Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5PJR5

Protein Details
Accession A0A5N5PJR5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-112GTRKSTRTASTKPRSPKRSRPSTDEDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-105TRTASTKPRSPKRSR
255-257KAK
271-287IARAERQKKKAEKEAKR
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 8, mito 7, nucl 6.5, extr 1, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MPPYGDYIPRRSGLSKSASVAPLLSAFKKQPETGRPLKIKEPDHIFAPPVSDSSDDDEATSRRGDIRQSTFETKSGTGGGRAPAVGTRKSTRTASTKPRSPKRSRPSTDEDEIDEPVKPAKKTRLGARKDNGLGSHFEGIPSLRKAAGAKVNSGTQKKTKCYGKAAKAGPKQLSSDPFVPQSPEKPEPARYKPVDLSDALLASPEKEQPKFVLPDLTGLEPTPSPPPVKFQLPYNPDGTLPDPSPSPSPSPEKPKAKTKPSSGEADVFMRIARAERQKKKAEKEAKRQQEEMEKQSTKVVFELPEGLTQDDFVDDAGYDLHDSPKPNDTKPIRDILAGHEEPKCPMCGEAVSQQMLDNFSNQKMMSINKQMRFCDHHKAKTARNAWVDKGYPDIDWSKLDARIAKHHKFLEAIVNGGTSHFGTHFARSIKSGKNKTLLKTDQDLTPGYYGTKGSRAMEDHLINHFADLLRTAAVKDKLVAARGQMAFVQFVLVPELAIRLIMEDMDVSAQKARRIMEESQKIGNLLNEEEDDVIEQEEEEDEEEVRSRARSTSSLSSLEDSDNDDPFASL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.39
3 0.38
4 0.42
5 0.4
6 0.38
7 0.35
8 0.28
9 0.26
10 0.26
11 0.24
12 0.22
13 0.23
14 0.29
15 0.33
16 0.35
17 0.39
18 0.44
19 0.51
20 0.55
21 0.63
22 0.64
23 0.64
24 0.68
25 0.68
26 0.64
27 0.64
28 0.63
29 0.55
30 0.52
31 0.49
32 0.43
33 0.36
34 0.35
35 0.27
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.16
40 0.2
41 0.22
42 0.19
43 0.19
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.16
49 0.16
50 0.19
51 0.23
52 0.28
53 0.34
54 0.39
55 0.45
56 0.5
57 0.49
58 0.49
59 0.48
60 0.4
61 0.35
62 0.31
63 0.25
64 0.21
65 0.22
66 0.21
67 0.19
68 0.18
69 0.17
70 0.18
71 0.21
72 0.21
73 0.23
74 0.26
75 0.28
76 0.32
77 0.34
78 0.37
79 0.41
80 0.47
81 0.53
82 0.58
83 0.63
84 0.7
85 0.78
86 0.82
87 0.83
88 0.85
89 0.85
90 0.86
91 0.84
92 0.82
93 0.8
94 0.78
95 0.74
96 0.65
97 0.59
98 0.49
99 0.45
100 0.38
101 0.29
102 0.22
103 0.22
104 0.24
105 0.21
106 0.24
107 0.31
108 0.39
109 0.43
110 0.53
111 0.58
112 0.6
113 0.69
114 0.68
115 0.68
116 0.62
117 0.6
118 0.51
119 0.43
120 0.39
121 0.32
122 0.31
123 0.22
124 0.19
125 0.17
126 0.17
127 0.19
128 0.18
129 0.17
130 0.13
131 0.15
132 0.15
133 0.21
134 0.27
135 0.23
136 0.25
137 0.26
138 0.3
139 0.35
140 0.37
141 0.35
142 0.35
143 0.4
144 0.41
145 0.47
146 0.5
147 0.49
148 0.57
149 0.62
150 0.63
151 0.66
152 0.69
153 0.7
154 0.69
155 0.7
156 0.63
157 0.56
158 0.51
159 0.46
160 0.43
161 0.37
162 0.34
163 0.3
164 0.28
165 0.27
166 0.27
167 0.24
168 0.25
169 0.28
170 0.28
171 0.3
172 0.3
173 0.38
174 0.43
175 0.47
176 0.52
177 0.47
178 0.49
179 0.48
180 0.48
181 0.43
182 0.35
183 0.31
184 0.23
185 0.21
186 0.16
187 0.14
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.22
197 0.23
198 0.23
199 0.23
200 0.2
