Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PMD4

Protein Details
Accession A0A5N5PMD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-102YDTDSRRSGERNRSKPRNGRGPVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
833-840GKKNVKKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008936  Rho_GTPase_activation_prot  
IPR000198  RhoGAP_dom  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0007165  P:signal transduction  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PF00620  RhoGAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
PS50238  RHOGAP  
CDD cd09391  LIM1_Lrg1p_like  
cd09392  LIM2_Lrg1p_like  
Amino Acid Sequences MNGPDYGSGIGRGNDHDRDPSRDRDPNHGHHHGHPPPHNQELPYQDDGDIVARQNGAPFANQHGRPPGSPALSAADREYDTDSRRSGERNRSKPRNGRGPVVQVRTCRKCGEPLTGQFVRALDGTFHLDCFKCRDCGVIVASKFFPADDENGEGQYPLCETDYFRRLGLLCHKCGGALRGSYITALERKYHVEHFTCSLCTTVFGAQDSYYEHEGEVYCHYHYSTQFAQRCSGCKTAILKQFVEIFRNGQNQHWHPECYMIHKFWNVKLNPPQDALLEPNHDDPETRQAVKKAEELMEEKVYRIWSVLSTFEESSAACISDMLLHVSNGAYVEGVMVAKKFMWHVDILFRSADRLEATTQRLEMKGMSYGREAKLLCKKIVAFFSLLSKTQDGAGRKLGVTQDLLTLVTGLAHYLKLLIRICLQGALRIEKERHVSDGLYQFLDDLDDLEGLRAEDNSTTTLQLSSGLARLSANDSDQCVLCRKPIEDECAKHGDKRWHINCVACVHCGKALGRNLQDAHLNRYDFKIFCGEHKDYSTTYSAQEATGFEHVSKLQQYVFLLQVALARLLEILRSSGSIPRGSDEGNNGEGLQPGDAPRLQADSRSKSYAGGEAQHHRESSYESTLNDVRRLRSTRLDKHLSSSFRKARTSRIMDGPESSSARPGSAGAEGGGHGQPGMQIVEERGLGDEGSTDLMFGNQDGITLDDIPRIVAAEQAKEQRSHQPPGRQELFRSPYTEPNFGSGPATGHQRSLSAGRQVDNRLAAEQLQQRTGGRKYFSELSPMEYFIVRHLAVLTMHPLVENDFTLEELLGLIESRKPANFWKNIGKAFQKDGKKNVKKKGVFGVPLEIIIERDGADSTDGVGSATLKIPAIVDDLVATMKGMDLSVEGVFRKNGNIKKLGDLVEKIDREEDPQLGNNNVVQLAALLKRYLRELPDPLLTHKLYRLWLAAAKIQDEEKKRHCLHLACCLLPKCHRDCMEIVFCFLKWAALFHKVDDESGSKMDIKNLATVIAPNIIYKDAKAAALDSDPIYAIEAVEILITYIEEMCLVPDELVDMASDPALYREEITTKEILKRFSDRRVNGGQPQFGDASELMQRHHEIANRPPPRRIETDPSAWQSETSVRTVQQEPTLPYASQQQQGTPPQQKWRNPDDGNQSPYSLHQAAFNGSTENLERGPQGQGAPRREWRNSGYRQPNGGVAAGSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.34
4 0.35
5 0.42
6 0.46
7 0.48
8 0.51
9 0.55
10 0.56
11 0.58
12 0.63
13 0.64
14 0.68
15 0.7
16 0.66
17 0.66
18 0.73
19 0.69
20 0.69
21 0.68
22 0.67
23 0.65
24 0.69
25 0.66
26 0.57
27 0.57
28 0.54
29 0.53
30 0.47
31 0.42
32 0.34
33 0.31
34 0.31
35 0.26
36 0.22
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.16
44 0.16
45 0.17
46 0.23
47 0.31
48 0.32
49 0.34
50 0.4
51 0.42
52 0.41
53 0.45
54 0.43
55 0.37
56 0.36
57 0.34
58 0.32
59 0.3
60 0.31
61 0.26
62 0.23
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.24
67 0.26
68 0.29
69 0.29
70 0.28
71 0.31
72 0.35
73 0.39
74 0.46
75 0.53
76 0.6
77 0.69
78 0.76
79 0.84
80 0.88
81 0.89
82 0.89
83 0.82
84 0.79
85 0.76
86 0.76
87 0.75
88 0.73
89 0.67
90 0.64
91 0.69
92 0.68
93 0.64
94 0.57
95 0.51
96 0.51
97 0.52
98 0.53
99 0.52
100 0.51
101 0.56
102 0.54
103 0.52
104 0.45
105 0.41
106 0.34
107 0.25
108 0.21
109 0.13
110 0.13
111 0.18
112 0.16
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.25
118 0.26
119 0.23
120 0.23
121 0.26
122 0.24
123 0.28
124 0.3
125 0.31
126 0.29
127 0.31
128 0.31
129 0.29
130 0.27
131 0.22
132 0.2
133 0.14
134 0.16
135 0.15
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.2
140 0.19
141 0.17
142 0.15
143 0.13
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.12
148 0.2
149 0.25
150 0.26
151 0.25
152 0.27
153 0.26
154 0.31
155 0.38
156 0.38
157 0.35
158 0.36
159 0.36
160 0.33
161 0.35
162 0.32
163 0.26
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.18
170 0.19
171 0.17
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.22
176 0.25
177 0.29
178 0.31
179 0.31
180 0.32
181 0.33
182 0.34
183 0.31
184 0.28
185 0.24
186 0.19
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.21
211 0.23
212 0.31
213 0.35
214 0.37
215 0.42
216 0.4
217 0.43
218 0.43
219 0.41
220 0.32
221 0.32
222 0.35
223 0.38
224 0.44
225 0.44
226 0.39
227 0.38
228 0.45
229 0.42
230 0.4
231 0.32
232 0.28
233 0.29
234 0.35
235 0.34
236 0.31
237 0.38
238 0.38
239 0.44
240 0.45
241 0.41
242 0.35
243 0.41
244 0.37
245 0.36
246 0.38
247 0.32
248 0.32
249 0.35
250 0.38
251 0.35
252 0.44
253 0.37
254 0.4
255 0.47
256 0.49
257 0.47
258 0.46
259 0.42
260 0.34
261 0.35
262 0.29
263 0.23
264 0.21
265 0.2
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.23
272 0.25
273 0.26
274 0.26
275 0.29
276 0.33
277 0.35
278 0.36
279 0.32
280 0.29
281 0.31
282 0.3
283 0.3
284 0.32
285 0.3
286 0.27
287 0.24
288 0.23
289 0.2
290 0.18
291 0.14
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.11
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.16
333 0.17
334 0.18
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.15
344 0.18
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.17
356 0.21
357 0.21
358 0.25
359 0.24
360 0.25
361 0.33
362 0.36
363 0.33
364 0.32
365 0.33
366 0.33
367 0.35
368 0.3
369 0.22
370 0.19
371 0.23
372 0.22
373 0.22
374 0.2
375 0.18
376 0.17
377 0.18
378 0.22
379 0.19
380 0.2
381 0.22
382 0.22
383 0.21
384 0.23
385 0.21
386 0.18
387 0.17
388 0.15
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.06
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.16
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.18
414 0.18
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.25
419 0.23
420 0.23
421 0.21
422 0.2
423 0.21
424 0.25
425 0.23
426 0.19
427 0.18
428 0.16
429 0.14
430 0.14
431 0.09
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.19
472 0.21
473 0.27
474 0.3
475 0.31
476 0.33
477 0.38
478 0.38
479 0.34
480 0.36
481 0.38
482 0.38
483 0.46
484 0.44
485 0.43
486 0.45
487 0.45
488 0.43
489 0.4
490 0.36
491 0.27
492 0.25
493 0.2
494 0.19
495 0.19
496 0.16
497 0.17
498 0.2
499 0.23
500 0.24
501 0.26
502 0.26
503 0.25
504 0.29
505 0.25
506 0.25
507 0.24
508 0.24
509 0.22
510 0.23
511 0.25
512 0.2
513 0.2
514 0.2
515 0.16
516 0.18
517 0.25
518 0.24
519 0.23
520 0.25
521 0.25
522 0.2
523 0.23
524 0.22
525 0.16
526 0.15
527 0.15
528 0.14
529 0.12
