FuNGI

C5MI79

Protein Details

Accession

C5MI79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
141-166	LKQVIEQCKKQRRCLKCNHVNGVVKK	Hydrophilic
398-419	LTYPEKCTRYNRKKLQRLVYNG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 9, nucl 8, mito 6, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0001056 F:RNA polymerase III activity GO:0006386 P:termination of RNA polymerase III transcription GO:0006384 P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter GO:0042797 P:tRNA transcription by RNA polymerase III
KEGG	ctp:CTRG_05772 -
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MKEVVVDIAPKCIKGLEFGALSAKDIVAQSEVEIQTRDLYDLEKGRTPKEHGALDTRMGISSNAQECSTCHGNLASCHGHFGHIRLALPVFHVGYFKSIISVLQCICKNCAAVLLDEPTKRRFLNDLRRPNIDNLRRMKILKQVIEQCKKQRRCLKCNHVNGVVKKAASGAGPAALKIVHDTFRWIGKKDTPEKNAWDDDLEKVFQRNPELSKFVKRIHDDLNPLKTLNLFKQITPSDCELFGLDPAKGGRPEMYIWRYLPAPPVCIRPSVMMDAQSNEDDLTVKLTEIVWTSSMIKAGILKGISINNLMEQWDYMQLSVAMYINSDSANPALSAGGGGAKASKPIRAFCQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLKIDEVAVPDRVAKVLTYPEKCTRYNRKKLQRLVYNGPDTYPGANYVAKQNEPGKRNLRFGDRAKLAKNLQIGDVVERHIEDGDVVLFNRQPSLHRLSILSHYAKVRPWRTFRLNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAEAINLMGVKNNLLTPKSGEPIIAATQDFITGSYLISHKDSFFDRASLSQLLSMMSDANIQFDIPPPAIFKPVMLWTGKQVFSLLIKPNKQSKVVINLDAKNKTFHPPAKGLPNEMSPNDGFVVIRGSQILSGLMDKSTLGDGKKHSVFYTILRDYGPQEAANAMNRMAKMCARYLGNRGFSIGINDVTPADELKQKKELMVEQAYLKCDQLIDLYNRGKLETQPGCNEEQTLEAKIGGLLSKVREEVGEVCIRELDSLNAPLIMATCGSKGSTLNVSQMVAVVGQQIISGHRVPDGFQDRSLPHFTKNSKTPQSKGFVRNSFFSGLTPPEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSTQYDNTVRNSSNGIVQFTYGGDGLDPYDMEGDARPVNFNRQWDHSFNLTYNVDDKGLLPYQISELVDSKLSPLETGNNAETEFYKSIKEFIAKKSDRLGRLREDRGLKAFVTAGDMEVDEDPAVVNSVNQILKISQKTIEKFLEQCLYKYSRAKVEPGTAVGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINASKVISTPIINSVLVNDEDEIAARVAKGRIEKTLLEDVAFYIEDVYKDNLCYLSIKIDLETIDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.23
3	0.2
4	0.2
5	0.21
6	0.26
7	0.23
8	0.25
9	0.22
10	0.19
11	0.16
12	0.15
13	0.16
14	0.12
15	0.12
16	0.11
17	0.18
18	0.19
19	0.18
20	0.19
21	0.19
22	0.2
23	0.21
24	0.21
25	0.14
26	0.15
27	0.19
28	0.24
29	0.27
30	0.3
31	0.32
32	0.35
33	0.4
34	0.45
35	0.47
36	0.48
37	0.49
38	0.47
39	0.52
40	0.5
41	0.47
42	0.44
43	0.37
44	0.31
45	0.27
46	0.23
47	0.19
48	0.23
49	0.24
50	0.22
51	0.22
52	0.22
53	0.22
54	0.29
55	0.31
56	0.23
57	0.21
58	0.22
59	0.24
60	0.25
61	0.31
62	0.29
63	0.24
64	0.27
65	0.26
66	0.27
67	0.26
68	0.27
69	0.26
70	0.24
71	0.24
72	0.23
73	0.24
74	0.21
75	0.22
76	0.23
77	0.17
78	0.15
79	0.16
80	0.14
81	0.16
82	0.17
83	0.15
84	0.13
85	0.12
86	0.13
87	0.14
88	0.18
89	0.16
90	0.22
91	0.25
92	0.26
93	0.28
94	0.29
95	0.28
96	0.24
97	0.28
98	0.22
99	0.21
100	0.22
101	0.24
102	0.27
103	0.29
104	0.32
105	0.29
106	0.32
107	0.3
108	0.3
109	0.33
110	0.38
111	0.47
112	0.55
113	0.63
114	0.64
115	0.69
116	0.7
117	0.69
118	0.7
119	0.66
120	0.64
121	0.6
122	0.61
123	0.6
124	0.59
125	0.55
126	0.53
127	0.54
128	0.51
129	0.52
130	0.56
131	0.62
132	0.69
133	0.72
134	0.73
135	0.76
136	0.76
137	0.78
138	0.78
139	0.78
140	0.79
141	0.84
142	0.84
143	0.84
144	0.88
145	0.85
146	0.85
147	0.82
148	0.76
149	0.72
150	0.64
151	0.54
152	0.44
153	0.37
154	0.3
155	0.21
156	0.2
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.13
161	0.13
162	0.12
163	0.11
164	0.13
165	0.15
166	0.13
167	0.13
168	0.17
169	0.19
170	0.27
171	0.3
172	0.29
173	0.31
174	0.36
175	0.45
176	0.51
177	0.58
178	0.55
179	0.58
180	0.61
181	0.62
182	0.58
183	0.5
184	0.44
185	0.36
186	0.34
187	0.32
188	0.28
189	0.23
190	0.22
191	0.24
192	0.23
193	0.26
194	0.27
195	0.27
196	0.31
197	0.34
198	0.36
199	0.41
200	0.44
201	0.46
202	0.49
203	0.49
204	0.48
205	0.5
206	0.52
207	0.52
208	0.54
209	0.54
210	0.47
211	0.44
212	0.4
213	0.37
214	0.34
215	0.3
216	0.32
217	0.27
218	0.26
219	0.33
220	0.36
221	0.36
222	0.36
223	0.36
224	0.29
225	0.28
226	0.28
227	0.21
228	0.19
229	0.18
230	0.16
231	0.12
232	0.12
233	0.13
234	0.16
235	0.15
236	0.15
237	0.15
238	0.15
239	0.17
240	0.23
241	0.25
242	0.25
243	0.26
244	0.27
245	0.26
246	0.25
247	0.31
248	0.25
249	0.26
250	0.25
251	0.3
252	0.3
253	0.3
254	0.3
255	0.25
256	0.26
257	0.26
258	0.25
259	0.22
260	0.22
261	0.22
262	0.23
263	0.21
264	0.18
265	0.14
266	0.13
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.08
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.11
277	0.09
278	0.1
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.1
289	0.11
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.11
296	0.11
297	0.09
298	0.08
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.09
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.06
327	0.06
328	0.1
329	0.11
330	0.14
331	0.15
332	0.17
333	0.25
334	0.33
335	0.38
336	0.39
337	0.49
338	0.52
339	0.55
340	0.63
341	0.64
342	0.64
343	0.67
344	0.71
345	0.7
346	0.67
347	0.66
348	0.65
349	0.66
350	0.63
351	0.61
352	0.6
353	0.5
354	0.48
355	0.45
356	0.37
357	0.3
358	0.26
359	0.27
360	0.2
361	0.2
362	0.21
363	0.22
364	0.22
365	0.23
366	0.23
367	0.19
368	0.2
369	0.2
370	0.18
371	0.17
372	0.16
373	0.15
374	0.15
375	0.14
376	0.13
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.12
381	0.1
382	0.07
383	0.08
384	0.14
385	0.2
386	0.22
387	0.27
388	0.34
389	0.38
390	0.4
391	0.48
392	0.53
393	0.57
394	0.65
395	0.7
396	0.74
397	0.79
398	0.85
399	0.86
400	0.83
401	0.79
402	0.77
403	0.74
404	0.67
405	0.58
406	0.5
407	0.42
408	0.35
409	0.28
410	0.2
411	0.14
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.16
416	0.18
417	0.17
418	0.2
419	0.26
420	0.3
421	0.32
422	0.39
423	0.41
424	0.42
425	0.47
426	0.47
427	0.47
428	0.47
429	0.48
430	0.5
431	0.47
432	0.47
433	0.44
434	0.46
435	0.41
436	0.37
437	0.36
438	0.28
439	0.23
440	0.22
441	0.21
442	0.17
443	0.16
444	0.14
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.08
449	0.07
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.09
461	0.13
462	0.19
463	0.19
464	0.2
465	0.2
466	0.21
467	0.25
468	0.28
469	0.24
470	0.21
471	0.21
472	0.22
473	0.24
474	0.3
475	0.31
476	0.33
477	0.37
478	0.42
479	0.47
480	0.52
481	0.53
482	0.56
483	0.53
484	0.48
485	0.46
486	0.41
