Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MBE3

Protein Details
Accession C5MBE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-27SSKPSTPRTDRRQVHGNRRHSHRSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-135ERIKNLKKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013962  DASH_Dam1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0042729  C:DASH complex  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0072686  C:mitotic spindle  
GO:0008608  P:attachment of spindle microtubules to kinetochore  
KEGG ctp:CTRG_03385  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08653  DASH_Dam1  
CDD cd00890  Prefoldin  
Amino Acid Sequences MSSSKPSTPRTDRRQVHGNRRHSHRSSGIHLPSLSPKVHHYPIDADNLPMDSTEIVEKFNDIAQSMEILDNNMNDLCHIHDNLSNQFNESFASFLYGLSMTMWCVDFPGCPNRVEWENLMAKREQKERIKNLKKRVEDAKILNNRLKESLAEKTKQKPTPSVTTINKPRPMNTRVVKPTRTVNFKPSSNESTISSITNDRRPVATRIRQSQQASRIPQPGRINRQHQYQTAASGVGGPNLNQPPRYMRGLFDGSNTSNTSNYGRVVKPSSQTKNKSTNSLANRPPFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.81
4 0.8
5 0.81
6 0.79
7 0.81
8 0.84
9 0.77
10 0.76
11 0.72
12 0.69
13 0.65
14 0.65
15 0.6
16 0.55
17 0.51
18 0.46
19 0.44
20 0.42
21 0.37
22 0.29
23 0.3
24 0.32
25 0.37
26 0.36
27 0.32
28 0.34
29 0.36
30 0.42
31 0.38
32 0.31
33 0.27
34 0.27
35 0.24
36 0.18
37 0.15
38 0.08
39 0.08
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.13
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.14
68 0.17
69 0.21
70 0.24
71 0.21
72 0.2
73 0.2
74 0.19
75 0.17
76 0.14
77 0.1
78 0.07
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.09
95 0.15
96 0.15
97 0.16
98 0.16
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.2
103 0.2
104 0.24
105 0.24
106 0.26
107 0.24
108 0.26
109 0.28
110 0.32
111 0.34
112 0.36
113 0.44
114 0.52
115 0.62
116 0.69
117 0.72
118 0.77
119 0.78
120 0.72
121 0.68
122 0.65
123 0.59
124 0.54
125 0.5
126 0.49
127 0.47
128 0.48
129 0.45
130 0.39
131 0.35
132 0.31
133 0.28
134 0.19
135 0.16
136 0.2
137 0.22
138 0.24
139 0.27
140 0.33
141 0.41
142 0.44
143 0.44
144 0.42
145 0.43
146 0.47
147 0.48
148 0.49
149 0.44
150 0.48
151 0.55
152 0.56
153 0.58
154 0.51
155 0.51
156 0.5
157 0.5
158 0.5
159 0.45
160 0.47
161 0.49
162 0.55
163 0.53
164 0.48
165 0.53
166 0.5
167 0.54
168 0.47
169 0.47
170 0.47
171 0.47
172 0.49
173 0.47
174 0.45
175 0.39
176 0.39
177 0.32
178 0.3
179 0.29
180 0.25
181 0.21
182 0.21
183 0.23
184 0.26
185 0.26
186 0.24
187 0.25
188 0.27
189 0.31
190 0.36
191 0.4
192 0.43
193 0.49
194 0.52
195 0.57
196 0.57
197 0.58
198 0.57
199 0.57
200 0.54
201 0.52
202 0.56
203 0.5
204 0.54
205 0.56
206 0.56
207 0.58
208 0.62
209 0.64
210 0.6
211 0.68
212 0.66
213 0.6
214 0.57
215 0.49
216 0.43
217 0.36
218 0.32
219 0.23
220 0.2
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.18
226 0.23
227 0.25
228 0.22
229 0.24
230 0.27
231 0.31
232 0.36
233 0.31
234 0.27
235 0.32
236 0.36
237 0.35
238 0.32
239 0.33
240 0.29
241 0.31
242 0.31
243 0.25
244 0.21
245 0.22
246 0.22
247 0.2
248 0.21
249 0.24
250 0.24
251 0.28
252 0.33
253 0.35
254 0.4
255 0.48
256 0.55
257 0.59
258 0.65
259 0.68
260 0.73
261 0.72
262 0.72
263 0.68
264 0.68
265 0.66
266 0.69
267 0.69