530 0.13
531 0.11
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.08
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.09
550 0.08
551 0.08
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.08
563 0.1
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.09
586 0.09
587 0.13
588 0.17
589 0.21
590 0.23
591 0.24
592 0.24
593 0.23
594 0.23
595 0.22
596 0.18
597 0.17
598 0.18
599 0.2
600 0.24
601 0.24
602 0.24
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.19
607 0.18
608 0.16
609 0.15
610 0.18
611 0.21
612 0.21
613 0.23
614 0.22
615 0.2
616 0.24
617 0.27
618 0.27
619 0.32
620 0.39
621 0.42
622 0.48
623 0.52
624 0.47
625 0.48
626 0.52
627 0.48
628 0.44
629 0.45
630 0.43
631 0.41
632 0.45
633 0.42
634 0.43
635 0.48
636 0.49
637 0.45
638 0.45
639 0.45
640 0.41
641 0.41
642 0.36
643 0.29
644 0.25
645 0.21
646 0.17
647 0.14
648 0.14
649 0.12
650 0.11
651 0.09
652 0.08
653 0.08
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.08
658 0.07
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.04
677 0.05
678 0.05
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.05
685 0.04
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.06
693 0.07
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.08
699 0.08
700 0.09
701 0.12
702 0.17
703 0.19
704 0.19
705 0.21
706 0.27
707 0.31
708 0.36
709 0.39
710 0.41
711 0.44
712 0.51
713 0.55
714 0.47
715 0.44
716 0.46
717 0.46
718 0.4
719 0.4
720 0.33
721 0.35
722 0.38
723 0.39
724 0.31
725 0.28
726 0.27
727 0.24
728 0.23
729 0.16
730 0.13
731 0.12
732 0.17
733 0.14
734 0.15
735 0.15
736 0.14
737 0.15
738 0.17
739 0.18
740 0.18
741 0.2
742 0.2
743 0.24
744 0.25
745 0.26
746 0.24
747 0.22
748 0.17
749 0.16
750 0.15
751 0.17
752 0.21
753 0.2
754 0.19
755 0.2
756 0.2
757 0.24
758 0.26
759 0.25
760 0.21
761 0.2
762 0.23
763 0.27
764 0.27
765 0.28
766 0.26
767 0.27
768 0.27
769 0.27
770 0.24
771 0.19
772 0.19
773 0.14
774 0.16
775 0.11
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.11
782 0.09
783 0.09
784 0.08
785 0.08
786 0.08
787 0.09
788 0.08
789 0.07
790 0.07
791 0.07
792 0.07
793 0.07
794 0.06
795 0.05
796 0.04
797 0.03
798 0.04
799 0.04
800 0.05
801 0.06
802 0.07
803 0.08
804 0.09
805 0.16
806 0.24
807 0.27
808 0.31
809 0.39
810 0.44
811 0.46
812 0.5
813 0.48
814 0.43
815 0.45
816 0.47
817 0.46
818 0.45
819 0.52
820 0.59
821 0.64
822 0.69
823 0.73
824 0.75
825 0.7
826 0.7
827 0.7
828 0.66
829 0.59
830 0.52
831 0.48
832 0.38
833 0.36
834 0.32
835 0.22
836 0.15
837 0.12
838 0.11
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.07
846 0.06
847 0.06
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.07
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.09
859 0.08
860 0.07
861 0.06
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.06
866 0.04
867 0.04
868 0.04
869 0.04
870 0.03
871 0.04
872 0.05
873 0.06
874 0.07
875 0.07
876 0.08
877 0.1
878 0.1
879 0.13
880 0.19
881 0.23
