Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MFR0

Protein Details
Accession C5MFR0    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
990-1022EESAARTKKKKGGAKGGKKGKKKKNIIEDSDEEBasic
1043-1066KRKSEEQTGGSKKKKKPLSSEFIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
995-1013RTKKKKGGAKGGKKGKKKK
1051-1058GGSKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000791  C:euchromatin  
GO:1990269  F:RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045142  F:triplex DNA binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
GO:1901525  P:negative regulation of mitophagy  
GO:2001209  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0060260  P:regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
GO:0000083  P:regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
GO:0090262  P:regulation of transcription-coupled nucleotide-excision repair  
GO:0031126  P:sno(s)RNA 3'-end processing  
GO:0001015  P:snoRNA transcription by RNA polymerase II  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_04903  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MEDPIDISYYIGAEEIESLKTLDVPFDNQVVSIDLQEELLDDPSDLIQLLTDQSSPKKYWIIIASAYAKIGKVEQSMKFIKAALNLSYFDNNDRITFESFIIWLYLQNVSLGIEKDQNLSLARQGISKLTFKIQNDRETRPLNSISNLLCSAVLNLYESNNDHASEIAEQILKINSSNAFALLVKAQSLLNKSKNYAHALKLFQQVLIMNPMMKPDPRLGIGLCFWFLKDEKLAIKSWERSLELDPSNIKSRIFLNLAKFHNTFTTSLSDEEFLENYKNCLQELSKIQKSSINDATVLLTLAAHYFARDEYDVVSKIIKKIVTSVTGSDNIIKFSISSSISKYEASVLSQCATWLGRIEFSKGDFTQSSKYFQDAIKLNDNDIVAKLGLGQSQYNRGSLEEAIITFEKILNSNVNCLEANYSLGVLYSKQDSPKKKELAISVLERYIRLSNNRGDSSSREPVATNAYLILSELYEDKGDMNQALTYLNKAVEARKYVDKDVSLEVYNNIGVFQFMKQNYTSASENFQVAVDKLNGAEFKSPDGDLLIDLPQDLKTTLTFNLARTKEITNQDEALTIYESLIQECPNYFSAKLRILFLNCITDKKTKQEIKDEIDELLQLNASDLEIRSFYGWFIKNFAKKVHLSQDADTTLQKETLMEYDSHDCYALISLANIYCIMARDTKGSEEKKRKYYLRAIELFTKVLSLDPKNVYAAQGLAIAFIENKQANKGLDILRKIRDSLNDISVYLNLGHVLCQLKNFGKAIENYELALARYTDGNDTKILSFLGRAWYLRGTSESNLPYLKQALEYAQKAVEASKASSKAALLYNVSFIQFQIADAITKQSVNQRVVEEIEEAIAGLNAGIDILTKLSSEEDDRHLPYPANYLKTRASLGSSTLLDSLNKALEETKESIAEIEDKIEKAKQIRQAEEEARLREEEEKLKAIQEKEMEMAKQRLILQEQAQIWAEENRSNTVVSGDENNDEVDEKLFNEESAARTKKKKGGAKGGKKGKKKKNIIEDSDEEDEKNITGESDNEEGEANGNGKRKSEEQTGGSKKKKKPLSSEFIVDSEEDLDELFEGDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.17
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.18
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.07
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.13
40 0.17
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.29
45 0.29
46 0.34
47 0.35
48 0.35
49 0.31
50 0.36
51 0.36
52 0.33
53 0.33
54 0.27
55 0.23
56 0.2
57 0.2
58 0.17
59 0.19
60 0.25
61 0.26
62 0.33
63 0.36
64 0.37
65 0.36
66 0.34
67 0.32
68 0.3
69 0.31
70 0.26
71 0.26
72 0.25
73 0.27
74 0.29
75 0.28
76 0.25
77 0.25
78 0.23
79 0.21
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.22
84 0.2
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.19
107 0.2
108 0.21
109 0.2
110 0.2
111 0.2
112 0.22
113 0.25
114 0.27
115 0.26
116 0.27
117 0.32
118 0.33
119 0.42
120 0.44
121 0.5
122 0.53
123 0.56
124 0.58
125 0.57
126 0.56
127 0.52
128 0.5
129 0.43
130 0.39
131 0.38
132 0.31
133 0.31
134 0.29
135 0.24
136 0.2
137 0.17
138 0.17
139 0.13
140 0.13
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.13
175 0.18
176 0.23
177 0.28
178 0.3
179 0.33
180 0.37
181 0.42
182 0.45
183 0.45
184 0.43
185 0.44
186 0.45
187 0.49
188 0.5
189 0.45
190 0.38
191 0.35
192 0.3
193 0.26
194 0.25
195 0.2
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.16
203 0.19
204 0.19
205 0.21
206 0.19
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.16
218 0.19
219 0.21
220 0.23
221 0.24
222 0.3
223 0.31
224 0.33
225 0.35
226 0.32
227 0.32
228 0.33
229 0.37
230 0.31
231 0.31
232 0.29
233 0.29
234 0.33
235 0.32
236 0.29
237 0.24
238 0.24
239 0.26
240 0.28
241 0.28
242 0.29
243 0.35
244 0.38
245 0.41
246 0.4
247 0.36
248 0.35
249 0.33
250 0.27
251 0.22
252 0.23
253 0.19
254 0.19
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.16
259 0.14
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.17
265 0.16
266 0.15
267 0.17
268 0.16
269 0.2
270 0.28
271 0.34
272 0.36
273 0.36
274 0.37
275 0.39
276 0.4
277 0.41
278 0.38
279 0.3
280 0.26
281 0.26
282 0.26
283 0.22
284 0.2
285 0.13
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.2
305 0.19
306 0.16
307 0.19
308 0.21
309 0.22
310 0.21
311 0.22
312 0.22
313 0.23
314 0.23
315 0.23
316 0.2
317 0.18
318 0.16
319 0.14
320 0.11
321 0.1
322 0.13
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.16
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.15
346 0.15
347 0.16
348 0.2
349 0.18
350 0.2
351 0.18
352 0.19
353 0.23
354 0.24
355 0.26
356 0.22
357 0.24
358 0.23
359 0.23
360 0.27
361 0.25
362 0.27
363 0.32
364 0.32
365 0.31
366 0.31
367 0.31
368 0.25
369 0.21
370 0.18
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.16
380 0.16
381 0.17
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.15
405 0.11
406 0.11
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.05
413 0.06
414 0.08
415 0.09
416 0.15
417 0.21
418 0.27
419 0.35
420 0.43
421 0.45
422 0.45
423 0.48
424 0.45
425 0.44
426 0.42
427 0.37
428 0.3
429 0.29
430 0.26
431 0.22
432 0.21
433 0.19
434 0.17
435 0.17
436 0.19
437 0.22
438 0.27
439 0.27
440 0.27
441 0.26
442 0.28
443 0.32
444 0.32
445 0.28
446 0.23
447 0.23
448 0.23
449 0.25
450 0.21
451 0.15
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.09
478 0.11
479 0.14
480 0.16
481 0.2
482 0.22
483 0.22
484 0.24
485 0.22
486 0.21
487 0.2
488 0.19
489 0.15
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.09
495 0.07
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.1
501 0.1
502 0.12
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.16
507 0.16
508 0.12
509 0.15
510 0.14
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.1
515 0.09
516 0.1
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.1
524 0.08
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.06
532 0.07
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.05
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.07
543 0.08
544 0.11
545 0.12
546 0.13
547 0.21
548 0.21
549 0.22
550 0.22
551 0.24
552 0.26
553 0.3
554 0.3
555 0.24
556 0.25
557 0.24
558 0.23
559 0.21
560 0.16
561 0.11
562 0.09
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.08
571 0.1
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.11
576 0.15
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.19
581 0.19
582 0.21
583 0.19
584 0.22
585 0.18
586 0.18
587 0.2
588 0.23
589 0.23
590 0.27
591 0.36
592 0.34
593 0.37
594 0.45
595 0.48
596 0.47
597 0.5
598 0.46
599 0.37
600 0.33
601 0.3
602 0.21
603 0.15
604 0.1
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.05
610 0.04
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.11
618 0.13
619 0.13
620 0.16
621 0.21
622 0.24
623 0.26
624 0.27
625 0.27
626 0.26
627 0.3
628 0.34
629 0.36
630 0.34
631 0.33
632 0.36
633 0.32
634 0.32
635 0.28
636 0.22
637 0.16
638 0.14
639 0.13
640 0.08
641 0.08
642 0.09
643 0.1
644 0.09
645 0.1
646 0.14
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.09
654 0.06
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.09
666 0.1
667 0.11
668 0.14
669 0.21
670 0.25
671 0.34
672 0.42
673 0.48
674 0.54
675 0.6
676 0.61
677 0.61
678 0.65
679 0.64
680 0.63
681 0.61
682 0.56
683 0.54
684 0.52
685 0.45
686 0.36
687 0.28
688 0.19
689 0.16
690 0.17
691 0.12
692 0.16
693 0.17
694 0.18
695 0.19
696 0.2
697 0.19
698 0.15
699 0.14
700 0.1
701 0.1
702 0.09
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.1
709 0.09
710 0.09
711 0.1
712 0.13
713 0.14
714 0.14
715 0.18
716 0.2
717 0.24
718 0.28
719 0.3
720 0.31
721 0.32
722 0.33
723 0.31
724 0.29
725 0.29
726 0.28
727 0.29
728 0.26
729 0.25
730 0.24
731 0.22
732 0.2
733 0.15
734 0.11
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.09
739 0.11
740 0.1
741 0.11
742 0.14
743 0.15
744 0.18
745 0.18
746 0.16
747 0.18
748 0.2
749 0.24
750 0.24
751 0.23
752 0.2
753 0.21
754 0.2
755 0.17
756 0.16
757 0.11
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.12
762 0.13
763 0.14
764 0.14
765 0.15
766 0.15
767 0.15
768 0.14
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.14
773 0.13
774 0.13
775 0.14
776 0.16
777 0.16
778 0.16
779 0.18
780 0.16
781 0.16
782 0.22
783 0.21
784 0.21
785 0.22
786 0.21
787 0.2
788 0.19
789 0.18
790 0.13
791 0.13
792 0.15
793 0.2
794 0.21
795 0.21
796 0.19
797 0.19
798 0.18
799 0.18
800 0.17
801 0.13
802 0.13
803 0.17
804 0.18
805 0.18
806 0.19
807 0.18
808 0.19
809 0.2
810 0.2
811 0.16
812 0.15
813 0.18
814 0.18
815 0.18
816 0.15
817 0.13
818 0.13
819 0.11
820 0.1
821 0.1
822 0.1
823 0.09
824 0.1
825 0.12
826 0.11
827 0.11
828 0.12
829 0.17
830 0.23
831 0.25
832 0.27
833 0.26
834 0.27
835 0.28
836 0.28
837 0.22
838 0.16
839 0.14
840 0.11
841 0.1
842 0.08
843 0.06
844 0.05
845 0.03
846 0.03
847 0.03
848 0.03
849 0.02
850 0.03
851 0.03
852 0.04
853 0.04
854 0.04
855 0.05
856 0.06
857 0.08
858 0.1
859 0.13
860 0.17
861 0.21
862 0.24
863 0.25
864 0.26
865 0.25
866 0.24
867 0.3
868 0.3
869 0.31
870 0.3
871 0.32
872 0.33
873 0.35
874 0.35
875 0.28
876 0.26
877 0.21
878 0.23
879 0.23
880 0.21
881 0.2
882 0.19
883 0.19
884 0.16
885 0.16
886 0.16
887 0.13
888 0.12
889 0.12
890 0.12
891 0.13
892 0.18
893 0.2
894 0.2
895 0.19
896 0.19
897 0.19
898 0.18
899 0.19
900 0.14
901 0.14
902 0.15
903 0.15
904 0.17
905 0.18
906 0.21
907 0.23
908 0.28
909 0.34
910 0.39
911 0.42
912 0.44
913 0.5
914 0.5
915 0.55
916 0.54
917 0.48
918 0.43
919 0.39
920 0.36
921 0.33
922 0.34
923 0.31
924 0.29
925 0.3
926 0.28
927 0.32
928 0.36
929 0.34
930 0.34
931 0.31
932 0.29
933 0.29
934 0.32
935 0.29
936 0.29
937 0.3
938 0.26
939 0.28
940 0.28
941 0.29
942 0.29
943 0.32
944 0.29
945 0.33
946 0.32
947 0.32
948 0.31
949 0.26
950 0.25
951 0.25
952 0.24
953 0.2
954 0.21
955 0.21
956 0.21
957 0.21
958 0.2
959 0.17
960 0.16
961 0.15
962 0.18
963 0.17
964 0.17
965 0.17
966 0.17
967 0.17
968 0.17
969 0.15
970 0.12
971 0.11
972 0.1
973 0.13
974 0.13
975 0.12
976 0.14
977 0.15
978 0.17
979 0.25
980 0.3
981 0.32
982 0.38
983 0.46
984 0.51
985 0.58
986 0.64
987 0.65
988 0.71
989 0.77
990 0.81
991 0.84
992 0.88
993 0.88
994 0.9
995 0.9
996 0.9
997 0.89
998 0.89
999 0.88
1000 0.89
1001 0.9
1002 0.88
1003 0.85
1004 0.79
1005 0.75
1006 0.69
1007 0.6
1008 0.49
1009 0.39
1010 0.32
1011 0.24
1012 0.2
1013 0.14
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.11
1017 0.14
1018 0.16
1019 0.16
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.15
1023 0.15
1024 0.16
1025 0.13
1026 0.14
1027 0.2
1028 0.2
1029 0.22
1030 0.26
1031 0.29
1032 0.34
1033 0.41
1034 0.44
1035 0.43
1036 0.53
1037 0.61
1038 0.67
1039 0.72
1040 0.75
1041 0.74
1042 0.77
1043 0.81
1044 0.79
1045 0.8
1046 0.8
1047 0.81
1048 0.78
1049 0.77
1050 0.71
1051 0.63
1052 0.56
1053 0.45
1054 0.35
1055 0.27
1056 0.2
1057 0.14
1058 0.1
1059 0.09
1060 0.08
1061 0.08