Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5NTA4

Protein Details
Accession A0A5N5NTA4    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
486-505KVPLRTREPREPRAPREPREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-419KRLAAIKEKKEAEEAAKEERRIAKEAREAAAAK
491-510TREPREPRAPREPREPRGPR
536-561GARGGAATRGPRGGGAPRGPRTDGGR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033107  EIF-4B_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12402  RRM_eIF4B  
Amino Acid Sequences MHRVNSPKKEKAQKLTLGEFIGGDSYGGSWADEVEDTYASGTQPLPPRQTGGSGYGSGYGGGNDRGYSSIRENLPQQIPDKPPYTLHLGNLSYEATQESVTEFFEGCNIVSVRIIEDREQQRPKGFAYAEFGDREGLVKALTLDGQSFQGRSIRVKVADPPKERRDGGFESRDLSNASWERKGPLAALPGSDRPGRSDFSERRAPREPMADDGKVRDFGNWERRGPLSPVAQPERIGGRSRDGSRPGTNDGFRNRHASPAWGPGEGRGEPLEPRLDGSRPPRREFSDRPERAPTAAEQDNQWRSHMRPDAPAKSETHSRAGSEAPSSPAGGAPATLAGGRPKLNLIKRTVSESPAVASPTSSDSKASPFGAARPIDTAAREREIEEKRLAAIKEKKEAEEAAKEERRIAKEAREAAAAKEAAEKAAAEEAAKEAAKNTPEEAPKEAAKETPAVVEATSEKPEEAKEPATEAAAASTPAAAQNGEQKVPLRTREPREPRAPREPREPRGPRDEEFKPQTRATESGNWRSASSDQRGGARGGAATRGPRGGGAPRGPRTDGGRPTRSNGAAPAPAAAAAAGEPETPKVDEDGWTTVAPPAKKRGGRTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.75
3 0.69
4 0.6
5 0.51
6 0.42
7 0.32
8 0.25
9 0.17
10 0.12
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.15
30 0.23
31 0.29
32 0.33
33 0.33
34 0.36
35 0.36
36 0.4
37 0.36
38 0.33
39 0.3
40 0.27
41 0.26
42 0.25
43 0.24
44 0.2
45 0.17
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.17
56 0.23
57 0.24
58 0.27
59 0.29
60 0.36
61 0.39
62 0.39
63 0.38
64 0.39
65 0.42
66 0.44
67 0.44
68 0.38
69 0.35
70 0.35
71 0.41
72 0.35
73 0.33
74 0.34
75 0.32
76 0.31
77 0.3
78 0.28
79 0.2
80 0.18
81 0.16
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.17
101 0.18
102 0.15
103 0.24
104 0.29
105 0.37
106 0.41
107 0.42
108 0.43
109 0.44
110 0.43
111 0.41
112 0.37
113 0.3
114 0.32
115 0.32
116 0.3
117 0.29
118 0.28
119 0.21
120 0.2
121 0.19
122 0.13
123 0.1
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.21
140 0.23
141 0.23
142 0.25
143 0.32
144 0.38
145 0.46
146 0.5
147 0.54
148 0.55
149 0.59
150 0.59
151 0.52
152 0.49
153 0.46
154 0.48
155 0.45
156 0.4
157 0.37
158 0.37
159 0.36
160 0.3
161 0.24
162 0.23
163 0.22
164 0.24
165 0.23
166 0.24
167 0.25
168 0.25
169 0.25
170 0.19
171 0.18
172 0.2
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.21
178 0.22
179 0.19
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.21
184 0.29
185 0.3
186 0.34
187 0.44
188 0.41
189 0.45
190 0.5
191 0.49
192 0.42
193 0.45
194 0.4
195 0.36
196 0.4
197 0.36
198 0.3
199 0.3
200 0.29
201 0.25
202 0.24
203 0.19
204 0.17
205 0.21
206 0.31
207 0.32
208 0.31
209 0.31
210 0.32
211 0.34
212 0.33
213 0.32
214 0.26
215 0.25
216 0.31
217 0.32
218 0.32
219 0.3
220 0.3
221 0.28
222 0.26
223 0.25
224 0.2
225 0.2
226 0.25
227 0.27
228 0.3
229 0.31
230 0.33
231 0.33
232 0.35
233 0.35
234 0.34
235 0.32
236 0.33
237 0.35
238 0.35
239 0.34
240 0.36
241 0.32
242 0.32
243 0.3
244 0.29
245 0.25
246 0.29
247 0.28
248 0.24
249 0.24
250 0.21
251 0.24
252 0.21
253 0.19
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.13
258 0.13
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.15
264 0.23
265 0.31
266 0.34
267 0.37
268 0.4
269 0.43
270 0.49
271 0.5
272 0.5
273 0.52
274 0.5
275 0.51
276 0.51
277 0.47
278 0.41
279 0.37
280 0.28
281 0.23
282 0.23
283 0.2
284 0.17
285 0.23
286 0.26
287 0.25
288 0.25
289 0.21
290 0.2
291 0.26
292 0.29
293 0.24
294 0.28
295 0.33
296 0.37
297 0.38
298 0.39
299 0.34
300 0.32
301 0.36
302 0.31
303 0.29
304 0.24
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.19
309 0.15
310 0.14
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.06
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.15
330 0.2
331 0.24
332 0.27
333 0.3
334 0.3
335 0.36
336 0.35
337 0.32
338 0.29
339 0.24
340 0.21
341 0.18
342 0.18
343 0.12
344 0.1
345 0.09
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.19
358 0.19
359 0.17
360 0.16
361 0.17
362 0.16
363 0.16
364 0.18
365 0.14
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.22
370 0.25
371 0.27
372 0.25
373 0.23
374 0.23
375 0.27
376 0.26
377 0.26
378 0.31
379 0.32
380 0.38
381 0.39
382 0.39
383 0.36
384 0.38
385 0.33
386 0.3
387 0.29
388 0.3
389 0.32
390 0.31
391 0.33
392 0.36
393 0.35
394 0.34
395 0.34
396 0.31
397 0.34
398 0.37
399 0.35
400 0.33
401 0.31
402 0.28
403 0.31
404 0.26
405 0.2
406 0.2
407 0.19
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.09
412 0.11
413 0.11
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.08
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.15
425 0.18
426 0.22
427 0.24
428 0.26
429 0.26
430 0.26
431 0.28
432 0.27
433 0.22
434 0.2
435 0.2
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.12
440 0.11
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.15
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.17
457 0.14
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.14
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.2
473 0.25
474 0.29
475 0.32
476 0.32
477 0.38
478 0.45
479 0.55
480 0.62
481 0.65
482 0.72
483 0.77
484 0.77
485 0.8
486 0.81
487 0.76
488 0.78
489 0.79
490 0.75
491 0.77
492 0.77
493 0.72
494 0.73
495 0.73
496 0.64
497 0.61
498 0.59
499 0.57
500 0.58
501 0.58
502 0.54
503 0.5
504 0.52
505 0.48
506 0.46
507 0.42
508 0.44
509 0.44
510 0.48
511 0.51
512 0.49
513 0.45
514 0.45
515 0.44
516 0.42
517 0.4
518 0.37
519 0.34
520 0.37
521 0.39
522 0.37
523 0.34
524 0.28
525 0.23
526 0.18
527 0.19
528 0.17
529 0.18
530 0.19
531 0.19
532 0.18
533 0.17
534 0.19
535 0.22
536 0.27
537 0.32
538 0.39
539 0.43
540 0.47
541 0.48
542 0.49
543 0.5
544 0.52
545 0.54
546 0.54
547 0.57
548 0.55
549 0.58
550 0.63
551 0.58
552 0.51
553 0.45
554 0.42
555 0.36
556 0.33
557 0.3
558 0.22
559 0.2
560 0.18
561 0.14
562 0.09
563 0.06
564 0.07
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.09
569 0.11
570 0.12
571 0.13
572 0.14
573 0.14
574 0.16
575 0.19
576 0.22
577 0.22
578 0.21
579 0.22
580 0.23
581 0.27
582 0.28
583 0.29
584 0.33
585 0.4
586 0.45
587 0.49