Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M411

Protein Details
Accession C5M411    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-325LMQVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG ctp:CTRG_00800  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSPASQDLVLAYINDYVSRNNELSKLAKPLAKLIEGKSLPTISNGLEIIISEVKENKDESESDSSSSESDSESESDSSSSDSESDSSSSSSSSSESDSDSSSDESSSSDSESEDEKEEDKVEKSKEEVKSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSDSDSDSDSDSDSSSSEDESDSDSSSSSSDSDSSSSDSESDSDDSSSSDDDDDSEEGTKKRKQEDNEEPESKRAKSNTESSSSTESIPATPEPELKPGQRKHFSRIDRSKISFEDSTLQDNTYKGAAGTWGEMANEKLMQVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSITLASGSYKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.16
5 0.2
6 0.2
7 0.2
8 0.22
9 0.24
10 0.26
11 0.28
12 0.31
13 0.31
14 0.32
15 0.31
16 0.36
17 0.36
18 0.38
19 0.38
20 0.34
21 0.39
22 0.38
23 0.38
24 0.35
25 0.32
26 0.28
27 0.26
28 0.25
29 0.16
30 0.18
31 0.17
32 0.13
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.14
40 0.15
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.17
45 0.18
46 0.22
47 0.26
48 0.26
49 0.25
50 0.25
51 0.24
52 0.22
53 0.21
54 0.17
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.1
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.2
111 0.26
112 0.29
113 0.31
114 0.31
115 0.3
116 0.32
117 0.32
118 0.31
119 0.24
120 0.2
121 0.17
122 0.17
123 0.14
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.11
206 0.11
207 0.16
208 0.19
209 0.21
210 0.29
211 0.34
212 0.36
213 0.45
214 0.55
215 0.59
216 0.64
217 0.66
218 0.59
219 0.59
220 0.59
221 0.5
222 0.43
223 0.36
224 0.33
225 0.32
226 0.39
227 0.38
228 0.39
229 0.4
230 0.39
231 0.43
232 0.39
233 0.34
234 0.28
235 0.24
236 0.2
237 0.2
238 0.17
239 0.13
240 0.13
241 0.17
242 0.17
243 0.21
244 0.23
245 0.26
246 0.35
247 0.4
248 0.48
249 0.54
250 0.55
251 0.58
252 0.64
253 0.66
254 0.67
255 0.71
256 0.7
257 0.69
258 0.69
259 0.67
260 0.6
261 0.59
262 0.48
263 0.4
264 0.38
265 0.31
266 0.32
267 0.28
268 0.28
269 0.23
270 0.23
271 0.22
272 0.16
273 0.15
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.13
288 0.15
289 0.18
290 0.2
291 0.23
292 0.27
293 0.3
294 0.39
295 0.42
296 0.5
297 0.58
298 0.66
299 0.72
300 0.77
301 0.83
302 0.83
303 0.86
304 0.86
305 0.84
306 0.84
307 0.79
308 0.76
309 0.71
310 0.64
311 0.55
312 0.45
313 0.38
314 0.28
315 0.23
316 0.17
317 0.14