Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M7I3

Protein Details
Accession C5M7I3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-170AERQRKEELKKQQQKRKHDELEBasic
275-303DDEKLLKKALKRKEKQKLRSEIEWRERKQBasic
310-346AARAKRREENLKARRDNKGKKHKPRLKKFTGTVNKAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-164KKNKKKELSEEEKLKKQENLKKLREKLESKINNLREKRKAIGTKTAGAPKSRDQILAERQRKEELKKQQQKR
219-244KKKQKGPANNDIKAHLNKLEKKKKKL
274-365KDDEKLLKKALKRKEKQKLRSEIEWRERKQVVKDTVAARAKRREENLKARRDNKGKKHKPRLKKFTGTVNKAQIKKKRAGFEGSAKAKPKKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029190  Rrp14/SURF6_C  
IPR007019  SURF6  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG ctp:CTRG_01815  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04935  SURF6  
Amino Acid Sequences MDNKAKNANQVKLPKKLPKPITEESDDDDDDVEIPDMDVSGDDDDEEEEEEEEKKVKESDDDLMNEEGGLIFDDEGNEVEVTGTFKKQEIIDKKNKKKELSEEEKLKKQENLKKLREKLESKINNLREKRKAIGTKTAGAPKSRDQILAERQRKEELKKQQQKRKHDELEDEDSDSDMDSDVEEEGEKTSKDVLFGNIVFNDGSQVTSDLTKIRNSADKKKQKGPANNDIKAHLNKLEKKKKKLASMSAEDQEKQKEKDKWQRVMAQAEGIKIKDDEKLLKKALKRKEKQKLRSEIEWRERKQVVKDTVAARAKRREENLKARRDNKGKKHKPRLKKFTGTVNKAQIKKKRAGFEGSAKAKPKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.73
3 0.78
4 0.77
5 0.75
6 0.77
7 0.75
8 0.74
9 0.69
10 0.63
11 0.57
12 0.55
13 0.46
14 0.38
15 0.31
16 0.24
17 0.19
18 0.17
19 0.13
20 0.08
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.19
46 0.24
47 0.27
48 0.28
49 0.29
50 0.28
51 0.27
52 0.24
53 0.21
54 0.15
55 0.09
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.13
74 0.15
75 0.24
76 0.3
77 0.38
78 0.49
79 0.59
80 0.68
81 0.75
82 0.8
83 0.74
84 0.72
85 0.73
86 0.73
87 0.71
88 0.7
89 0.71
90 0.71
91 0.73
92 0.69
93 0.62
94 0.56
95 0.56
96 0.55
97 0.55
98 0.59
99 0.61
100 0.68
101 0.72
102 0.75
103 0.75
104 0.7
105 0.65
106 0.66
107 0.62
108 0.58
109 0.6
110 0.59
111 0.59
112 0.61
113 0.63
114 0.59
115 0.58
116 0.55
117 0.55
118 0.55
119 0.5
120 0.54
121 0.49
122 0.47
123 0.47
124 0.5
125 0.44
126 0.4
127 0.39
128 0.33
129 0.35
130 0.32
131 0.28
132 0.24
133 0.28
134 0.36
135 0.44
136 0.46
137 0.44
138 0.44
139 0.47
140 0.49
141 0.48
142 0.47
143 0.47
144 0.52
145 0.59
146 0.68
147 0.72
148 0.77
149 0.82
150 0.83
151 0.82
152 0.77
153 0.71
154 0.67
155 0.64
156 0.63
157 0.53
158 0.45
159 0.35
160 0.28
161 0.24
162 0.18
163 0.12
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.18
202 0.23
203 0.33
204 0.41
205 0.49
206 0.54
207 0.61
208 0.68
209 0.69
210 0.74
211 0.72
212 0.72
213 0.72
214 0.7
215 0.63
216 0.57
217 0.54
218 0.46
219 0.4
220 0.34
221 0.32
222 0.36
223 0.46
224 0.55
225 0.57
226 0.64
227 0.71
228 0.72
229 0.75
230 0.75
231 0.73
232 0.71
233 0.7
234 0.67
235 0.63
236 0.58
237 0.5
238 0.44
239 0.4
240 0.36
241 0.33
242 0.35
243 0.37
244 0.45
245 0.55
246 0.62
247 0.64
248 0.66
249 0.71
250 0.68
251 0.66
252 0.57
253 0.52
254 0.44
255 0.39
256 0.34
257 0.27
258 0.23
259 0.19
260 0.19
261 0.16
262 0.17
263 0.23
264 0.26
265 0.32
266 0.35
267 0.4
268 0.45
269 0.5
270 0.58
271 0.61
272 0.65
273 0.69
274 0.76
275 0.82
276 0.86
277 0.88
278 0.89
279 0.85
280 0.85
281 0.83
282 0.82
283 0.82
284 0.82
285 0.74
286 0.72
287 0.68
288 0.64
289 0.62
290 0.61
291 0.57
292 0.52
293 0.55
294 0.49
295 0.54
296 0.57
297 0.54
298 0.51
299 0.53
300 0.54
301 0.55
302 0.6
303 0.6
304 0.63
305 0.7
306 0.74
307 0.76
308 0.79
309 0.78
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311 0.82
312 0.83
313 0.83
314 0.85
315 0.85
316 0.87
317 0.93
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319 0.94
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322 0.93
323 0.92
324 0.86
325 0.86
326 0.87
327 0.83
328 0.8
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331 0.74
332 0.77
333 0.75
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336 0.72
337 0.7
338 0.67
339 0.67
340 0.66
341 0.67
342 0.7
343 0.68
344 0.67
345 0.66