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.16
214 0.19
215 0.23
216 0.22
217 0.25
218 0.32
219 0.35
220 0.37
221 0.34
222 0.31
223 0.27
224 0.28
225 0.25
226 0.19
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.21
236 0.25
237 0.33
238 0.41
239 0.47
240 0.49
241 0.57
242 0.62
243 0.65
244 0.67
245 0.65
246 0.65
247 0.6
248 0.61
249 0.52
250 0.46
251 0.39
252 0.34
253 0.27
254 0.19
255 0.15
256 0.11
257 0.09
258 0.08
259 0.11
260 0.19
261 0.28
262 0.36
263 0.43
264 0.51
265 0.58
266 0.62
267 0.67
268 0.69
269 0.69
270 0.73
271 0.75
272 0.77
273 0.74
274 0.69
275 0.62
276 0.61
277 0.56
278 0.49
279 0.48
280 0.39
281 0.36
282 0.38
283 0.35
284 0.26
285 0.22
286 0.19
287 0.12
288 0.12
289 0.14
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.07
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.19
312 0.21
313 0.21
314 0.3
315 0.31
316 0.35
317 0.37
318 0.4
319 0.33
320 0.32
321 0.32
322 0.27
323 0.32
324 0.26
325 0.25
326 0.23
327 0.23
328 0.23
329 0.23
330 0.2
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.09
335 0.11
336 0.14
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.15
352 0.18
353 0.26
354 0.32
355 0.35
356 0.39
357 0.38
358 0.41
359 0.45
360 0.43
361 0.45
362 0.45
363 0.46
364 0.51
365 0.56
366 0.57
367 0.6
368 0.62
369 0.58
370 0.58
371 0.55
372 0.48
373 0.48
374 0.44
375 0.35
376 0.34
377 0.28
378 0.2
379 0.2
380 0.2
381 0.16
382 0.16
383 0.18
384 0.17
385 0.17
386 0.19
387 0.2
388 0.21
389 0.3
390 0.38
391 0.39
392 0.42
393 0.42
394 0.42
395 0.39
396 0.38
397 0.36
398 0.28
399 0.25
400 0.2
401 0.19
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.09
409 0.1
410 0.12
411 0.16
412 0.17
413 0.18
414 0.21
415 0.26
416 0.31
417 0.39
418 0.43
419 0.44
420 0.51
421 0.55
422 0.56
423 0.6
424 0.57
425 0.53
426 0.52
427 0.49
428 0.43
429 0.4
430 0.37
431 0.3
432 0.26
433 0.21
434 0.16
435 0.16
436 0.15
437 0.14
438 0.16
439 0.17
440 0.17
441 0.2
442 0.22
443 0.24
444 0.29
445 0.3
446 0.28
447 0.28
448 0.29
449 0.25
450 0.23
451 0.21
452 0.15
453 0.13
454 0.12
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.1
459 0.15
460 0.16
461 0.17
462 0.17
463 0.22
464 0.23
465 0.25
466 0.25
467 0.2
468 0.26
469 0.26
470 0.26
471 0.21
472 0.2
473 0.18
474 0.17
475 0.17
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.08
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.13
496 0.15
497 0.17
498 0.2
499 0.21
500 0.23
501 0.28
502 0.34
503 0.39
504 0.46
505 0.47
506 0.48
507 0.47
508 0.44
509 0.4
510 0.36
511 0.28
512 0.21
513 0.19
514 0.16
515 0.16
516 0.16
517 0.15
518 0.13
519 0.11
520 0.11
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.15
536 0.18
537 0.2
538 0.25
539 0.33
540 0.36
541 0.38
542 0.39
543 0.38
544 0.37
545 0.35
546 0.3
547 0.27
548 0.25
549 0.23
550 0.22