Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M6D3

Protein Details
Accession C5M6D3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-456RINKIDLSKVKKRKFARDKTSHRRIPFISKKNKDNAYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-448KVKKRKFARDKTSHRRIPFISK
Subcellular Location(s) plas 5E.R. 5, mito 4, cyto 3, golg 3, mito_nucl 3, nucl 2, extr 2, vacu 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028000  Pma1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_01414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14610  Psg1  
Amino Acid Sequences MKVSSIAIVAALMSLTNAAVVPEDLLPLETPAPTPTSSVSEPIRLFKRVRDVIINKDYAKNQAAKTQSSTTETPPPKWIRTYDGKTEIVTPTVIQGVTFSAQPPTTTNGLEWWVSLKDDGSPKTIKPQNKNGQIKNGRPDYSTWFQTATTITYNKEQLKAHNMADDEIFEEVKYIQEADLETHLLSPLIRCTPDRYKKKGIGRDKSTAPFCTPKDNSRLTMGKVYFITWYSRFFDEDVKNVRIHLNYISEKWTQKGLKKRDDNSTEEFVEDDDTTEDIVEASEIKRRSSVLEQGGKISSNFFKSDPIDVDVGWFALDISPDWFDKEYWRKVLVTVVPEGYEDREDYDVFQNSIVIEIWKGVKVGKGHLEDLKRLEEKYANRHIYDIEVEEGINFDEYMMMIALPTCVVLAALGMWLFVRINKIDLSKVKKRKFARDKTSHRRIPFISKKNKDNAYTELPQFSTELDNVKND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.05
7 0.05
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.14
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.2
24 0.2
25 0.25
26 0.25
27 0.3
28 0.31
29 0.37
30 0.39
31 0.39
32 0.39
33 0.39
34 0.47
35 0.45
36 0.47
37 0.5
38 0.5
39 0.55
40 0.61
41 0.6
42 0.52
43 0.53
44 0.51
45 0.46
46 0.46
47 0.42
48 0.36
49 0.39
50 0.4
51 0.38
52 0.41
53 0.4
54 0.39
55 0.38
56 0.39
57 0.36
58 0.42
59 0.43
60 0.41
61 0.45
62 0.48
63 0.47
64 0.49
65 0.47
66 0.45
67 0.51
68 0.55
69 0.54
70 0.55
71 0.53
72 0.49
73 0.5
74 0.44
75 0.35
76 0.29
77 0.2
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.13
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.18
106 0.19
107 0.21
108 0.23
109 0.23
110 0.32
111 0.38
112 0.41
113 0.44
114 0.53
115 0.59
116 0.67
117 0.76
118 0.7
119 0.75
120 0.75
121 0.74
122 0.71
123 0.68
124 0.58
125 0.5
126 0.49
127 0.46
128 0.43
129 0.39
130 0.32
131 0.27
132 0.25
133 0.25
134 0.24
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.18
140 0.23
141 0.24
142 0.28
143 0.27
144 0.27
145 0.32
146 0.35
147 0.32
148 0.3
149 0.29
150 0.25
151 0.24
152 0.21
153 0.14
154 0.11
155 0.1
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.16
179 0.26
180 0.36
181 0.44
182 0.49
183 0.55
184 0.62
185 0.69
186 0.73
187 0.73
188 0.72
189 0.7
190 0.69
191 0.65
192 0.63
193 0.57
194 0.49
195 0.42
196 0.38
197 0.33
198 0.36
199 0.34
200 0.32
201 0.36
202 0.37
203 0.36
204 0.35
205 0.37
206 0.3
207 0.34
208 0.3
209 0.26
210 0.24
211 0.23
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.13
216 0.15
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.22
222 0.2
223 0.24
224 0.26
225 0.26
226 0.25
227 0.25
228 0.26
229 0.19
230 0.19
231 0.16
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.2
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.25
240 0.23
241 0.28
242 0.36
243 0.41
244 0.48
245 0.55
246 0.58
247 0.61
248 0.63
249 0.62
250 0.58
251 0.54
252 0.44
253 0.37
254 0.32
255 0.23
256 0.2
257 0.15
258 0.11
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.15
275 0.17
276 0.24
277 0.27
278 0.33
279 0.33
280 0.34
281 0.35
282 0.32
283 0.28
284 0.25
285 0.19
286 0.15
287 0.16
288 0.14
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.17
297 0.14
298 0.12
299 0.09
300 0.07
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.17
312 0.25
313 0.29
314 0.3
315 0.33
316 0.32
317 0.32
318 0.37
319 0.33
320 0.27
321 0.25
322 0.22
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.16
327 0.13
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.14
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.14
339 0.15
340 0.13
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.13
349 0.14
350 0.18
351 0.24
352 0.25
353 0.27
354 0.33
355 0.35
356 0.34
357 0.36
358 0.38
359 0.33
360 0.3
361 0.31
362 0.31
363 0.33
364 0.39
365 0.46
366 0.43
367 0.42
368 0.43
369 0.4
370 0.37
371 0.34
372 0.27
373 0.19
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.11
379 0.09
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.1
406 0.1
407 0.12
408 0.15
409 0.17
410 0.23
411 0.31
412 0.38
413 0.45
414 0.55
415 0.6
416 0.66
417 0.72
418 0.77
419 0.81
420 0.83
421 0.84
422 0.85
423 0.89
424 0.91
425 0.94
426 0.91
427 0.83
428 0.8
429 0.73
430 0.73
431 0.73
432 0.73
433 0.73
434 0.73
435 0.78
436 0.8
437 0.83
438 0.77
439 0.7
440 0.67
441 0.64
442 0.62
443 0.58
444 0.53
445 0.46
446 0.41
447 0.37
448 0.31
449 0.27
450 0.22
451 0.23