Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5LJ72

Protein Details
Accession A0A5N5LJ72    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
598-640GSYDRHSRPRSRSPRSNRNESDSYRRRSPSPRKRGPPEPNLDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
571-633RRDDYRRSPSPRRGDSYGRGGRDRYRDGSYDRHSRPRSRSPRSNRNESDSYRRRSPSPRKRGP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, cyto 4.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTDQTPEVVAAVDVSPVSPKPIHTSATSPALVPSLQDYAATLDVAYLDSLTTAPFPFVTMPSTRSRNPSNPANPAVTAAQDSSPQSSPAADTIVVCGEEEDDDHSDDSHHEEADIDEESLDAYGLDDDRQQQDDDPQHEHAAEFTTAESTTGVTNGTVTETTRAAQPDVTEASSESMINTPSANSTPESNVVMKSESPAAATSQLSEFEGGVVSADRATENPAPEGDSQVEPQKKLDSSPTAASESLAPPANTAVVKQEEDPIAIDIQKLVNDITAANAAASSPATTAPSQAAVEATSLPVKQENPSSISLPQPSSLPLKPVFPQDAAQPASRPQDFHPFPSRGANNSHAAPPMPMQGVVHSQAAPSGNSPYTGAAAPGTTAAAVSSLPPIPPAPLNNGPQAYSSLPIAASIPGSVASRRGDLHGAQLQQAWELFQEDEKRYLTEAKWERFPENSRIFIGNLSNERVSKREVFDLFHRFGRLAQISLKSAYGFVQYHLAEDAEAAMQSAQGAEMGGRRIHLEFSRVQKKKEPQDRDMRDRSPDRRSQRSIGGPVGGGLDRYDGRDRNQNRRRDDYRRSPSPRRGDSYGRGGRDRYRDGSYDRHSRPRSRSPRSNRNESDSYRRRSPSPRKRGPPEPNLDIPQRYGDQVPDVQILLLGELQQDFIAWVQRAFYERGLKADVMYFNPRFARDAVLQKLVVEGVHGVIELDMRAQTTGKIPLQVFARSSGSNVRFDQYQDLDPKVAAELVLRAKPPQAPPAQPQQPAYPAYPPNPYPQYPQPYPPQHPLPQGVPPSGYPYTQPPPTAPQGPAALTAQDIAGLAGRVDNNTLQALLASLSGGQQPAPQPGMPPQVDINALLGSLQGGVAPPIQPQALSYGGYMPQMGGTPVQPAGPHNLPPAGGGAGPADTAAQVQNIMASLARQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.09
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.22
8 0.26
9 0.29
10 0.29
11 0.33
12 0.34
13 0.4
14 0.39
15 0.32
16 0.29
17 0.28
18 0.25
19 0.21
20 0.19
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.14
28 0.11
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.06
34 0.05
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.12
45 0.15
46 0.16
47 0.2
48 0.26
49 0.32
50 0.34
51 0.39
52 0.46
53 0.5
54 0.54
55 0.6
56 0.61
57 0.63
58 0.64
59 0.6
60 0.53
61 0.48
62 0.42
63 0.33
64 0.27
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.13
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.12
115 0.15
116 0.17
117 0.17
118 0.18
119 0.25
120 0.31
121 0.33
122 0.33
123 0.33
124 0.32
125 0.32
126 0.31
127 0.24
128 0.21
129 0.17
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.07
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.16
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.18
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.15
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.15
174 0.17
175 0.2
176 0.19
177 0.19
178 0.18
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.08
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.18
211 0.18
212 0.2
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.23
217 0.26
218 0.24
219 0.25
220 0.27
221 0.25
222 0.25
223 0.3
224 0.27
225 0.27
226 0.3
227 0.31
228 0.29
229 0.29
230 0.27
231 0.24
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.15
236 0.13
237 0.13
238 0.15
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.19
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.12
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.15
291 0.16
292 0.18
293 0.2
294 0.22
295 0.21
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.2
300 0.17
301 0.17
302 0.2
303 0.19
304 0.2
305 0.18
306 0.2
307 0.21
308 0.25
309 0.25
310 0.22
311 0.22
312 0.2
313 0.25
314 0.25
315 0.24
316 0.2
317 0.21
318 0.25
319 0.25
320 0.24
321 0.2
322 0.29
323 0.29
324 0.34
325 0.38
326 0.35
327 0.35
328 0.41
329 0.4
330 0.32
331 0.35
332 0.34
333 0.29
334 0.28
335 0.29
336 0.22
337 0.21
338 0.19
339 0.16
340 0.15
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.11
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.14
382 0.19
383 0.22
384 0.24
385 0.25
386 0.24
387 0.23
388 0.24
389 0.19
390 0.14
391 0.12
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.16
414 0.17
415 0.16
416 0.15
417 0.14
418 0.1
419 0.06
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.11
424 0.12
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.17
430 0.15
431 0.21
432 0.26
433 0.26
434 0.31
435 0.32
436 0.32
437 0.33
438 0.36
439 0.35
440 0.32
441 0.32
442 0.28
443 0.28
444 0.27
445 0.25
446 0.22
447 0.16
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.16
455 0.16
456 0.16
457 0.19
458 0.19
459 0.2
460 0.25
461 0.29
462 0.28
463 0.27
464 0.25
465 0.21
466 0.2
467 0.23
468 0.18
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.16
473 0.17
474 0.16
475 0.12
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.02
498 0.03
499 0.03
500 0.04
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.1
507 0.1
508 0.12
509 0.14
510 0.23
511 0.33
512 0.34
513 0.36
514 0.41
515 0.49
516 0.56
517 0.61
518 0.61
519 0.58
520 0.67
521 0.72
522 0.74
523 0.73
524 0.65
525 0.62
526 0.61
527 0.59
528 0.56
529 0.56
530 0.54
531 0.56
532 0.58
533 0.55
534 0.55
535 0.55
536 0.5
537 0.44
538 0.38
539 0.29
540 0.25
541 0.23
542 0.16
543 0.11
544 0.07
545 0.08
546 0.07
547 0.1
548 0.13
549 0.13
550 0.15
551 0.24
552 0.29
553 0.38
554 0.46
555 0.51
556 0.54
557 0.61
558 0.67
559 0.67
560 0.71
561 0.71
562 0.73
563 0.75
564 0.78
565 0.77
566 0.79
567 0.8
568 0.76
569 0.71
570 0.66
571 0.62
572 0.58
573 0.6
574 0.56
575 0.5
576 0.45
577 0.42
578 0.42
579 0.43
580 0.42
581 0.35
582 0.33
583 0.33
584 0.34
585 0.4
586 0.41
587 0.45
588 0.45
589 0.51
590 0.53
591 0.58
592 0.62
593 0.65
594 0.69
595 0.69
596 0.76
597 0.76
598 0.82
599 0.82
600 0.85
601 0.78
602 0.75
603 0.72
604 0.66
605 0.66
606 0.64
607 0.63
608 0.59
609 0.58
610 0.55
611 0.59
612 0.66
613 0.67
614 0.69
615 0.73
616 0.75
617 0.81
618 0.87
619 0.86
620 0.84
621 0.8
622 0.75
623 0.7
624 0.65
625 0.61
626 0.51
627 0.43
628 0.36
629 0.29
630 0.25
631 0.21
632 0.17
633 0.16
634 0.17
635 0.17
636 0.15
637 0.14
638 0.13
639 0.12
640 0.11
641 0.09
642 0.07
643 0.06
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.09
652 0.08
653 0.09
654 0.09
655 0.1
656 0.13
657 0.15
658 0.18
659 0.21
660 0.22
661 0.24
662 0.26
663 0.25
664 0.23
665 0.25
666 0.23
667 0.19
668 0.26
669 0.24
670 0.25
671 0.26
672 0.26
673 0.24
674 0.23
675 0.24
676 0.22
677 0.3
678 0.3
679 0.32
680 0.31
681 0.29
682 0.29
683 0.25
684 0.19
685 0.12
686 0.09
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.07
700 0.1
701 0.16
702 0.16
703 0.21
704 0.21
705 0.24
706 0.27
707 0.28
708 0.26
709 0.24
710 0.25
711 0.2
712 0.22
713 0.26
714 0.26
715 0.29
716 0.29
717 0.28
718 0.26
719 0.27
720 0.31
721 0.26
722 0.29
723 0.28
724 0.28
725 0.27
726 0.26
727 0.25
728 0.19
729 0.17
730 0.11
731 0.08
732 0.11
733 0.14
734 0.17
735 0.17
736 0.17
737 0.2
738 0.25
739 0.27
740 0.31
741 0.33
742 0.36
743 0.4
744 0.5
745 0.54
746 0.53
747 0.52
748 0.48
749 0.47
750 0.45
751 0.42
752 0.38
753 0.35
754 0.35
755 0.38
756 0.36
757 0.39
758 0.42
759 0.41
760 0.41
761 0.46
762 0.52
763 0.49
764 0.53
765 0.56
766 0.59
767 0.63
768 0.64
769 0.63
770 0.6
771 0.62
772 0.6
773 0.54
774 0.52
775 0.5
776 0.44
777 0.38
778 0.32
779 0.34
780 0.31
781 0.28
782 0.23
783 0.26
784 0.3
785 0.32
786 0.33
787 0.29
788 0.34
789 0.39
790 0.42
791 0.36
792 0.34
793 0.34
794 0.33
795 0.33
796 0.27
797 0.22
798 0.17
799 0.17
800 0.12
801 0.1
802 0.09
803 0.07
804 0.07
805 0.06
806 0.06
807 0.08
808 0.08
809 0.09
810 0.1
811 0.11
812 0.11
813 0.12
814 0.12
815 0.1
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.07
820 0.06
821 0.05
822 0.06
823 0.08
824 0.08
825 0.08
826 0.11
827 0.13
828 0.18
829 0.2
830 0.19
831 0.2
832 0.26
833 0.35
834 0.32
835 0.32
836 0.29
837 0.29
838 0.29
839 0.28
840 0.23
841 0.14
842 0.14
843 0.11
844 0.1
845 0.07
846 0.07
847 0.06
848 0.04
849 0.04
850 0.06
851 0.07
852 0.08
853 0.09
854 0.11
855 0.11
856 0.11
857 0.11
858 0.14
859 0.14
860 0.15
861 0.15
862 0.15
863 0.17
864 0.17
865 0.17
866 0.13
867 0.12
868 0.12
869 0.12
870 0.1
871 0.1
872 0.12
873 0.12
874 0.13
875 0.13
876 0.14
877 0.21
878 0.23
879 0.25
880 0.26
881 0.27
882 0.26
883 0.26
884 0.26
885 0.19
886 0.16
887 0.14
888 0.12
889 0.1
890 0.1
891 0.09
892 0.07
893 0.06
894 0.08
895 0.08
896 0.07
897 0.07
898 0.07
899 0.08
900 0.08
901 0.09
902 0.08