Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5LM86

Protein Details
Accession A0A5N5LM86    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSEYWKSTPKYWCKHCQIYVRDSKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-192KKPKRW
299-306KKRKSKKH
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPKYWCKHCQIYVRDSKLERANHEATGKHQGAIKRSLRDLHRNHEQAEREKDRAKREIERLNGVVSGTKPSTGFRTPGANASSSSAGGGGGSQTMTKEEQQRQLEQLAGLGVNIPTELRPELALAGEWTVTSTRVVKDPDNEDSKDLTDPSGRAAGVRKREREKTEEEKEEEDALKSLFKKPKRWGRETKSMPTERDDELDQLLSGTIVKAKKEEEEDVKVKPDPELETKTEDDVPQDTAAPDPLKQEEAKDVPPLIKHESTGDVGGLSSDVPSAPGVQSEASAAQPAVVFKKRKSKKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.82
4 0.79
5 0.79
6 0.8
7 0.76
8 0.73
9 0.65
10 0.64
11 0.62
12 0.6
13 0.54
14 0.51
15 0.48
16 0.45
17 0.47
18 0.41
19 0.37
20 0.42
21 0.38
22 0.32
23 0.33
24 0.33
25 0.34
26 0.43
27 0.45
28 0.4
29 0.42
30 0.47
31 0.5
32 0.57
33 0.58
34 0.56
35 0.6
36 0.59
37 0.59
38 0.59
39 0.58
40 0.56
41 0.6
42 0.58
43 0.52
44 0.55
45 0.58
46 0.58
47 0.59
48 0.56
49 0.54
50 0.57
51 0.61
52 0.59
53 0.6
54 0.54
55 0.48
56 0.43
57 0.35
58 0.29
59 0.21
60 0.21
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.2
66 0.2
67 0.21
68 0.18
69 0.24
70 0.23
71 0.28
72 0.28
73 0.24
74 0.22
75 0.23
76 0.22
77 0.17
78 0.16
79 0.11
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.06
89 0.08
90 0.11
91 0.18
92 0.23
93 0.31
94 0.34
95 0.36
96 0.36
97 0.36
98 0.34
99 0.26
100 0.22
101 0.14
102 0.11
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.17
132 0.2
133 0.24
134 0.27
135 0.27
136 0.25
137 0.24
138 0.23
139 0.2
140 0.17
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.14
149 0.17
150 0.26
151 0.31
152 0.36
153 0.39
154 0.46
155 0.49
156 0.5
157 0.53
158 0.53
159 0.55
160 0.55
161 0.52
162 0.47
163 0.44
164 0.42
165 0.34
166 0.26
167 0.18
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.19
172 0.23
173 0.27
174 0.34
175 0.43
176 0.53
177 0.59
178 0.67
179 0.7
180 0.72
181 0.79
182 0.78
183 0.77
184 0.77
185 0.72
186 0.65
187 0.57
188 0.53
189 0.43
190 0.38
191 0.31
192 0.22
193 0.19
194 0.18
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.15
207 0.19
208 0.24
209 0.25
210 0.31
211 0.33
212 0.33
213 0.36
214 0.34
215 0.31
216 0.27
217 0.25
218 0.21
219 0.25
220 0.29
221 0.28
222 0.31
223 0.31
224 0.33
225 0.32
226 0.28
227 0.24
228 0.21
229 0.2
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.13
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.23
243 0.25
244 0.27
245 0.27
246 0.27
247 0.27
248 0.29
249 0.31
250 0.3
251 0.28
252 0.27
253 0.26
254 0.28
255 0.27
256 0.25
257 0.21
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.11
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.18
283 0.25
284 0.29
285 0.33
286 0.44