Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHC9

Protein Details
Accession C5MHC9    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-393LIAQRMKVFHRKRKNLDAVINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 10, E.R. 8, nucl 2, pero 2, golg 2, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036188  FAD/NAD-bd_sf  
IPR013698  Squalene_epoxidase  
IPR040125  Squalene_monox  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0004506  F:squalene monooxygenase activity  
GO:0016126  P:sterol biosynthetic process  
KEGG ctp:CTRG_05483  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08491  SE  
Amino Acid Sequences MTTSTHYDAIVIGAGVIGPTIATALARQGRKVLILERDWSKPDRIVGELMQPAGIKALRELGMVKSINNIRAVNCTGYYIKYHNETVTIPYPLKKDANITNPMKPVPDVVDGENDKVDSDSTLDIDAWDKDERVRGVAFHHGDFLMNLRQICRDEPNVTAVEATVTKVLRDPFDPNIVIGVQAKEKDEVVEYHAKLVISCDGIYSKFRKELSQDNVPTIGSYFIGLYLKDAVLPMEGKGHVLLGDHSPVLIYPVSPNETRVLCAFASTKPPSSANDEVYTYLRDQVLPIVPKETLPAFKVALEERKFRIMPNQYLSAMKQGSENHLGFILLGDSLNMRHPLTGGGMTVGLNDSVLLAKLLHPKYVPDLGDHQLIAQRMKVFHRKRKNLDAVINTLSIALYSLFAADKKSLKILQNGCFRYFERGGECVNGPIGLLCGMLPFPMLLFNHFFSVAFYAIYINFVNRGLAGFPIALVEAFDALFTAVIVFTPYLWKEIVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.04
5 0.03
6 0.03
7 0.03
8 0.03
9 0.03
10 0.04
11 0.11
12 0.18
13 0.2
14 0.21
15 0.24
16 0.25
17 0.28
18 0.3
19 0.3
20 0.3
21 0.32
22 0.38
23 0.39
24 0.41
25 0.43
26 0.43
27 0.41
28 0.36
29 0.37
30 0.34
31 0.32
32 0.32
33 0.3
34 0.33
35 0.32
36 0.29
37 0.26
38 0.23
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.12
43 0.11
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.24
53 0.27
54 0.29
55 0.31
56 0.31
57 0.25
58 0.3
59 0.32
60 0.27
61 0.24
62 0.24
63 0.22
64 0.23
65 0.25
66 0.22
67 0.23
68 0.24
69 0.26
70 0.24
71 0.25
72 0.24
73 0.27
74 0.28
75 0.28
76 0.25
77 0.27
78 0.28
79 0.3
80 0.31
81 0.27
82 0.28
83 0.32
84 0.38
85 0.44
86 0.45
87 0.46
88 0.48
89 0.47
90 0.43
91 0.36
92 0.3
93 0.25
94 0.25
95 0.22
96 0.2
97 0.27
98 0.26
99 0.27
100 0.26
101 0.22
102 0.18
103 0.16
104 0.15
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.17
124 0.24
125 0.25
126 0.21
127 0.22
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.19
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.24
144 0.23
145 0.21
146 0.19
147 0.15
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.15
158 0.18
159 0.17
160 0.22
161 0.22
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.16
166 0.14
167 0.13
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.2
178 0.19
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.19
183 0.2
184 0.16
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.12
191 0.14
192 0.14
193 0.17
194 0.18
195 0.19
196 0.22
197 0.29
198 0.33
199 0.39
200 0.38
201 0.36
202 0.36
203 0.34
204 0.3
205 0.22
206 0.17
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.25
260 0.27
261 0.23
262 0.23
263 0.22
264 0.22
265 0.22
266 0.22
267 0.15
268 0.15
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.16
280 0.14
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.15
288 0.22
289 0.22
290 0.25
291 0.25
292 0.29
293 0.29
294 0.27
295 0.34
296 0.32
297 0.35
298 0.36
299 0.37
300 0.34
301 0.35
302 0.35
303 0.32
304 0.25
305 0.2
306 0.19
307 0.17
308 0.2
309 0.25
310 0.24
311 0.2
312 0.2
313 0.19
314 0.16
315 0.15
316 0.11
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.08
345 0.17
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.2
350 0.24
351 0.29
352 0.26
353 0.2
354 0.24
355 0.25
356 0.27
357 0.25
358 0.22
359 0.2
360 0.21
361 0.19
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.24
366 0.33
367 0.4
368 0.48
369 0.59
370 0.66
371 0.71
372 0.8
373 0.83
374 0.81
375 0.79
376 0.74
377 0.68
378 0.6
379 0.53
380 0.42
381 0.33
382 0.25
383 0.17
384 0.12
385 0.07
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.09
392 0.11
393 0.14
394 0.15
395 0.19
396 0.24
397 0.27
398 0.36
399 0.41
400 0.46
401 0.53
402 0.55
403 0.53
404 0.51
405 0.48
406 0.47
407 0.42
408 0.37
409 0.31
410 0.3
411 0.29
412 0.3
413 0.29
414 0.23
415 0.21
416 0.18
417 0.14
418 0.12
419 0.11
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.09
430 0.09
431 0.12
432 0.15
433 0.16
434 0.18
435 0.19
436 0.18
437 0.16
438 0.18
439 0.16
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.13
445 0.12
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.12
450 0.1
451 0.11
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.12
476 0.13
477 0.14