FuNGI

A0A5N5MGS4

Protein Details

Accession

A0A5N5MGS4

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-48	MEDVKSEKKHKRSKSEKKRQREEDEAASPRHHKKSKKHNQDEEQTTPA	Basic
55-82	KREGSVEPEKKKKSNKHRKSKDFANGED	Basic
90-109	QDEEPAKKSKKQKHGDAGSE	Basic
114-168	APLEAEQTPKKKKKKDKSKKEKKADKDEEPADESQSKRKSKKKRKEKEAADDVDM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-37	EKKHKRSKSEKKRQREEDEAASPRHHKKSKK
62-75	PEKKKKSNKHRKSK
96-102	KKSKKQK
122-160	PKKKKKKDKSKKEKKADKDEEPADESQSKRKSKKKRKEK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MEDVKSEKKHKRSKSEKKRQREEDEAASPRHHKKSKKHNQDEEQTTPAEELSSIKREGSVEPEKKKKSNKHRKSKDFANGEDVKPDHPSQDEEPAKKSKKQKHGDAGSEAEAEAPLEAEQTPKKKKKKDKSKKEKKADKDEEPADESQSKRKSKKKRKEKEAADDVDMMDVDNAQPATATTTTSASDPGFPFYTQTISLYVPFYPIGFDKPITNVASQHLEPLLNHYSPLLRGVLLAYRNVNLSERPVRPNPKHLPDDHTPALVESLDEYAVGFGWLTADVDLFIPSRGAWMEGTVNLQSDGHVGVVCFNKFNASIEAKRLPSGWRWVDLNENHHNSSSTKPQGKHTFLSADPDTPEGTDILDDSPLELAELHTTGYWVNEAGEKVSSMPLRFRIKNFDVGVAGDYGYISIEGTTLDDEEEREMGRQERELEQRRKERQTAGGLVRPNLRRVPEFSLTSFGKEDQEEDSIKKTVIYQGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.93
3	0.93
4	0.94
5	0.95
6	0.94
7	0.92
8	0.9
9	0.85
10	0.82
11	0.81
12	0.75
13	0.67
14	0.61
15	0.59
16	0.58
17	0.61
18	0.6
19	0.59
20	0.64
21	0.73
22	0.8
23	0.84
24	0.87
25	0.88
26	0.91
27	0.92
28	0.9
29	0.84
30	0.76
31	0.65
32	0.55
33	0.44
34	0.34
35	0.24
36	0.16
37	0.14
38	0.15
39	0.19
40	0.19
41	0.19
42	0.21
43	0.22
44	0.23
45	0.28
46	0.33
47	0.38
48	0.46
49	0.55
50	0.6
51	0.66
52	0.75
53	0.77
54	0.78
55	0.81
56	0.83
57	0.85
58	0.9
59	0.93
60	0.92
61	0.91
62	0.9
63	0.86
64	0.78
65	0.75
66	0.69
67	0.6
68	0.56
69	0.47
70	0.38
71	0.35
72	0.33
73	0.26
74	0.22
75	0.26
76	0.23
77	0.32
78	0.38
79	0.36
80	0.4
81	0.48
82	0.51
83	0.53
84	0.6
85	0.6
86	0.64
87	0.71
88	0.76
89	0.77
90	0.81
91	0.79
92	0.74
93	0.68
94	0.59
95	0.5
96	0.4
97	0.29
98	0.2
99	0.15
100	0.1
101	0.07
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.08
106	0.12
107	0.2
108	0.3
109	0.39
110	0.48
111	0.57
112	0.68
113	0.76
114	0.84
115	0.88
116	0.89
117	0.92
118	0.95
119	0.96
120	0.96
121	0.95
122	0.93
123	0.93
124	0.9
125	0.86
126	0.83
127	0.75
128	0.67
129	0.61
130	0.52
131	0.44
132	0.39
133	0.32
134	0.32
135	0.37
136	0.4
137	0.45
138	0.53
139	0.61
140	0.68
141	0.78
142	0.82
143	0.85
144	0.89
145	0.91
146	0.92
147	0.91
148	0.9
149	0.82
150	0.73
151	0.63
152	0.52
153	0.42
154	0.32
155	0.21
156	0.11
157	0.08
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.05
163	0.05
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.12
172	0.09
173	0.12
174	0.12
175	0.14
176	0.14
177	0.13
178	0.14
179	0.14
180	0.15
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.09
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.11
198	0.15
199	0.15
200	0.15
201	0.14
202	0.15
203	0.17
204	0.17
205	0.16
206	0.13
207	0.12
208	0.11
209	0.15
210	0.16
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.14
217	0.09
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.08
230	0.11
231	0.17
232	0.19
233	0.23
234	0.28
235	0.36
236	0.37
237	0.46
238	0.49
239	0.5
240	0.51
241	0.49
242	0.5
243	0.45
244	0.51
245	0.42
246	0.35
247	0.28
248	0.24
249	0.23
250	0.16
251	0.12
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.02
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.05
276	0.06
277	0.05
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.05
291	0.05
292	0.08
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.13
300	0.15
301	0.17
302	0.18
303	0.22
304	0.27
305	0.26
306	0.27
307	0.26
308	0.24
309	0.23
310	0.3
311	0.27
312	0.25
313	0.26
314	0.26
315	0.33
316	0.33
317	0.37
318	0.36
319	0.38
320	0.36
321	0.36
322	0.36
323	0.3
324	0.31
325	0.32
326	0.32
327	0.35
328	0.36
329	0.45
330	0.52
331	0.55
332	0.53
333	0.48
334	0.44
335	0.38
336	0.43
337	0.35
338	0.28
339	0.25
340	0.24
341	0.21
342	0.17
343	0.17
344	0.1
345	0.09
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.15
374	0.16
375	0.15
376	0.18
377	0.25
378	0.32
379	0.35
380	0.37
381	0.42
382	0.43
383	0.5
384	0.48
385	0.43
386	0.36
387	0.34
388	0.32
389	0.23
390	0.2
391	0.12
392	0.1
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.08
406	0.09
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.13
411	0.16
412	0.17
413	0.19
414	0.21
415	0.28
416	0.37
417	0.46
418	0.53
419	0.59
420	0.67
421	0.73
422	0.78
423	0.76
424	0.73
425	0.7
426	0.7
427	0.69
428	0.65
429	0.62
430	0.57
431	0.55
432	0.57
433	0.52
434	0.48
435	0.44
436	0.42
437	0.4
438	0.42
439	0.46
440	0.45
441	0.45
442	0.42
443	0.45
444	0.42
445	0.41
446	0.38
447	0.31
448	0.28
449	0.25
450	0.25
451	0.21
452	0.24
453	0.24
454	0.24
455	0.27
456	0.25
457	0.25
458	0.24
459	0.23
460	0.26
461	0.32
462	0.35
463	0.35
464	0.44
465	0.49
466	0.49

A0A5N5MGS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer