Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDI4

Protein Details
Accession C5MDI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-227SKFYDPFKFIRRSKKRTFHWDYLLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR014012  HSA_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0035267  C:NuA4 histone acetyltransferase complex  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006974  P:DNA damage response  
KEGG ctp:CTRG_03736  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07529  HSA  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51204  HSA  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDETWKSRLEEISHIIADPFLRDFSKTGTAEKNMTLIQQSEKVVEQLFKEAIIVSMEESIVRPNIPQEELKRRQEAQLEGNARKYQKNSLVMKKEVRPSQVKSLKTQNIIDQEELKLFLDKSLDELEVITAPAQYPIHPQTVSPLAELYYLTQTLPLIKLLPGCHKVLMTDNFESALAEGKIAVLYSRIEELKRQGKWSLRQPSKFYDPFKFIRRSKKRTFHWDYLLQEAKWMTDDFRESSKYKKWCCVIMAEAVEEYWAVGKKVCIKRKPIKYLDNEDTDMETGNEVNHDPLGAVSGTQEGNNIKQEEKTPCLENISEPEPRTIDTSILLAKSDDSRVDTSSTINITEHTNGSAKPEPPQERVFKSYITLDELKKIDQSIVKNLPVFSAFDNHTVQPKELPIASVSRLLYPQEGDEQWHKIVLRDRVDESSISYGPPEYQKGLFGTQSHRRFNPLKPPKPPLIKNIEYRSPTIWLPQDDKRLIHYVAEFCFNWDLISEHISSASSAVSLKKYESNIERRTPWQCFERYIQLNDKFQFSDMKGVYAYHAQQWLEHAHLAQSTTKRRISPLGVGVESIQRGSRKLRWASMFDAMRKAMKKREIVAAKMNHRKSTNEIQASQQQQANSLDSKSNNDRIPTPAELSKLKFERDKAINDTILNQTISKQRLLQHHQQQQQQQQQQQQQRHQQQRQQQQQVQLQQQRHHQPQPHPQPQPQPPQQSQLHPSTSQQQMHAQVRNVGAAPKSMPGPRISMPNGHSNANQIVPPHPTNVPIRQPNSQNAQVPIKRPTTPNGTPLTNEQIQHLIQMQKQRRMLQQQQQQQQQLQQQQLHSQQPQRMNVNSQAMRVGTPNGQQVSPISGPQPQPQPQQQPRRPLFPPAQVSMVINEIQKQNPGLAKDQVTKLAAQYLANLSQQQNRMNSQSPQPQQNIKASQQQVQQVQRNNVSPNTRIGPSPDNTNHQMAMMQGSPSSPLPQQYPKNQSASPMTGSPNVSYSEIQGRRSNGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.28
4 0.24
5 0.2
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.19
12 0.27
13 0.27
14 0.31
15 0.35
16 0.38
17 0.4
18 0.39
19 0.38
20 0.3
21 0.31
22 0.28
23 0.23
24 0.24
25 0.26
26 0.26
27 0.25
28 0.25
29 0.25
30 0.25
31 0.26
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.2
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.14
40 0.13
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.14
51 0.18
52 0.21
53 0.26
54 0.32
55 0.42
56 0.5
57 0.57
58 0.59
59 0.58
60 0.6
61 0.61
62 0.58
63 0.53
64 0.54
65 0.54
66 0.5
67 0.54
68 0.54
69 0.5
70 0.49
71 0.46
72 0.45
73 0.46
74 0.53
75 0.56
76 0.61
77 0.66
78 0.69
79 0.73
80 0.72
81 0.72
82 0.68
83 0.67
84 0.63
85 0.61
86 0.65
87 0.65
88 0.6
89 0.58
90 0.63
91 0.62
92 0.61
93 0.58
94 0.53
95 0.54
96 0.55
97 0.51
98 0.43
99 0.38
100 0.34
101 0.32
102 0.26
103 0.21
104 0.18
105 0.17
106 0.16
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.1
117 0.08
118 0.08
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.16
123 0.19
124 0.23
125 0.22
126 0.22
127 0.24
128 0.31
129 0.31
130 0.25
131 0.22
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.17
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.18
148 0.25
149 0.26
150 0.27
151 0.27
152 0.26
153 0.26
154 0.3
155 0.33
156 0.31
157 0.29
158 0.28
159 0.27
160 0.27
161 0.26
162 0.18
163 0.17
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.16
178 0.24
179 0.31
180 0.32
181 0.34
182 0.37
183 0.43
184 0.5
185 0.57
186 0.6
187 0.61
188 0.65
189 0.67
190 0.68
191 0.7
192 0.68
193 0.64
194 0.59
195 0.56
196 0.55
197 0.59
198 0.61
199 0.58
200 0.63
201 0.68
202 0.71
203 0.76
204 0.8
205 0.81
206 0.83
207 0.86
208 0.82
209 0.79
210 0.78
211 0.69
212 0.68
213 0.64
214 0.52
215 0.46
216 0.38
217 0.3
218 0.25
219 0.23
220 0.15
221 0.14
222 0.17
223 0.16
224 0.19
225 0.23
226 0.22
227 0.28
228 0.35
229 0.4
230 0.41
231 0.47
232 0.47
233 0.47
234 0.48
235 0.46
236 0.41
237 0.38
238 0.35
239 0.28
240 0.25
241 0.2
242 0.18
243 0.14
244 0.11
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.2
251 0.29
252 0.37
253 0.41
254 0.5
255 0.6
256 0.69
257 0.78
258 0.76
259 0.76
260 0.76
261 0.79
262 0.76
263 0.7
264 0.62
265 0.52
266 0.45
267 0.36
268 0.29
269 0.2
270 0.14
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.09
289 0.12
290 0.16
291 0.17
292 0.16
293 0.17
294 0.23
295 0.25
296 0.28
297 0.29
298 0.27
299 0.27
300 0.29
301 0.28
302 0.23
303 0.23
304 0.23
305 0.24
306 0.22
307 0.23
308 0.21
309 0.21
310 0.22
311 0.19
312 0.15
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.12
340 0.17
341 0.21
342 0.2
343 0.22
344 0.3
345 0.32
346 0.35
347 0.41
348 0.42
349 0.41
350 0.45
351 0.42
352 0.34
353 0.31
354 0.3
355 0.25
356 0.24
357 0.24
358 0.2
359 0.24
360 0.25
361 0.23
362 0.22
363 0.21
364 0.18
365 0.18
366 0.2
367 0.22
368 0.26
369 0.27
370 0.27
371 0.27
372 0.25
373 0.22
374 0.21
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.15
379 0.17
380 0.17
381 0.21
382 0.21
383 0.2
384 0.18
385 0.17
386 0.16
387 0.14
388 0.14
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.15
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.16
405 0.15
406 0.17
407 0.16
408 0.16
409 0.21
410 0.25
411 0.26
412 0.26
413 0.28
414 0.28
415 0.29
416 0.26
417 0.22
418 0.19
419 0.15
420 0.13
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.19
434 0.26
435 0.32
436 0.34
437 0.33
438 0.37
439 0.39
440 0.42
441 0.47
442 0.49
443 0.5
444 0.53
445 0.58
446 0.6
447 0.64
448 0.63
449 0.59
450 0.57
451 0.55
452 0.55
453 0.55
454 0.53
455 0.47
456 0.45
457 0.39
458 0.33
459 0.28
460 0.25
461 0.23
462 0.19
463 0.21
464 0.24
465 0.29
466 0.28
467 0.28
468 0.27
469 0.28
470 0.26
471 0.23
472 0.21
473 0.17
474 0.16
475 0.19
476 0.16
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.1
481 0.08
482 0.08
483 0.06
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.11
499 0.11
500 0.15
501 0.21
502 0.28
503 0.32
504 0.35
505 0.36
506 0.37
507 0.41
508 0.39
509 0.37
510 0.33
511 0.3
512 0.3
513 0.3
514 0.34
515 0.32
516 0.33
517 0.38
518 0.36
519 0.39
520 0.37
521 0.36
522 0.28
523 0.26
524 0.26
525 0.18
526 0.22
527 0.18
528 0.17
529 0.16
530 0.16
531 0.16
532 0.16
533 0.16
534 0.11
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.14
539 0.14
540 0.13
541 0.12
542 0.1
543 0.09
544 0.09
545 0.1
546 0.11
547 0.15
548 0.19
549 0.24
550 0.26
551 0.26
552 0.27
553 0.3
554 0.3
555 0.29
556 0.3
557 0.28
558 0.25
559 0.25
560 0.24
561 0.22
562 0.19
563 0.15
564 0.11
565 0.09
566 0.1
567 0.14
568 0.18
569 0.24
570 0.27
571 0.32
572 0.34
573 0.36
574 0.38
575 0.41
576 0.39
577 0.33
578 0.33
579 0.28
580 0.28
581 0.27
582 0.27
583 0.26
584 0.29
585 0.31
586 0.31
587 0.39
588 0.39
589 0.4
590 0.45
591 0.45
592 0.48
593 0.54
594 0.53
595 0.49
596 0.46
597 0.45
598 0.43
599 0.46
600 0.46
601 0.41
602 0.4
603 0.4
604 0.45
605 0.46
606 0.43
607 0.35
608 0.27
609 0.26
610 0.26
611 0.25
612 0.2
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.22
617 0.23
618 0.27
619 0.26
620 0.27
621 0.27
622 0.27
623 0.31
624 0.28
625 0.26
626 0.23
627 0.24
628 0.25
629 0.26
630 0.29
631 0.27
632 0.28
633 0.28
634 0.28
635 0.34
636 0.35
637 0.38
638 0.36
639 0.38
640 0.37
641 0.34
642 0.35
643 0.29
644 0.27
645 0.23
646 0.17
647 0.16
648 0.2
649 0.22
650 0.2
651 0.21
652 0.24
653 0.32
654 0.39
655 0.46
656 0.5
657 0.57
658 0.63
659 0.66
660 0.67
661 0.67
662 0.69
663 0.66
664 0.62
665 0.61
666 0.62
667 0.64
668 0.65
669 0.64
670 0.65
671 0.68
672 0.73
673 0.73
674 0.71
675 0.73
676 0.76
677 0.78
678 0.78
679 0.72
680 0.7
681 0.69
682 0.7
683 0.69
684 0.65
685 0.59
686 0.53
687 0.57
688 0.58
689 0.58
690 0.57
691 0.56
692 0.58
693 0.64
694 0.71
695 0.72
696 0.69
697 0.67
698 0.7
699 0.72
700 0.74
701 0.71
702 0.69
703 0.62
704 0.65
705 0.63
706 0.59
707 0.56
708 0.52
709 0.48
710 0.4
711 0.4
712 0.39
713 0.42
714 0.38
715 0.34
716 0.33
717 0.37
718 0.42
719 0.44
720 0.39
721 0.36
722 0.35
723 0.34
724 0.3
725 0.25
726 0.19
727 0.16
728 0.16
729 0.13
730 0.15
731 0.16
732 0.17
733 0.17
734 0.2
735 0.21
736 0.26
737 0.26
738 0.29
739 0.3
740 0.36
741 0.37
742 0.35
743 0.34
744 0.31
745 0.31
746 0.27
747 0.25
748 0.18
749 0.18
750 0.22
751 0.22
752 0.22
753 0.2
754 0.23
755 0.27
756 0.32
757 0.39
758 0.41
759 0.43
760 0.46
761 0.5
762 0.52
763 0.55
764 0.53
765 0.49
766 0.46
767 0.51
768 0.48
769 0.48
770 0.48
771 0.45
772 0.43
773 0.41
774 0.42
775 0.42
776 0.42
777 0.44
778 0.43
779 0.4
780 0.38
781 0.4
782 0.42
783 0.36
784 0.33
785 0.28
786 0.27
787 0.25
788 0.25
789 0.26
790 0.23
791 0.22
792 0.31
793 0.37
794 0.41
795 0.46
796 0.49
797 0.52
798 0.58
799 0.65
800 0.65
801 0.67
802 0.69
803 0.73
804 0.75
805 0.73
806 0.66
807 0.63
808 0.6
809 0.58
810 0.55
811 0.5
812 0.45
813 0.47
814 0.5
815 0.51
816 0.49
817 0.49
818 0.49
819 0.51
820 0.56
821 0.54
822 0.51
823 0.49
824 0.49
825 0.52
826 0.47
827 0.41
828 0.38
829 0.33
830 0.31
831 0.27
832 0.24
833 0.18
834 0.2
835 0.24
836 0.24
837 0.23
838 0.23
839 0.23
840 0.26
841 0.24
842 0.22
843 0.18
844 0.22
845 0.25
846 0.3
847 0.38
848 0.37
849 0.43
850 0.5
851 0.6
852 0.64
853 0.73
854 0.73
855 0.76
856 0.75
857 0.75
858 0.69
859 0.66
860 0.64
861 0.61
862 0.61
863 0.52
864 0.5
865 0.44
866 0.43
867 0.35
868 0.31
869 0.23
870 0.18
871 0.19
872 0.2
873 0.2
874 0.21
875 0.21
876 0.22
877 0.24
878 0.26
879 0.27
880 0.29
881 0.33
882 0.37
883 0.38
884 0.39
885 0.36
886 0.34
887 0.31
888 0.31
889 0.27
890 0.21
891 0.22
892 0.21
893 0.23
894 0.23
895 0.26
896 0.23
897 0.29
898 0.33
899 0.35
900 0.36
901 0.37
902 0.41
903 0.42
904 0.43
905 0.45
906 0.51
907 0.52
908 0.55
909 0.57
910 0.59
911 0.6
912 0.65
913 0.63
914 0.57
915 0.61
916 0.56
917 0.57
918 0.55
919 0.57
920 0.56
921 0.58
922 0.61
923 0.59
924 0.63
925 0.62
926 0.61
927 0.58
928 0.56
929 0.52
930 0.48
931 0.46
932 0.43
933 0.39
934 0.36
935 0.37
936 0.38
937 0.35
938 0.43
939 0.42
940 0.44
941 0.47
942 0.49
943 0.44
944 0.37
945 0.36
946 0.27
947 0.26
948 0.2
949 0.16
950 0.14
951 0.14
952 0.16
953 0.16
954 0.18
955 0.16
956 0.18
957 0.24
958 0.32
959 0.4
960 0.48
961 0.55
962 0.58
963 0.62
964 0.59
965 0.59
966 0.57
967 0.54
968 0.48
969 0.43
970 0.4
971 0.4
972 0.41
973 0.36
974 0.31
975 0.29
976 0.28
977 0.24
978 0.25
979 0.3
980 0.32
981 0.35
982 0.38