Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MFC0

Protein Details
Accession C5MFC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-339QKSSIFIQRKRKSPSPMTKTTSTSKRIKKPVQQKEPPSKIKRLKSSIFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-334KRKSPSPMTKTTSTSKRIKKPVQQKEPPSKIKRLK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_04763  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MESQFKNTKPKKLPTLTQLLIAKLKRHVSQISDVGNTPFHLLEPVLQQMPFKQLKQLEENCNQLIPHSDKLWMKLIVKDFPNRPVKIDPLKSSSPTSSSTTSFNNMPYKSLYFKYCKDRDDFRKDSARKLRNANKSIEKEKSKTKIIAVDQVLRDPSIRKVNSTSSNPGFTKSIQPINKNSILQKAKRDTVQSRNLLFARNQYIKPYDPFHAFKVNDTRSNNDPIRPPRSSSVRRTTFFNATSESLKNSTTASTITTTRTKPRLRTDDAMKPESDKPLPITSPVKPPLTSQKSSIFIQRKRKSPSPMTKTTSTSKRIKKPVQQKEPPSKIKRLKSSIFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.79
3 0.7
4 0.68
5 0.61
6 0.54
7 0.52
8 0.47
9 0.43
10 0.39
11 0.43
12 0.39
13 0.41
14 0.42
15 0.4
16 0.44
17 0.47
18 0.45
19 0.42
20 0.4
21 0.36
22 0.33
23 0.29
24 0.24
25 0.17
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.12
30 0.14
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.18
36 0.26
37 0.27
38 0.25
39 0.28
40 0.31
41 0.35
42 0.44
43 0.5
44 0.5
45 0.52
46 0.56
47 0.5
48 0.47
49 0.42
50 0.34
51 0.32
52 0.28
53 0.26
54 0.23
55 0.27
56 0.27
57 0.31
58 0.35
59 0.33
60 0.3
61 0.32
62 0.35
63 0.35
64 0.37
65 0.41
66 0.38
67 0.44
68 0.5
69 0.46
70 0.46
71 0.43
72 0.47
73 0.49
74 0.53
75 0.48
76 0.45
77 0.48
78 0.46
79 0.46
80 0.4
81 0.34
82 0.31
83 0.3
84 0.27
85 0.25
86 0.25
87 0.24
88 0.25
89 0.24
90 0.25
91 0.28
92 0.25
93 0.25
94 0.25
95 0.26
96 0.26
97 0.28
98 0.28
99 0.27
100 0.32
101 0.41
102 0.43
103 0.44
104 0.45
105 0.52
106 0.56
107 0.61
108 0.6
109 0.55
110 0.61
111 0.59
112 0.64
113 0.64
114 0.61
115 0.57
116 0.62
117 0.66
118 0.66
119 0.69
120 0.65
121 0.64
122 0.63
123 0.63
124 0.62
125 0.57
126 0.5
127 0.54
128 0.53
129 0.48
130 0.44
131 0.41
132 0.4
133 0.36
134 0.41
135 0.35
136 0.35
137 0.31
138 0.31
139 0.29
140 0.22
141 0.21
142 0.15
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.27
149 0.32
150 0.34
151 0.36
152 0.3
153 0.34
154 0.33
155 0.32
156 0.28
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.27
161 0.26
162 0.29
163 0.31
164 0.35
165 0.38
166 0.34
167 0.32
168 0.34
169 0.36
170 0.36
171 0.4
172 0.38
173 0.38
174 0.39
175 0.43
176 0.4
177 0.43
178 0.49
179 0.47
180 0.43
181 0.45
182 0.43
183 0.39
184 0.34
185 0.3
186 0.28
187 0.27
188 0.27
189 0.26
190 0.28
191 0.28
192 0.3
193 0.29
194 0.25
195 0.26
196 0.28
197 0.28
198 0.33
199 0.31
200 0.32
201 0.39
202 0.39
203 0.4
204 0.4
205 0.41
206 0.36
207 0.44
208 0.42
209 0.36
210 0.4
211 0.4
212 0.45
213 0.43
214 0.43
215 0.42
216 0.5
217 0.53
218 0.54
219 0.58
220 0.58
221 0.58
222 0.6
223 0.59
224 0.56
225 0.5
226 0.43
227 0.36
228 0.31
229 0.33
230 0.28
231 0.26
232 0.21
233 0.19
234 0.18
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.13
242 0.17
243 0.21
244 0.23
245 0.3
246 0.38
247 0.42
248 0.47
249 0.56
250 0.6
251 0.62
252 0.66
253 0.67
254 0.67
255 0.68
256 0.64
257 0.54
258 0.5
259 0.46
260 0.45
261 0.38
262 0.31
263 0.29
264 0.31
265 0.31
266 0.32
267 0.34
268 0.31
269 0.39
270 0.42
271 0.42
272 0.37
273 0.4
274 0.46
275 0.49
276 0.48
277 0.43
278 0.45
279 0.46
280 0.47
281 0.53
282 0.51
283 0.51
284 0.6
285 0.64
286 0.65
287 0.7
288 0.76
289 0.76
290 0.77
291 0.81
292 0.78
293 0.8
294 0.78
295 0.75
296 0.72
297 0.71
298 0.69
299 0.66
300 0.67
301 0.67
302 0.7
303 0.76
304 0.8
305 0.81
306 0.84
307 0.88
308 0.89
309 0.89
310 0.9
311 0.91
312 0.91
313 0.92
314 0.88
315 0.88
316 0.86
317 0.86
318 0.86
319 0.83