Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M5H4

Protein Details
Accession C5M5H4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42TTYMRNSLPRAAKKRFFKPEDVKSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014905  HIRAN  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016818  F:hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ctp:CTRG_01104  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08797  HIRAN  
PF00176  SNF2-rel_dom  
Amino Acid Sequences MYRVPSRQVSFHNDNITTYMRNSLPRAAKKRFFKPEDVKSSSDEPDEEQPSYPSDHSDSLFVQDDDDDEEEEEVEVKQQQAETSKSSRISHYHFKKELTQNVGEVSQSIINYLYDKYSQKQNPVVFAVSELLTNPPDPSDLPRAPENPPKRASRDSSFTDSSIPSQLQSPRKRIKVTEFIKEFNKSPSQEQEEEKEKEEEDVWERFIGTMNSSAMATRPTMKPLKYQEELELRRIVPKNTTMMKSTYVRIYHKDREIGKVPEEMARILTPLIDLKIASFKAKILEETRSRLSIGDTFFIEIEVNLCNMGFVKNFDAIENPVDMKKSNFNFSKESEGEATLRLRQSSLASLFDRLRIRPLKIMDDDDEAEEEIIEVDSDSDSKSEDQPISELNLDQLREFYSSNNQLRILEGLPETTTPPKENFKLDLRGYQKHGLSWMLAREKELDVLEMISNDDKLSTQARSELESLGSVNPLWRKYRWPDSQQDSQDPTQSQTEKYFYANMYNGELSLEKPVIKSSLRGGILADEMGLGKTISTLALINSVPYDNSPQLLKPKKPYASRTTLIVVPMSLLSQWKSEFEKCNTNRAHFCRLHYGDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.46
3 0.43
4 0.35
5 0.3
6 0.3
7 0.25
8 0.29
9 0.3
10 0.36
11 0.42
12 0.5
13 0.58
14 0.62
15 0.68
16 0.73
17 0.8
18 0.82
19 0.79
20 0.79
21 0.8
22 0.82
23 0.83
24 0.8
25 0.71
26 0.65
27 0.64
28 0.56
29 0.48
30 0.38
31 0.31
32 0.34
33 0.35
34 0.32
35 0.28
36 0.27
37 0.26
38 0.29
39 0.26
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.22
44 0.24
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.23
49 0.2
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.14
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.18
68 0.21
69 0.25
70 0.27
71 0.31
72 0.34
73 0.36
74 0.38
75 0.39
76 0.43
77 0.48
78 0.53
79 0.58
80 0.58
81 0.59
82 0.64
83 0.67
84 0.67
85 0.63
86 0.56
87 0.47
88 0.45
89 0.43
90 0.33
91 0.25
92 0.19
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.14
102 0.16
103 0.19
104 0.28
105 0.32
106 0.36
107 0.43
108 0.43
109 0.44
110 0.44
111 0.42
112 0.32
113 0.3
114 0.26
115 0.18
116 0.16
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.15
126 0.21
127 0.22
128 0.25
129 0.29
130 0.31
131 0.35
132 0.44
133 0.45
134 0.44
135 0.48
136 0.5
137 0.52
138 0.56
139 0.57
140 0.54
141 0.54
142 0.52
143 0.54
144 0.5
145 0.45
146 0.41
147 0.35
148 0.31
149 0.27
150 0.22
151 0.16
152 0.18
153 0.25
154 0.32
155 0.37
156 0.45
157 0.5
158 0.56
159 0.59
160 0.58
161 0.59
162 0.61
163 0.58
164 0.59
165 0.54
166 0.51
167 0.52
168 0.51
169 0.44
170 0.39
171 0.4
172 0.32
173 0.33
174 0.37
175 0.39
176 0.4
177 0.41
178 0.42
179 0.44
180 0.44
181 0.43
182 0.37
183 0.3
184 0.28
185 0.26
186 0.23
187 0.19
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.14
193 0.15
194 0.13
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.16
207 0.21
208 0.21
209 0.28
210 0.34
211 0.4
212 0.38
213 0.39
214 0.4
215 0.45
216 0.47
217 0.43
218 0.4
219 0.33
220 0.37
221 0.38
222 0.33
223 0.26
224 0.26
225 0.29
226 0.3
227 0.31
228 0.26
229 0.26
230 0.29
231 0.28
232 0.28
233 0.26
234 0.25
235 0.26
236 0.28
237 0.34
238 0.36
239 0.37
240 0.42
241 0.38
242 0.4
243 0.44
244 0.41
245 0.36
246 0.32
247 0.29
248 0.26
249 0.25
250 0.2
251 0.16
252 0.13
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.13
271 0.18
272 0.2
273 0.23
274 0.24
275 0.22
276 0.22
277 0.2
278 0.2
279 0.17
280 0.16
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.15
312 0.16
313 0.22
314 0.25
315 0.27
316 0.3
317 0.31
318 0.37
319 0.31
320 0.31
321 0.25
322 0.23
323 0.21
324 0.19
325 0.19
326 0.15
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.17
337 0.18
338 0.22
339 0.23
340 0.2
341 0.25
342 0.25
343 0.26
344 0.28
345 0.3
346 0.3
347 0.3
348 0.33
349 0.27
350 0.27
351 0.26
352 0.22
353 0.2
354 0.15
355 0.13
356 0.1
357 0.08
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.07
369 0.08
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.13
374 0.14
375 0.15
376 0.15
377 0.13
378 0.11
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.16
388 0.25
389 0.27
390 0.29
391 0.28
392 0.27
393 0.28
394 0.28
395 0.22
396 0.16
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.18
406 0.23
407 0.25
408 0.28
409 0.31
410 0.33
411 0.39
412 0.38
413 0.43
414 0.43
415 0.45
416 0.46
417 0.47
418 0.42
419 0.36
420 0.36
421 0.29
422 0.25
423 0.23
424 0.24
425 0.24
426 0.23
427 0.23
428 0.24
429 0.24
430 0.25
431 0.22
432 0.17
433 0.12
434 0.14
435 0.13
436 0.11
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.15
448 0.16
449 0.19
450 0.2
451 0.19
452 0.17
453 0.17
454 0.17
455 0.13
456 0.13
457 0.1
458 0.13
459 0.15
460 0.18
461 0.21
462 0.21
463 0.28
464 0.35
465 0.45
466 0.51
467 0.55
468 0.61
469 0.65
470 0.72
471 0.71
472 0.7
473 0.65
474 0.58
475 0.56
476 0.47
477 0.43
478 0.41
479 0.37
480 0.33
481 0.31
482 0.32
483 0.28
484 0.29
485 0.3
486 0.24
487 0.28
488 0.27
489 0.25
490 0.25
491 0.24
492 0.22
493 0.19
494 0.19
495 0.14
496 0.16
497 0.15
498 0.13
499 0.13
500 0.15
501 0.17
502 0.17
503 0.19
504 0.19
505 0.26
506 0.26
507 0.26
508 0.25
509 0.23
510 0.23
511 0.21
512 0.17
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.11
531 0.12
532 0.17
533 0.15
534 0.17
535 0.18
536 0.2
537 0.3
538 0.39
539 0.44
540 0.48
541 0.56
542 0.63
543 0.69
544 0.74
545 0.73
546 0.73
547 0.69
548 0.64
549 0.59
550 0.53
551 0.46
552 0.39
553 0.29
554 0.21
555 0.2
556 0.16
557 0.13
558 0.13
559 0.12
560 0.14
561 0.15
562 0.18
563 0.23
564 0.29
565 0.36
566 0.39
567 0.49
568 0.48
569 0.57
570 0.59
571 0.61
572 0.65
573 0.63
574 0.68
575 0.61
576 0.64
577 0.65