882 0.27
883 0.33
884 0.33
885 0.36
886 0.41
887 0.41
888 0.37
889 0.34
890 0.33
891 0.34
892 0.33
893 0.29
894 0.27
895 0.23
896 0.23
897 0.24
898 0.22
899 0.16
900 0.19
901 0.21
902 0.2
903 0.21
904 0.18
905 0.17
906 0.15
907 0.13
908 0.09
909 0.07
910 0.09
911 0.09
912 0.09
913 0.09
914 0.1
915 0.11
916 0.13
917 0.16
918 0.17
919 0.2
920 0.23
921 0.26
922 0.32
923 0.32
924 0.33
925 0.36
926 0.33
927 0.3
928 0.29
929 0.29
930 0.24
931 0.25
932 0.23
933 0.19
934 0.21
935 0.22
936 0.23
937 0.22
938 0.21
939 0.2
940 0.22
941 0.26
942 0.28
943 0.33
944 0.35
945 0.43
946 0.44
947 0.48
948 0.51
949 0.52
950 0.51
951 0.54
952 0.53
953 0.45
954 0.5
955 0.47
956 0.46
957 0.45
958 0.47
959 0.41
960 0.44
961 0.44
962 0.42
963 0.42
964 0.46
965 0.48
966 0.42
967 0.4
968 0.33
969 0.3
970 0.28
971 0.26
972 0.19
973 0.11
974 0.13
975 0.14
976 0.21
977 0.21
978 0.21
979 0.27
980 0.26
981 0.26
982 0.27
983 0.25
984 0.19
985 0.2
986 0.2
987 0.16
988 0.17
989 0.2
990 0.21
991 0.2
992 0.21
993 0.2
994 0.19
995 0.18
996 0.18
997 0.16
998 0.15
999 0.14
1000 0.12
1001 0.13
1002 0.14
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.15
1006 0.14
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.16
1013 0.12
1014 0.11
1015 0.11
1016 0.11
1017 0.11
1018 0.1
1019 0.08
1020 0.07
1021 0.06
1022 0.06
1023 0.05
1024 0.05
1025 0.04
1026 0.04
1027 0.04
1028 0.04
1029 0.04
1030 0.04
1031 0.05
1032 0.05
1033 0.05
1034 0.07
1035 0.08
1036 0.07
1037 0.07
1038 0.08
1039 0.07
1040 0.07
1041 0.07
1042 0.06
1043 0.06
1044 0.06
1045 0.06
1046 0.06
1047 0.07
1048 0.08
1049 0.08
1050 0.09
1051 0.11
1052 0.13
1053 0.15
1054 0.18
1055 0.21
1056 0.22
1057 0.3
1058 0.32
1059 0.33
1060 0.36
1061 0.42
1062 0.45
1063 0.51
1064 0.58
1065 0.53
1066 0.57
1067 0.61
1068 0.62
1069 0.63
1070 0.64
1071 0.57
1072 0.48
1073 0.49
1074 0.43
1075 0.35
1076 0.32
1077 0.23
1078 0.19
1079 0.19
1080 0.19
1081 0.17
1082 0.19
1083 0.2
1084 0.2
1085 0.23
1086 0.26
1087 0.26
1088 0.35
1089 0.45
1090 0.51
1091 0.53
1092 0.57
1093 0.59
1094 0.6
1095 0.62
1096 0.6
1097 0.58
1098 0.56
1099 0.61
1100 0.62
1101 0.61
1102 0.58
1103 0.52
1104 0.45
1105 0.38
1106 0.37
1107 0.32
1108 0.28
1109 0.26
1110 0.24
1111 0.29
1112 0.32
1113 0.33
1114 0.33
1115 0.36
1116 0.36
1117 0.38
1118 0.4
1119 0.35
1120 0.33
1121 0.38
1122 0.38
1123 0.38
1124 0.36
1125 0.33
1126 0.37
1127 0.45
1128 0.53
1129 0.52
1130 0.52
1131 0.57
1132 0.65
1133 0.68
1134 0.7
1135 0.71
1136 0.72
1137 0.67
1138 0.7
1139 0.69
1140 0.69
1141 0.68
1142 0.62
1143 0.54
1144 0.45
1145 0.43
1146 0.43
1147 0.34
1148 0.26
1149 0.23
1150 0.24
1151 0.25
1152 0.26
1153 0.25
1154 0.2
1155 0.18
1156 0.2
1157 0.18
1158 0.19
1159 0.17
1160 0.16
1161 0.16
1162 0.16
1163 0.19
1164 0.19
1165 0.21
1166 0.26
1167 0.34
1168 0.39
1169 0.45
1170 0.52
1171 0.56
1172 0.58
1173 0.6
1174 0.6
1175 0.61
1176 0.64
1177 0.67
1178 0.69
1179 0.68
1180 0.69
1181 0.65
1182 0.62
1183 0.54
1184 0.46