487	0.34
488	0.29
489	0.27
490	0.19
491	0.18
492	0.16
493	0.15
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.07
499	0.06
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.05
505	0.05
506	0.07
507	0.08
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.08
512	0.09
513	0.08
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.1
527	0.12
528	0.13
529	0.13
530	0.12
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.1
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.11
552	0.13
553	0.13
554	0.13
555	0.12
556	0.13
557	0.15
558	0.14
559	0.13
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.08
564	0.08
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.08
575	0.07
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.11
584	0.13
585	0.12
586	0.12
587	0.13
588	0.18
589	0.18
590	0.16
591	0.15
592	0.13
593	0.14
594	0.18
595	0.21
596	0.21
597	0.23
598	0.26
599	0.33
600	0.34
601	0.35
602	0.33
603	0.3
604	0.34
605	0.35
606	0.37
607	0.35
608	0.37
609	0.4
610	0.4
611	0.38
612	0.3
613	0.29
614	0.27
615	0.28
616	0.27
617	0.27
618	0.28
619	0.31
620	0.37
621	0.37
622	0.35
623	0.31
624	0.31
625	0.29
626	0.25
627	0.25
628	0.17
629	0.17
630	0.15
631	0.14
632	0.1
633	0.08
634	0.1
635	0.08
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.06
650	0.08
651	0.08
652	0.1
653	0.12
654	0.17
655	0.19
656	0.19
657	0.19
658	0.2
659	0.2
660	0.2
661	0.27
662	0.22
663	0.21
664	0.21
665	0.21
666	0.2
667	0.21
668	0.19
669	0.11
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.13
674	0.12
675	0.11
676	0.11
677	0.12
678	0.12
679	0.12
680	0.13
681	0.12
682	0.12
683	0.15
684	0.15
685	0.17
686	0.22
687	0.27
688	0.28
689	0.26
690	0.26
691	0.24
692	0.22
693	0.22
694	0.18
695	0.12
696	0.1
697	0.1
698	0.09
699	0.08
700	0.09
701	0.07
702	0.07
703	0.11
704	0.12
705	0.15
706	0.2
707	0.2
708	0.21
709	0.23
710	0.24
711	0.26
712	0.27
713	0.26
714	0.25
715	0.27
716	0.27
717	0.25
718	0.23
719	0.16
720	0.14
721	0.12
722	0.1
723	0.12
724	0.13
725	0.19
726	0.2
727	0.22
728	0.22
729	0.22
730	0.22
731	0.19
732	0.25
733	0.24
734	0.26
735	0.27
736	0.3
737	0.31
738	0.3
739	0.29
740	0.21
741	0.19
742	0.17
743	0.15
744	0.13
745	0.11
746	0.11
747	0.1
748	0.1
749	0.07
750	0.06
751	0.07
752	0.07
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.08
757	0.1
758	0.11
759	0.13
760	0.16
761	0.15
762	0.15
763	0.15
764	0.15
765	0.14
766	0.13
767	0.11
768	0.09
769	0.1
770	0.1
771	0.1
772	0.09
773	0.09
774	0.09
775	0.07
776	0.06
777	0.05
778	0.05
779	0.06
780	0.06
781	0.07
782	0.07
783	0.09
784	0.12
785	0.12
786	0.14
787	0.15
788	0.15
789	0.14
790	0.14
791	0.12
792	0.08
793	0.07
794	0.06
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.1
804	0.1
805	0.11
806	0.18
807	0.24
808	0.23
809	0.23
810	0.26
811	0.26
812	0.3
813	0.35
814	0.28
815	0.25
816	0.31
817	0.34
818	0.37
819	0.42
820	0.48
821	0.52
822	0.55
823	0.56
824	0.56
825	0.6
826	0.61
827	0.62
828	0.62
829	0.59
830	0.57
831	0.55
832	0.51
833	0.46
834	0.38
835	0.31
836	0.25
837	0.21
838	0.19
839	0.19
840	0.16
841	0.14
842	0.15
843	0.15
844	0.13
845	0.11
846	0.12
847	0.11
848	0.11
849	0.11
850	0.1
851	0.09
852	0.08
853	0.08
854	0.07
855	0.08
856	0.07
857	0.08
858	0.08
859	0.07
860	0.07
861	0.08
862	0.08
863	0.09
864	0.1
865	0.12
866	0.18
867	0.19
868	0.25
869	0.25
870	0.25
871	0.25
872	0.25
873	0.28
874	0.25
875	0.27
876	0.23
877	0.23
878	0.26
879	0.26
880	0.24
881	0.2
882	0.19
883	0.18
884	0.19
885	0.23
886	0.2
887	0.19
888	0.22
889	0.21
890	0.24
891	0.24
892	0.23
893	0.19
894	0.18
895	0.18
896	0.16
897	0.16
898	0.1
899	0.08
900	0.06
901	0.06
902	0.07
903	0.07
904	0.06
905	0.05
906	0.06
907	0.06
908	0.07
909	0.07
910	0.09
911	0.1
912	0.1
913	0.13
914	0.13
915	0.21
916	0.23
917	0.27
918	0.28
919	0.33
920	0.38
921	0.38
922	0.41
923	0.37
924	0.37
925	0.34
926	0.36
927	0.3
928	0.26
929	0.25
930	0.22
931	0.18
932	0.17
933	0.17
934	0.15
935	0.16
936	0.16
937	0.14
938	0.13
939	0.14
940	0.17
941	0.17
942	0.14
943	0.14
944	0.15
945	0.15
946	0.14
947	0.14
948	0.13
949	0.13
950	0.12
951	0.11
952	0.14
953	0.16
954	0.2
955	0.2
956	0.19
957	0.19
958	0.19
959	0.19
960	0.21
961	0.19
962	0.16
963	0.17
964	0.17
965	0.19
966	0.21
967	0.26
968	0.25
969	0.3
970	0.4
971	0.4
972	0.42
973	0.49
974	0.53
975	0.54
976	0.55
977	0.55
978	0.53
979	0.61
980	0.63
981	0.61
982	0.59
983	0.56
984	0.55
985	0.51
986	0.42
987	0.34
988	0.31
989	0.24
990	0.22
991	0.18
992	0.15
993	0.13
994	0.13
995	0.12
996	0.11
997	0.12
998	0.08
999	0.08
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.06
1004	0.05
1005	0.06
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.11
1009	0.13
1010	0.13
1011	0.2
1012	0.22
1013	0.24
1014	0.24
1015	0.31
1016	0.33
1017	0.39
1018	0.41
1019	0.39
1020	0.38
1021	0.41
1022	0.44
1023	0.38
1024	0.36
1025	0.36
1026	0.37
1027	0.39
1028	0.43
1029	0.43
1030	0.43
1031	0.45
1032	0.49
1033	0.47
1034	0.5
1035	0.47
1036	0.43
1037	0.41
1038	0.32
1039	0.29
1040	0.24
1041	0.19
1042	0.12
1043	0.09
1044	0.07
1045	0.04
1046	0.04
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.04
1050	0.05
1051	0.05
1052	0.08
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.11
1056	0.14
1057	0.15
1058	0.18
1059	0.18
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.16
1064	0.14
1065	0.14
1066	0.12
1067	0.12
1068	0.11
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.08
1072	0.09
1073	0.11
1074	0.1
1075	0.12
1076	0.15
1077	0.15
1078	0.18
1079	0.24
1080	0.31
1081	0.31
1082	0.32
1083	0.32
1084	0.32
1085	0.32
1086	0.32
1087	0.28
1088	0.19
1089	0.17
1090	0.2
1091	0.22
1092	0.19
1093	0.19
1094	0.18
1095	0.2
1096	0.19
1097	0.18
1098	0.14
1099	0.13
1100	0.12
1101	0.13
1102	0.13
1103	0.1
1104	0.1
1105	0.09
1106	0.12
1107	0.13
1108	0.16
1109	0.22
1110	0.23
1111	0.27
1112	0.31
1113	0.32
1114	0.34
1115	0.41
1116	0.38
1117	0.33
1118	0.31
1119	0.26
1120	0.25
1121	0.23
1122	0.17
1123	0.11
1124	0.12
1125	0.12
1126	0.14
1127	0.17
1128	0.16
1129	0.16
1130	0.18
1131	0.17
1132	0.16
1133	0.18
1134	0.16
1135	0.18
1136	0.19
1137	0.19
1138	0.18
1139	0.19

C5MI79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer