Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M5H3

Protein Details
Accession C5M5H3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
490-524DEMDKQQKLRLRRAAKRKRKRAMENKPQENKKVKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-521KLRLRRAAKRKRKRAMENKPQENKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012173  Mpp10  
Gene Ontology GO:0034457  C:Mpp10 complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ctp:CTRG_01103  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04006  Mpp10  
Amino Acid Sequences MKKKSKMGLLVMASNTMSQDILQLLQDKPQEIFNLKEKSSYFNLLAKSFLDPLTKEYSVLDEIYVDGLDSTQVFGQTKMVLDGVGEKLLGEKIPNVVERLEMMEDPEEQSEEDLSEQEQSDEVDEEEKDDEERGELEEKQPEESEQELEGEKEEEEEENELSEEQQSEEEENDETEYKKDAFGLNDGFFDIDEFNKQILAMEKDDFGNDDEDDEDEDEEEESDSDSEVVDYYSDFFGGKKGNKNKDDEDIEDNEEEGEGERGGELNEDEYAVGETMRDMFGDEDEEEEEESEKSLSSFQKRQRAIQAEIAKLEAELIEPKKWTMKGEVSSANRGSLLDTDELKFDRTAKPVPTITEESTQTLEALIIKRIKEGEFDDLPRRVMTEIPHHKTTEQFEIPTEKKSLAELYEDEYHQKDDVKEDPAKDALKEEISELFKTVMSQLDRAQSAYNSFEIKVKDGNLEDASLHAVGTESKLAPQEIYKGGLTYSKDEMDKQQKLRLRRAAKRKRKRAMENKPQENKKVKVTETLSKAKNITLIDKNGDFRDTQGNIKKNQSMNNFKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.25
3 0.17
4 0.14
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.15
11 0.15
12 0.2
13 0.23
14 0.22
15 0.22
16 0.24
17 0.26
18 0.26
19 0.3
20 0.33
21 0.38
22 0.37
23 0.41
24 0.39
25 0.4
26 0.42
27 0.42
28 0.37
29 0.35
30 0.38
31 0.34
32 0.34
33 0.3
34 0.28
35 0.25
36 0.24
37 0.22
38 0.19
39 0.23
40 0.28
41 0.27
42 0.25
43 0.24
44 0.25
45 0.23
46 0.23
47 0.19
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.08
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.12
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.19
125 0.19
126 0.21
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.14
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.16
170 0.19
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.15
175 0.13
176 0.12
177 0.1
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.11
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.12
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.12
225 0.15
226 0.22
227 0.31
228 0.39
229 0.43
230 0.48
231 0.48
232 0.5
233 0.49
234 0.44
235 0.4
236 0.33
237 0.32
238 0.27
239 0.25
240 0.18
241 0.15
242 0.12
243 0.08
244 0.06
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.08
282 0.11
283 0.15
284 0.22
285 0.28
286 0.37
287 0.38
288 0.41
289 0.46
290 0.48
291 0.46
292 0.47
293 0.47
294 0.39
295 0.38
296 0.35
297 0.27
298 0.21
299 0.18
300 0.1
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.21
312 0.22
313 0.26
314 0.32
315 0.31
316 0.34
317 0.33
318 0.29
319 0.24
320 0.22
321 0.19
322 0.13
323 0.13
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.2
335 0.21
336 0.25
337 0.25
338 0.26
339 0.29
340 0.3
341 0.29
342 0.29
343 0.28
344 0.25
345 0.25
346 0.23
347 0.18
348 0.14
349 0.12
350 0.1
351 0.1
352 0.13
353 0.15
354 0.14
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.18
360 0.21
361 0.21
362 0.24
363 0.28
364 0.28
365 0.28
366 0.26
367 0.24
368 0.19
369 0.18
370 0.17
371 0.23
372 0.32
373 0.36
374 0.39
375 0.39
376 0.4
377 0.41
378 0.43
379 0.4
380 0.32
381 0.27
382 0.26
383 0.33
384 0.33
385 0.33
386 0.3
387 0.22
388 0.21
389 0.21
390 0.22
391 0.15
392 0.17
393 0.15
394 0.18
395 0.2
396 0.2
397 0.21
398 0.2
399 0.2
400 0.18
401 0.2
402 0.17
403 0.17
404 0.2
405 0.24
406 0.27
407 0.27
408 0.29
409 0.3
410 0.3
411 0.27
412 0.25
413 0.22
414 0.2
415 0.19
416 0.17
417 0.19
418 0.2
419 0.2
420 0.19
421 0.18
422 0.16
423 0.16
424 0.16
425 0.16
426 0.15
427 0.17
428 0.19
429 0.23
430 0.23
431 0.23
432 0.24
433 0.19
434 0.2
435 0.2
436 0.19
437 0.16
438 0.17
439 0.2
440 0.19
441 0.2
442 0.21
443 0.2
444 0.22
445 0.21
446 0.25
447 0.21
448 0.21
449 0.19
450 0.17
451 0.17
452 0.13
453 0.12
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.09
458 0.11
459 0.09
460 0.11
461 0.13
462 0.14
463 0.14
464 0.15
465 0.19
466 0.18
467 0.21
468 0.19
469 0.18
470 0.18
471 0.21
472 0.22
473 0.21
474 0.22
475 0.23
476 0.24
477 0.25
478 0.34
479 0.4
480 0.46
481 0.46
482 0.5
483 0.52
484 0.58
485 0.66
486 0.66
487 0.67
488 0.69
489 0.77
490 0.8
491 0.86
492 0.9
493 0.92
494 0.92
495 0.92
496 0.94
497 0.94
498 0.94
499 0.94
500 0.94
501 0.94
502 0.94
503 0.9
504 0.88
505 0.86
506 0.79
507 0.77
508 0.74
509 0.65
510 0.64
511 0.63
512 0.62
513 0.61
514 0.66
515 0.59
516 0.56
517 0.55
518 0.47
519 0.46
520 0.39
521 0.39
522 0.37
523 0.39
524 0.4
525 0.42
526 0.45
527 0.42
528 0.41
529 0.34
530 0.29
531 0.33
532 0.31
533 0.36
534 0.41
535 0.45
536 0.49
537 0.56
538 0.6
539 0.56
540 0.62
541 0.63