FuNGI

A0A5N5PAJ1

Protein Details

Accession

A0A5N5PAJ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-67	RAGPTRPTSFRPPPQRKGLNQPLDA	Hydrophilic
277-296	VERYYKFRPKRPQNINSLED	Hydrophilic
527-550	ETSGNESSRKPKKAKKNLAPGAAG	Hydrophilic
579-599	GSDGGKRKPTKVKVKIPGTAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-59	RPNGGKRDPPPPGARPLNPNRVLKPRPKANALVSRRAGPTRPTSFRPPPQRK
467-487	KAKAEEEKKKEEEEKKKAAAD
503-520	SGKPKQPDMSKKGKLKRP
534-549	SRKPKKAKKNLAPGAA
584-591	KRKPTKVK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSALPPARPNGGKRDPPPPGARPLNPNRVLKPRPKANALVSRRAGPTRPTSFRPPPQRKGLNQPLDAEKRWAELRAKREANGGWSWVPPQPFTDYEIYTTKKELMDGIRHHVMRFDRKDEEKPVDPTDQDEFPRPVSLHRRDARATQFGRNGSVVKDEEKPENPVDEAEAEKLRLYKEQQEAQKLANLAQIAPVLKKDVGEKPKVEKKQKATSTYYPKHTEEAKKASALRYEETLPWHLEDVDGKNVWVGSYVAALSEHDVAFVIDVEKRGFRMIPVERYYKFRPKRPQNINSLEDAEQEIAKREKGADRWALEDQKRNEIKNEISEYRKFLGGGPKVKMESATSRAIPKAERRDDNDIDLSGDEFQDDDENPGFDADDEDTKETKERLRRDHLGASIFDEVKEKEVEKEEKEAKLEKLRDKLQGKETRKALLKREQKYDYLSDDDDSENPFASSSESESEDEEKEKAKAEEEKKKEEEEKKKAAADKTTASGSNTKGNTTPSGKPKQPDMSKKGKLKRPADVDASETSGNESSRKPKKAKKNLAPGAAGSANASRSGTPLPRRPGGAASDGEGTANEGSDGGKRKPTKVKVKIPGTATGTPAGSRAGSPAPHRAGSAVGVNTKPITGEEIVSAIVSKGGAIGIGDLLKEFKGRVGTGPGQMPKGDWVKLVKNHAVYDKDKMLRPKGAKAAAAPAPAQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.63
3	0.66
4	0.7
5	0.65
6	0.65
7	0.64
8	0.66
9	0.66
10	0.69
11	0.72
12	0.72
13	0.73
14	0.7
15	0.72
16	0.74
17	0.74
18	0.74
19	0.73
20	0.73
21	0.73
22	0.73
23	0.72
24	0.75
25	0.73
26	0.72
27	0.65
28	0.63
29	0.61
30	0.58
31	0.51
32	0.47
33	0.49
34	0.49
35	0.52
36	0.52
37	0.58
38	0.64
39	0.71
40	0.76
41	0.77
42	0.76
43	0.81
44	0.84
45	0.8
46	0.82
47	0.83
48	0.81
49	0.74
50	0.7
51	0.69
52	0.66
53	0.62
54	0.55
55	0.45
56	0.4
57	0.38
58	0.38
59	0.37
60	0.37
61	0.41
62	0.47
63	0.49
64	0.47
65	0.5
66	0.47
67	0.44
68	0.4
69	0.38
70	0.29
71	0.28
72	0.29
73	0.27
74	0.27
75	0.22
76	0.22
77	0.23
78	0.22
79	0.26
80	0.28
81	0.25
82	0.27
83	0.32
84	0.33
85	0.3
86	0.3
87	0.29
88	0.25
89	0.25
90	0.26
91	0.26
92	0.31
93	0.33
94	0.38
95	0.42
96	0.42
97	0.41
98	0.42
99	0.42
100	0.44
101	0.46
102	0.44
103	0.45
104	0.49
105	0.55
106	0.57
107	0.58
108	0.53
109	0.53
110	0.52
111	0.48
112	0.44
113	0.41
114	0.38
115	0.35
116	0.31
117	0.31
118	0.29
119	0.26
120	0.29
121	0.26
122	0.29
123	0.36
124	0.41
125	0.45
126	0.48
127	0.52
128	0.51
129	0.58
130	0.57
131	0.57
132	0.53
133	0.5
134	0.51
135	0.46
136	0.46
137	0.41
138	0.36
139	0.27
140	0.29
141	0.24
142	0.21
143	0.25
144	0.25
145	0.29
146	0.29
147	0.33
148	0.3
149	0.3
150	0.28
151	0.23
152	0.22
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.15
157	0.14
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.17
162	0.19
163	0.24
164	0.3
165	0.36
166	0.4
167	0.45
168	0.46
169	0.43
170	0.44
171	0.37
172	0.31
173	0.26
174	0.21
175	0.15
176	0.14
177	0.15
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.13
184	0.16
185	0.22
186	0.28
187	0.32
188	0.35
189	0.41
190	0.5
191	0.58
192	0.63
193	0.62
194	0.64
195	0.69
196	0.73
197	0.71
198	0.69
199	0.69
200	0.71
201	0.7
202	0.69
203	0.64
204	0.58
205	0.55
206	0.55
207	0.53
208	0.5
209	0.51
210	0.46
211	0.44
212	0.44
213	0.44
214	0.41
215	0.36
216	0.3
217	0.25
218	0.26
219	0.24
220	0.25
221	0.25
222	0.21
223	0.19
224	0.18
225	0.16
226	0.14
227	0.15
228	0.15
229	0.16
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.13
235	0.11
236	0.09
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.05
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.15
261	0.18
262	0.24
263	0.27
264	0.32
265	0.32
266	0.38
267	0.43
268	0.46
269	0.48
270	0.5
271	0.57
272	0.63
273	0.72
274	0.77
275	0.79
276	0.78
277	0.8
278	0.74
279	0.65
280	0.58
281	0.48
282	0.38
283	0.31
284	0.22
285	0.14
286	0.12
287	0.13
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.11
292	0.13
293	0.15
294	0.2
295	0.23
296	0.23
297	0.26
298	0.29
299	0.33
300	0.32
301	0.37
302	0.34
303	0.38
304	0.4
305	0.37
306	0.36
307	0.33
308	0.32
309	0.3
310	0.34
311	0.28
312	0.29
313	0.3
314	0.3
315	0.28
316	0.27
317	0.22
318	0.2
319	0.25
320	0.26
321	0.29
322	0.27
323	0.28
324	0.28
325	0.27
326	0.25
327	0.19
328	0.17
329	0.17
330	0.18
331	0.17
332	0.18
333	0.19
334	0.19
335	0.2
336	0.22
337	0.28
338	0.31
339	0.34
340	0.37
341	0.44
342	0.44
343	0.44
344	0.39
345	0.3
346	0.24
347	0.21
348	0.17
349	0.1
350	0.09
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.06
364	0.05
365	0.07
366	0.07
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.11
372	0.15
373	0.21
374	0.26
375	0.31
376	0.38
377	0.43
378	0.45
379	0.49
380	0.47
381	0.42
382	0.37
383	0.32
384	0.28
385	0.23
386	0.19
387	0.16
388	0.14
389	0.13
390	0.14
391	0.12
392	0.11
393	0.16
394	0.2
395	0.19
396	0.26
397	0.28
398	0.28
399	0.3
400	0.31
401	0.29
402	0.33
403	0.37
404	0.36
405	0.38
406	0.4
407	0.47
408	0.46
409	0.49
410	0.51
411	0.55
412	0.55
413	0.56
414	0.54
415	0.52
416	0.56
417	0.55
418	0.52
419	0.52
420	0.56
421	0.54
422	0.6
423	0.57
424	0.52
425	0.52
426	0.48
427	0.42
428	0.36
429	0.31
430	0.24
431	0.22
432	0.21
433	0.18
434	0.17
435	0.14
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.08
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.15
448	0.15
449	0.16
450	0.15
451	0.15
452	0.13
453	0.15
454	0.15
455	0.16
456	0.23
457	0.3
458	0.39
459	0.43
460	0.5
461	0.49
462	0.53
463	0.58
464	0.6
465	0.62
466	0.6
467	0.63
468	0.59
469	0.61
470	0.62
471	0.58
472	0.53
473	0.46
474	0.4
475	0.35
476	0.33
477	0.3
478	0.26
479	0.26
480	0.23
481	0.27
482	0.25
483	0.24
484	0.23
485	0.24
486	0.28
487	0.29
488	0.34
489	0.36
490	0.43
491	0.45
492	0.46
493	0.51
494	0.55
495	0.59
496	0.63
497	0.61
498	0.64
499	0.69
500	0.76
501	0.78
502	0.76
503	0.77
504	0.72
505	0.73
506	0.7
507	0.67
508	0.63
509	0.56
510	0.52
511	0.43
512	0.41
513	0.32
514	0.25
515	0.21
516	0.18
517	0.17
518	0.15
519	0.17
520	0.23
521	0.32
522	0.4
523	0.46
524	0.53
525	0.64
526	0.73
527	0.82
528	0.82
529	0.85
530	0.85
531	0.83
532	0.75
533	0.64
534	0.58
535	0.47
536	0.37
537	0.27
538	0.21
539	0.15
540	0.14
541	0.14
542	0.09
543	0.11
544	0.15
545	0.2
546	0.26
547	0.33
548	0.38
549	0.41
550	0.43
551	0.43
552	0.43
553	0.39
554	0.37
555	0.3
556	0.26
557	0.25
558	0.23
559	0.21
560	0.17
561	0.15
562	0.11
563	0.1
564	0.08
565	0.06
566	0.06
567	0.11
568	0.16
569	0.16
570	0.24
571	0.27
572	0.34
573	0.44
574	0.53
575	0.6
576	0.66
577	0.74
578	0.77
579	0.82
580	0.81
581	0.74
582	0.71
583	0.66
584	0.59
585	0.5
586	0.42
587	0.35
588	0.29
589	0.27
590	0.21
591	0.15
592	0.12
593	0.13
594	0.14
595	0.17
596	0.2
597	0.28
598	0.3
599	0.31
600	0.31
601	0.28
602	0.26
603	0.25
604	0.27
605	0.21
606	0.21
607	0.21
608	0.22
609	0.21
610	0.2
611	0.18
612	0.14
613	0.16
614	0.13
615	0.14
616	0.13
617	0.13
618	0.13
619	0.13
620	0.13
621	0.08
622	0.08
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.09
638	0.11
639	0.14
640	0.15
641	0.18
642	0.25
643	0.29
644	0.33
645	0.39
646	0.4
647	0.38
648	0.37
649	0.35
650	0.34
651	0.34
652	0.31
653	0.27
654	0.3
655	0.36
656	0.42
657	0.49
658	0.48
659	0.48
660	0.51
661	0.54
662	0.54
663	0.49
664	0.5
665	0.51
666	0.5
667	0.52
668	0.56
669	0.56
670	0.59
671	0.61
672	0.62
673	0.62
674	0.62
675	0.59
676	0.53
677	0.54
678	0.49
679	0.48

A0A5N5PAJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer