FuNGI

C5M3M4

Protein Details

Accession

C5M3M4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
398-431	DVVIVKKHYARKSKKSKNRKWKLKRMAREHNDIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
403-424	KKHYARKSKKSKNRKWKLKRMA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	ctp:CTRG_00663 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSNYTQMTPANQDGGAQMATVLCCNCGVPMDGSQGLVMCYDCIKLNVDITEGIPREANVSFCRNCERFLQPPGQWIKAQLESRELLALCLRRLKGLNKVRLVDASFIWTEPHSRRIRVKLTVQGEAMANTIVQQTFEVEYVVIAMQCPDCAKSYTTNTWRATVQIRQKVPHKRTFLYLEQLILKHNAHVDTVSIQESRDGLDFFYAQKNHAAKMVDFLQAVAPIKVKKSEELVSMDIHSGSSSYKFSYSVEIAPICRDDLVVLPKKLAHSMGNISRLVLCNKVTNSIQFIDSNTLQIADLSAPVYFRSPFPSLLDATQLVEFVVLDVEPTGDIRGKYVLADIEVCRASDMGSNDQSFYVRTHLGGILHPGDSCLGYYLSNTNLNSDLWDTLDTDNTPDVVIVKKHYARKSKKSKNRKWKLKRMAREHNDIVANDDSRQARQEQEKAERDYELFLQELEEDEELRQTINLYKAGEEAPRKEVDEMDDEDDEDAPEIAIDELLDELDDMTLDDTPMNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.18
3	0.13
4	0.11
5	0.1
6	0.1
7	0.11
8	0.11
9	0.09
10	0.09
11	0.1
12	0.1
13	0.1
14	0.12
15	0.12
16	0.15
17	0.19
18	0.19
19	0.19
20	0.19
21	0.18
22	0.16
23	0.15
24	0.12
25	0.08
26	0.08
27	0.09
28	0.1
29	0.11
30	0.13
31	0.14
32	0.17
33	0.17
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.23
38	0.21
39	0.2
40	0.18
41	0.17
42	0.18
43	0.19
44	0.2
45	0.17
46	0.24
47	0.24
48	0.27
49	0.35
50	0.33
51	0.34
52	0.37
53	0.39
54	0.38
55	0.43
56	0.49
57	0.42
58	0.49
59	0.52
60	0.5
61	0.44
62	0.41
63	0.4
64	0.39
65	0.42
66	0.35
67	0.34
68	0.31
69	0.31
70	0.32
71	0.27
72	0.21
73	0.21
74	0.22
75	0.2
76	0.25
77	0.25
78	0.24
79	0.28
80	0.31
81	0.37
82	0.44
83	0.51
84	0.5
85	0.52
86	0.5
87	0.5
88	0.48
89	0.4
90	0.31
91	0.26
92	0.21
93	0.19
94	0.18
95	0.15
96	0.18
97	0.19
98	0.27
99	0.27
100	0.32
101	0.38
102	0.45
103	0.52
104	0.53
105	0.57
106	0.56
107	0.56
108	0.55
109	0.48
110	0.42
111	0.36
112	0.3
113	0.24
114	0.16
115	0.11
116	0.08
117	0.1
118	0.08
119	0.07
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.08
129	0.06
130	0.05
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.09
137	0.1
138	0.12
139	0.16
140	0.21
141	0.3
142	0.35
143	0.42
144	0.42
145	0.42
146	0.41
147	0.39
148	0.37
149	0.36
150	0.39
151	0.39
152	0.4
153	0.43
154	0.5
155	0.58
156	0.61
157	0.62
158	0.59
159	0.52
160	0.55
161	0.57
162	0.52
163	0.48
164	0.42
165	0.35
166	0.32
167	0.31
168	0.27
169	0.23
170	0.2
171	0.15
172	0.16
173	0.14
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.1
178	0.11
179	0.12
180	0.1
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.09
187	0.07
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.14
192	0.14
193	0.13
194	0.19
195	0.2
196	0.19
197	0.22
198	0.22
199	0.17
200	0.2
201	0.22
202	0.18
203	0.17
204	0.17
205	0.14
206	0.14
207	0.15
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.14
213	0.14
214	0.13
215	0.16
216	0.18
217	0.19
218	0.22
219	0.22
220	0.2
221	0.2
222	0.19
223	0.15
224	0.13
225	0.1
226	0.07
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.11
235	0.12
236	0.11
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.1
243	0.08
244	0.07
245	0.06
246	0.07
247	0.13
248	0.18
249	0.17
250	0.18
251	0.19
252	0.19
253	0.2
254	0.19
255	0.13
256	0.11
257	0.15
258	0.18
259	0.21
260	0.2
261	0.2
262	0.19
263	0.2
264	0.19
265	0.16
266	0.13
267	0.13
268	0.14
269	0.16
270	0.16
271	0.15
272	0.17
273	0.16
274	0.17
275	0.14
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.12
281	0.11
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.12
295	0.13
296	0.14
297	0.16
298	0.18
299	0.18
300	0.18
301	0.19
302	0.15
303	0.14
304	0.13
305	0.11
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.05
310	0.05
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.04
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.09
326	0.08
327	0.1
328	0.1
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.14
337	0.15
338	0.18
339	0.18
340	0.19
341	0.19
342	0.19
343	0.17
344	0.15
345	0.14
346	0.11
347	0.11
348	0.12
349	0.13
350	0.14
351	0.14
352	0.16
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.11
366	0.15
367	0.15
368	0.15
369	0.16
370	0.16
371	0.16
372	0.16
373	0.14
374	0.11
375	0.12
376	0.12
377	0.11
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.19
390	0.25
391	0.33
392	0.4
393	0.5
394	0.57
395	0.66
396	0.75
397	0.79
398	0.84
399	0.88
400	0.92
401	0.93
402	0.95
403	0.95
404	0.95
405	0.95
406	0.96
407	0.95
408	0.94
409	0.93
410	0.93
411	0.89
412	0.86
413	0.78
414	0.73
415	0.66
416	0.56
417	0.5
418	0.42
419	0.36
420	0.27
421	0.3
422	0.25
423	0.22
424	0.24
425	0.22
426	0.25
427	0.31
428	0.37
429	0.39
430	0.48
431	0.54
432	0.57
433	0.57
434	0.52
435	0.46
436	0.42
437	0.36
438	0.28
439	0.21
440	0.16
441	0.15
442	0.13
443	0.14
444	0.13
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.12
449	0.11
450	0.11
451	0.1
452	0.09
453	0.14
454	0.17
455	0.19
456	0.19
457	0.19
458	0.21
459	0.23
460	0.29
461	0.29
462	0.29
463	0.31
464	0.32
465	0.33
466	0.32
467	0.32
468	0.29
469	0.29
470	0.29
471	0.28
472	0.26
473	0.25
474	0.25
475	0.23
476	0.2
477	0.15
478	0.12
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.07

C5M3M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer