Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCT1

Protein Details
Accession C5MCT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
797-817SQLGSSSTGVRRKRKRKGGFAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
807-815RRKRKRKGG
Subcellular Location(s) nucl 10, plas 6, cyto_nucl 6, mito 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019350  RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like  
KEGG ctp:CTRG_04032  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10214  Rrn6  
Amino Acid Sequences MWPHKKGLGVRLSYGVYGNALVSIDTVPKAQDYLQSNEETFVSSNSDQPSDESDLHTPYRTLFPRINEEGDKLEFKSEKSTQIVESQTSKFTINSSMYDNLRVPAIPKSTTTPKSATHDYIPQEIISSYLVESKTLTSNIAYDPNCGDILQMFDMYVKEQNAYVDAMAFVTGEATSVLNIVLCEHPDEKFVMSAAYQLDFFDPILQIQVSDKSDKIAIIAVRTAAKVFILSAMISRIGYIQDVPSIELLIVGEVTADSLNGHSFADVKFDNKEFPHLAITDIKGNFTVYKVNKKVNNISMSILETMKEMDDNGESLSSWRRIFWVPKDSNKLLVLSRSKVDEITLTGSTATSRTLITSNTWSRIRDFTVIGNYGFMLTSKELIWFGFTDGMTRLLSWKHFLNDKDPSLKLTILSGSNTFTCLVYSQINPCIIVYTFGMRNDKPYSLRDPYILRKTHDNSELRQVMIRKVGKTLIMFELTTDLAIHSRTLIVGGSGAVTSGDRDGYSSSAITSNIGQNSKITAKFFKQFSQKQIQGLLKMSNTKPHSQDIATESQQIESIQKYAYELGSGFARIGDSQTKIARYFSLFDVCSDPPFEIRDILELDDMIVQLESSLPADKLKLKSLINNSFIQRSKFQNDATTQTHINDIYKLINNVYSKDENSRTSKIAVSILLGLSLIKCQYESNLFTDELEEAISEAPLHVKSLVEQWDDDDDDDQNTTQSGNQIETSVIEPTQATQHDSQFMPSIRLNSSMQAPSMLTQSSQTQTQTQTQSQSQSQSQIPLHSQRLSSSSRMLSSQLGSSSTGVRRKRKRKGGFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.27
3 0.19
4 0.16
5 0.14
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.19
19 0.22
20 0.27
21 0.3
22 0.32
23 0.32
24 0.32
25 0.31
26 0.27
27 0.22
28 0.17
29 0.19
30 0.17
31 0.22
32 0.23
33 0.24
34 0.22
35 0.23
36 0.27
37 0.26
38 0.27
39 0.26
40 0.26
41 0.28
42 0.3
43 0.3
44 0.25
45 0.22
46 0.3
47 0.29
48 0.32
49 0.33
50 0.36
51 0.43
52 0.47
53 0.5
54 0.44
55 0.43
56 0.42
57 0.41
58 0.38
59 0.31
60 0.32
61 0.28
62 0.27
63 0.33
64 0.32
65 0.34
66 0.35
67 0.37
68 0.33
69 0.38
70 0.4
71 0.35
72 0.37
73 0.33
74 0.31
75 0.3
76 0.29
77 0.23
78 0.22
79 0.25
80 0.22
81 0.22
82 0.24
83 0.28
84 0.28
85 0.31
86 0.31
87 0.25
88 0.24
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.23
93 0.21
94 0.22
95 0.27
96 0.35
97 0.39
98 0.41
99 0.39
100 0.4
101 0.46
102 0.5
103 0.47
104 0.42
105 0.45
106 0.44
107 0.44
108 0.4
109 0.33
110 0.29
111 0.25
112 0.22
113 0.16
114 0.13
115 0.09
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.13
125 0.14
126 0.16
127 0.22
128 0.21
129 0.2
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.17
135 0.11
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.12
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.14
257 0.17
258 0.16
259 0.21
260 0.18
261 0.19
262 0.2
263 0.18
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.21
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.15
273 0.14
274 0.2
275 0.17
276 0.26
277 0.3
278 0.36
279 0.39
280 0.43
281 0.49
282 0.49
283 0.49
284 0.4
285 0.38
286 0.33
287 0.31
288 0.28
289 0.21
290 0.14
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.1
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.14
308 0.16
309 0.21
310 0.26
311 0.33
312 0.35
313 0.41
314 0.49
315 0.47
316 0.48
317 0.44
318 0.4
319 0.3
320 0.32
321 0.29
322 0.23
323 0.23
324 0.21
325 0.21
326 0.19
327 0.18
328 0.13
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.1
344 0.16
345 0.18
346 0.21
347 0.23
348 0.23
349 0.24
350 0.25
351 0.25
352 0.21
353 0.2
354 0.17
355 0.19
356 0.2
357 0.17
358 0.15
359 0.13
360 0.11
361 0.1
362 0.08
363 0.06
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.1
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.16
387 0.17
388 0.21
389 0.25
390 0.26
391 0.28
392 0.27
393 0.26
394 0.24
395 0.23
396 0.18
397 0.14
398 0.13
399 0.1
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.1
419 0.11
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.12
424 0.15
425 0.13
426 0.17
427 0.18
428 0.2
429 0.19
430 0.21
431 0.25
432 0.26
433 0.27
434 0.26
435 0.28
436 0.33
437 0.39
438 0.38
439 0.34
440 0.37
441 0.39
442 0.42
443 0.45
444 0.41
445 0.34
446 0.4
447 0.4
448 0.34
449 0.34
450 0.3
451 0.24
452 0.29
453 0.3
454 0.22
455 0.22
456 0.23
457 0.22
458 0.21
459 0.22
460 0.17
461 0.15
462 0.15
463 0.13
464 0.14
465 0.11
466 0.11
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.12
500 0.14
501 0.15
502 0.14
503 0.13
504 0.16
505 0.19
506 0.19
507 0.18
508 0.18
509 0.21
510 0.27
511 0.29
512 0.32
513 0.38
514 0.41
515 0.46
516 0.52
517 0.51
518 0.47
519 0.52
520 0.48
521 0.42
522 0.39
523 0.34
524 0.27
525 0.29
526 0.28
527 0.29
528 0.3
529 0.32
530 0.32
531 0.33
532 0.34
533 0.29
534 0.32
535 0.29
536 0.31
537 0.28
538 0.29
539 0.26
540 0.23
541 0.23
542 0.2
543 0.17
544 0.12
545 0.12
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.09
561 0.1
562 0.11
563 0.14
564 0.17
565 0.19
566 0.19
567 0.2
568 0.2
569 0.19
570 0.2
571 0.19
572 0.22
573 0.2
574 0.2
575 0.24
576 0.22
577 0.22
578 0.2
579 0.18
580 0.14
581 0.15
582 0.15
583 0.12
584 0.12
585 0.13
586 0.13
587 0.14
588 0.13
589 0.11
590 0.11
591 0.1
592 0.09
593 0.07
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.09
604 0.15
605 0.17
606 0.21
607 0.25
608 0.25
609 0.32
610 0.41
611 0.47
612 0.45
613 0.47
614 0.45
615 0.46
616 0.48
617 0.45
618 0.39
619 0.38
620 0.38
621 0.38
622 0.38
623 0.37
624 0.38
625 0.41
626 0.4
627 0.37
628 0.34
629 0.31
630 0.32
631 0.26
632 0.24
633 0.19
634 0.17
635 0.18
636 0.19
637 0.2
638 0.18
639 0.22
640 0.22
641 0.22
642 0.27
643 0.25
644 0.24
645 0.3
646 0.33
647 0.33
648 0.38
649 0.4
650 0.36
651 0.36
652 0.36
653 0.32
654 0.3
655 0.25
656 0.2
657 0.18
658 0.16
659 0.14
660 0.12
661 0.1
662 0.08
663 0.09
664 0.08
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.1
669 0.16
670 0.18
671 0.19
672 0.22
673 0.22
674 0.22
675 0.23
676 0.2
677 0.15
678 0.12
679 0.09
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.05
685 0.07
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.1
691 0.15
692 0.21
693 0.2
694 0.2
695 0.21
696 0.24
697 0.25
698 0.25
699 0.2
700 0.16
701 0.15
702 0.16
703 0.14
704 0.11
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.12
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.15
713 0.15
714 0.16
715 0.16
716 0.14
717 0.12
718 0.11
719 0.11
720 0.11
721 0.16
722 0.16
723 0.19
724 0.2
725 0.23
726 0.27
727 0.27
728 0.28
729 0.29
730 0.29
731 0.29
732 0.28
733 0.28
734 0.25
735 0.29
736 0.28
737 0.24
738 0.29
739 0.27
740 0.25
741 0.23
742 0.22
743 0.2
744 0.21
745 0.19
746 0.14
747 0.14
748 0.18
749 0.19
750 0.21
751 0.22
752 0.24
753 0.28
754 0.35
755 0.39
756 0.38
757 0.42
758 0.43
759 0.46
760 0.46
761 0.48
762 0.43
763 0.42
764 0.41
765 0.42
766 0.4
767 0.39
768 0.41
769 0.42
770 0.45
771 0.43
772 0.42
773 0.37
774 0.4
775 0.4
776 0.37
777 0.36
778 0.34
779 0.32
780 0.33
781 0.32
782 0.3
783 0.28
784 0.28
785 0.24
786 0.22
787 0.22
788 0.22
789 0.26
790 0.29
791 0.35
792 0.4
793 0.49
794 0.58
795 0.68
796 0.77
797 0.82