FuNGI

A0A5N5K6G9

Protein Details

Accession

A0A5N5K6G9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-63	ANMEDVKSEKKHKRSKSEKKRQREEDEAASPRHHKKSKKHNQDEEQTTPA	Basic
74-99	FVEAETKKKSKKHRKSKDFTNGEDVK	Basic
103-128	PSQGEEPAKKSKKHKKQKHVDAESEA	Basic
133-185	PQEGEQTPKNKKKDKSKKEKKADKDEEPADESQSKRKSKKKRKEKEAVDDVDM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-52	EKKHKRSKSEKKRQREEDEAASPRHHKKSKK
80-90	KKKSKKHRKSK
109-120	PAKKSKKHKKQK
140-177	PKNKKKDKSKKEKKADKDEEPADESQSKRKSKKKRKEK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MPAAILLDDEPSTANMEDVKSEKKHKRSKSEKKRQREEDEAASPRHHKKSKKHNQDEEQTTPAEELSSIKREVFVEAETKKKSKKHRKSKDFTNGEDVKPDHPSQGEEPAKKSKKHKKQKHVDAESEAEAEAPQEGEQTPKNKKKDKSKKEKKADKDEEPADESQSKRKSKKKRKEKEAVDDVDMMDVDDAQPATATTTTSSSDPGFPFYTQTISLYVPFYPIGFDKPITNVASQHLEPLLNHYSPLLRGVLLAYRNVNLSERPVRPNPKHLPDDHTPALVESLDEYAVGFGWLTADVDLFIPSRGAWMEGTVNLQSEGHVGVVCFNKFNASIEAKRLPSGWRWVDLNENHNSSSSTKPQGKHTFLSADPDTPDGTDILDDSPLELAELHTTGYWVNEAGEKVSSMPLRFRIKNFDVGVAGDYGYISIEGTTLDDEEEREMGRQERELEQRRKERQTAGGLVRPNLRRVPEFSLTSFGKEDQEEDSIKKTVIYQGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.12
4	0.15
5	0.18
6	0.24
7	0.27
8	0.37
9	0.45
10	0.53
11	0.63
12	0.69
13	0.78
14	0.82
15	0.89
16	0.9
17	0.93
18	0.93
19	0.94
20	0.95
21	0.94
22	0.92
23	0.89
24	0.84
25	0.81
26	0.8
27	0.74
28	0.66
29	0.6
30	0.58
31	0.57
32	0.6
33	0.58
34	0.58
35	0.63
36	0.72
37	0.79
38	0.84
39	0.87
40	0.88
41	0.9
42	0.92
43	0.9
44	0.83
45	0.75
46	0.64
47	0.54
48	0.43
49	0.34
50	0.23
51	0.16
52	0.13
53	0.15
54	0.18
55	0.19
56	0.18
57	0.21
58	0.21
59	0.22
60	0.21
61	0.18
62	0.21
63	0.23
64	0.3
65	0.32
66	0.36
67	0.4
68	0.46
69	0.55
70	0.59
71	0.68
72	0.72
73	0.79
74	0.86
75	0.89
76	0.94
77	0.93
78	0.89
79	0.82
80	0.81
81	0.74
82	0.64
83	0.6
84	0.5
85	0.42
86	0.39
87	0.36
88	0.28
89	0.24
90	0.27
91	0.24
92	0.32
93	0.37
94	0.35
95	0.38
96	0.47
97	0.52
98	0.55
99	0.63
100	0.64
101	0.68
102	0.76
103	0.83
104	0.83
105	0.88
106	0.93
107	0.94
108	0.91
109	0.86
110	0.79
111	0.72
112	0.62
113	0.51
114	0.4
115	0.28
116	0.2
117	0.15
118	0.1
119	0.07
120	0.05
121	0.06
122	0.06
123	0.09
124	0.13
125	0.19
126	0.28
127	0.36
128	0.44
129	0.52
130	0.59
131	0.68
132	0.76
133	0.81
134	0.83
135	0.86
136	0.89
137	0.92
138	0.94
139	0.92
140	0.93
141	0.9
142	0.85
143	0.82
144	0.74
145	0.66
146	0.6
147	0.51
148	0.42
149	0.37
150	0.31
151	0.31
152	0.36
153	0.4
154	0.44
155	0.52
156	0.6
157	0.68
158	0.78
159	0.81
160	0.85
161	0.88
162	0.91
163	0.92
164	0.91
165	0.89
166	0.82
167	0.73
168	0.63
169	0.52
170	0.41
171	0.32
172	0.21
173	0.11
174	0.07
175	0.05
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.05
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.1
189	0.1
190	0.13
191	0.13
192	0.15
193	0.15
194	0.14
195	0.16
196	0.15
197	0.15
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.11
202	0.12
203	0.11
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.09
214	0.11
215	0.14
216	0.15
217	0.15
218	0.14
219	0.14
220	0.17
221	0.16
222	0.16
223	0.13
224	0.12
225	0.11
226	0.15
227	0.16
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.13
234	0.09
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.08
247	0.11
248	0.17
249	0.19
250	0.23
251	0.29
252	0.37
253	0.38
254	0.47
255	0.5
256	0.51
257	0.52
258	0.5
259	0.51
260	0.46
261	0.51
262	0.43
263	0.36
264	0.29
265	0.25
266	0.23
267	0.16
268	0.12
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.02
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.08
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.14
317	0.15
318	0.17
319	0.18
320	0.23
321	0.28
322	0.27
323	0.27
324	0.27
325	0.24
326	0.23
327	0.3
328	0.27
329	0.26
330	0.26
331	0.27
332	0.33
333	0.34
334	0.36
335	0.32
336	0.32
337	0.29
338	0.29
339	0.29
340	0.25
341	0.26
342	0.26
343	0.29
344	0.33
345	0.35
346	0.44
347	0.51
348	0.53
349	0.5
350	0.48
351	0.45
352	0.4
353	0.44
354	0.35
355	0.29
356	0.25
357	0.24
358	0.21
359	0.17
360	0.17
361	0.1
362	0.09
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.07
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.15
391	0.17
392	0.15
393	0.18
394	0.25
395	0.32
396	0.36
397	0.37
398	0.42
399	0.43
400	0.51
401	0.49
402	0.44
403	0.37
404	0.34
405	0.32
406	0.24
407	0.2
408	0.12
409	0.1
410	0.08
411	0.07
412	0.06
413	0.05
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.13
428	0.16
429	0.17
430	0.19
431	0.22
432	0.28
433	0.37
434	0.47
435	0.53
436	0.59
437	0.67
438	0.73
439	0.78
440	0.76
441	0.73
442	0.7
443	0.7
444	0.69
445	0.65
446	0.62
447	0.57
448	0.55
449	0.57
450	0.52
451	0.48
452	0.44
453	0.42
454	0.4
455	0.42
456	0.46
457	0.45
458	0.45
459	0.43
460	0.45
461	0.42
462	0.41
463	0.38
464	0.32
465	0.28
466	0.25
467	0.25
468	0.21
469	0.24
470	0.24
471	0.24
472	0.27
473	0.25
474	0.25
475	0.24
476	0.23
477	0.26
478	0.32
479	0.35
480	0.35
481	0.44
482	0.49
483	0.49

A0A5N5K6G9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer