino Acid Sequences MGSAAPVAAELDEALSPRQTTSNVDKAIHDSPTTTRAVSNALDSINMRADPDAQATVTDFLDFTEYLPSDMMRSLTLIGKLDERYLDASANLNDLATTWGQLPALPQDKRPLPVQLRAQISENLGDAVSARVSSHAEARRMVENVTKHAHRAKSILSKLIALRDNWPPPEEQKSPVATRSPQMTRGSKVTIRGDGQKVRRQQVPRITVPGEVLAPYELNYETYGSGSESSSEEADEPASPPPTVSRAPSRVTNTPAPQPRIKLVKPPKPPKTPKTPKPRISLPPPASVPELSTAKVLANLQPPPDNAVPGSADAPWLQLTTYELAKLRKRMKKNAAWAPSDTMVARELKTLGRGAEAYNAAKRKAEEEGVPFEYQVPAPVVDDSTGAMVMPQGALSMETATVEEKSLSRRPLKPKPSKKDDLARLAAEEAEASARKMMEAAKAMFTPSHPPSITEQASQAKPEKKSMRKRKRDSVAETDAEKPDGLEIHAQRPPLKRNKTETPVPHPLLGSNATPQPSQETGVQQQHLNPNAATAVMRTTPVPVPIPGQDQSAKTQPAASPASVTNENASTGIAAPTPARPPTETPIPPPVRSTSPRKSSTPILPPIPPIRETRKSQAARLQEQQQTSNPTSASSTKPPSRPASSAGRAATPAVEATEASQSGTSGPTTRRPASRGKAASQEPLPSLASDRPRRASTARNTPAPPEAALPARPVSRRQQKRPAPGVVSRTNSGGKSAVGRRKAAPKKKNAAASKAGGIVLEVDDEGQDVDPNEPRYCICNGVSFGTMIQCDNDTCDKEWFHLECVGLPDVPARTTKWYCPDCRVRLKIGEKGEITARGVKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.11
4 0.12
5 0.14
6 0.14
7 0.2
8 0.27
9 0.35
10 0.37
11 0.39
12 0.39
13 0.42
14 0.45
15 0.41
16 0.33
17 0.27
18 0.26
19 0.29
20 0.29
21 0.24
22 0.21
23 0.2
24 0.23
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.18
29 0.19
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.15
36 0.17
37 0.17
38 0.19
39 0.17
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.15
45 0.14
46 0.11
47 0.1
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.2
67 0.2
68 0.21
69 0.2
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.15
75 0.17
76 0.16
77 0.17
78 0.15
79 0.13
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.18
91 0.26
92 0.26
93 0.28
94 0.35
95 0.39
96 0.41
97 0.42
98 0.44
99 0.4
100 0.47
101 0.53
102 0.52
103 0.53
104 0.52
105 0.52
106 0.45
107 0.42
108 0.35
109 0.28
110 0.21
111 0.16
112 0.14
113 0.12
114 0.1
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.1
121 0.18
122 0.22
123 0.24
124 0.26
125 0.29
126 0.31
127 0.31
128 0.31
129 0.29
130 0.26
131 0.29
132 0.33
133 0.31
134 0.31
135 0.37
136 0.39
137 0.35
138 0.36
139 0.38
140 0.42
141 0.44
142 0.45
143 0.39
144 0.4
145 0.39
146 0.43
147 0.39
148 0.3
149 0.31
150 0.34
151 0.38
152 0.36
153 0.35
154 0.31
155 0.32
156 0.38
157 0.37
158 0.32
159 0.33
160 0.37
161 0.38
162 0.39
163 0.4
164 0.34
165 0.36
166 0.4
167 0.37
168 0.38
169 0.43
170 0.43
171 0.42
172 0.44
173 0.46
174 0.4
175 0.44
176 0.41
177 0.39
178 0.38
179 0.41
180 0.44
181 0.46
182 0.51
183 0.51
184 0.54
185 0.55
186 0.59
187 0.56
188 0.58
189 0.6
190 0.6
191 0.57
192 0.56
193 0.52
194 0.46
195 0.42
196 0.36
197 0.26
198 0.19
199 0.16
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.18
232 0.23
233 0.26
234 0.29
235 0.35
236 0.39
237 0.39
238 0.43
239 0.46
240 0.42
241 0.46
242 0.5
243 0.5
244 0.47
245 0.45
246 0.46
247 0.48
248 0.45
249 0.48
250 0.51
251 0.55
252 0.62
253 0.7
254 0.74
255 0.77
256 0.85
257 0.82
258 0.83
259 0.85
260 0.83
261 0.84
262 0.86
263 0.83
264 0.81
265 0.82
266 0.78
267 0.75
268 0.77
269 0.69
270 0.65
271 0.58
272 0.53
273 0.46
274 0.38
275 0.31
276 0.25
277 0.22
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.16
286 0.17
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.23
291 0.23
292 0.2
293 0.15
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.11
311 0.16
312 0.19
313 0.27
314 0.35
315 0.41
316 0.47
317 0.56
318 0.63
319 0.66
320 0.72
321 0.74
322 0.71
323 0.66
324 0.61
325 0.54
326 0.45
327 0.38
328 0.29
329 0.2
330 0.15
331 0.14
332 0.13
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.15
351 0.16
352 0.17
353 0.15
354 0.17
355 0.21
356 0.23
357 0.22
358 0.21
359 0.19
360 0.18
361 0.15
362 0.13
363 0.09
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.02
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.1
393 0.13
394 0.17
395 0.22
396 0.29
397 0.37
398 0.46
399 0.56
400 0.63
401 0.7
402 0.75
403 0.79
404 0.78
405 0.75
406 0.75
407 0.71
408 0.67
409 0.59
410 0.5
411 0.41
412 0.36
413 0.3
414 0.21
415 0.14
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.15
434 0.14
435 0.17
436 0.16
437 0.17
438 0.2
439 0.27
440 0.27
441 0.22
442 0.24
443 0.25
444 0.25
445 0.26
446 0.29
447 0.27
448 0.27
449 0.35
450 0.41
451 0.45
452 0.56
453 0.65
454 0.7
455 0.76
456 0.83
457 0.85
458 0.86
459 0.85
460 0.81
461 0.78
462 0.73
463 0.64
464 0.59
465 0.52
466 0.42
467 0.34
468 0.27
469 0.18
470 0.12
471 0.1
472 0.09
473 0.11
474 0.12
475 0.16
476 0.18
477 0.19
478 0.23
479 0.27
480 0.34
481 0.39
482 0.44
483 0.46
484 0.52
485 0.59
486 0.6
487 0.64
488 0.62
489 0.61
490 0.63
491 0.58
492 0.52
493 0.44
494 0.39
495 0.33
496 0.29
497 0.21
498 0.14
499 0.15
500 0.15
501 0.15
502 0.14
503 0.16
504 0.15
505 0.16
506 0.16
507 0.18
508 0.22
509 0.26
510 0.27
511 0.24
512 0.27
513 0.3
514 0.31
515 0.28
516 0.22
517 0.19
518 0.18
519 0.17
520 0.14
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.07
526 0.1
527 0.1
528 0.12
529 0.13
530 0.12
531 0.14
532 0.15
533 0.19
534 0.17
535 0.19
536 0.19
537 0.2
538 0.22
539 0.25
540 0.24
541 0.2
542 0.22
543 0.2
544 0.23
545 0.24
546 0.21
547 0.18
548 0.18
549 0.22
550 0.2
551 0.2
552 0.16
553 0.14
554 0.15
555 0.12
556 0.12
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.06
561 0.06
562 0.07
563 0.09
564 0.11
565 0.12
566 0.13
567 0.15
568 0.18
569 0.22
570 0.31
571 0.3
572 0.32
573 0.41
574 0.43
575 0.42
576 0.41
577 0.4
578 0.37
579 0.41
580 0.46
581 0.45
582 0.5
583 0.54
584 0.54
585 0.54
586 0.54
587 0.57
588 0.56
589 0.53
590 0.48
591 0.45
592 0.47
593 0.48
594 0.45
595 0.39
596 0.36
597 0.38
598 0.42
599 0.46
600 0.48
601 0.53
602 0.52
603 0.55
604 0.56
605 0.56
606 0.54
607 0.55
608 0.56
609 0.51
610 0.5
611 0.49
612 0.46
613 0.44
614 0.4
615 0.37
616 0.29
617 0.25
618 0.26
619 0.26
620 0.26
621 0.26
622 0.32
623 0.36
624 0.4
625 0.45
626 0.48
627 0.51
628 0.48
629 0.47
630 0.49
631 0.46
632 0.48
633 0.43
634 0.37
635 0.33
636 0.31
637 0.26
638 0.18
639 0.14
640 0.09
641 0.08
642 0.07
643 0.08
644 0.1
645 0.1
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.13
654 0.2
655 0.27
656 0.31
657 0.34
658 0.37
659 0.45
660 0.49
661 0.56
662 0.54
663 0.51
664 0.55
665 0.53
666 0.56
667 0.49
668 0.45
669 0.36
670 0.34
671 0.31
672 0.23
673 0.23
674 0.23
675 0.3
676 0.34
677 0.38
678 0.41
679 0.42
680 0.46
681 0.47
682 0.51
683 0.5
684 0.54
685 0.55
686 0.57
687 0.56
688 0.55
689 0.56
690 0.48
691 0.4
692 0.31
693 0.28
694 0.24
695 0.24
696 0.24
697 0.23
698 0.25
699 0.26
700 0.29
701 0.36
702 0.44
703 0.53
704 0.6
705 0.68
706 0.73
707 0.81
708 0.85
709 0.83
710 0.78
711 0.74
712 0.73
713 0.69
714 0.65
715 0.55
716 0.5
717 0.45
718 0.39
719 0.35
720 0.28
721 0.22
722 0.25
723 0.32
724 0.37
725 0.38
726 0.41
727 0.44
728 0.54
729 0.63
730 0.66
731 0.67
732 0.7
733 0.75
734 0.79
735 0.84
736 0.8
737 0.77
738 0.73
739 0.67
740 0.59
741 0.52
742 0.45
743 0.35
744 0.28
745 0.22
746 0.15
747 0.12
748 0.08
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.07
753 0.06
754 0.07
755 0.07
756 0.1
757 0.15
758 0.19
759 0.19
760 0.2
761 0.21
762 0.23
763 0.24
764 0.26
765 0.23
766 0.25
767 0.26
768 0.28
769 0.28
770 0.25
771 0.24
772 0.22
773 0.21
774 0.16
775 0.15
776 0.13
777 0.13
778 0.17
779 0.21
780 0.22
781 0.24
782 0.28
783 0.27
784 0.29
785 0.35
786 0.33
787 0.3
788 0.31
789 0.29
790 0.27
791 0.3
792 0.3
793 0.22
794 0.21
795 0.21
796 0.19
797 0.2
798 0.19
799 0.18
800 0.24
801 0.28
802 0.34
803 0.41
804 0.47
805 0.51
806 0.59
807 0.67
808 0.68
809 0.74
810 0.74
811 0.7
812 0.72
813 0.74
814 0.71
815 0.67
816 0.66
817 0.56
818 0.54
819 0.52
820 0.45
821 0.42