Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDL9

Protein Details
Accession C5MDL9    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-292TGQPPHEEKKRGRKPKSRKASDSGINBasic
313-372VTKRSRMGCLTCRQRKKRCCETRPKCTECARLRLNCVWPKPGTEHKNKPKDQKEDENTIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-285EKKRGRKPKSRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ctp:CTRG_03771  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSNLSNPNWNENPNGSKLGNPPAPRQASITSNPSNSNIMPPTPGSTGPHHPMPPHFATDYSRNVPVPGPGVPPFPLQQNQRAYLPNAAYTMQQSREKLQPGQAPLPQQQQQQQPMYHQYPPQPMGYLAADMYNNPQQQEYQQMNHLQNQQYNLQQRQQQQQEPSQTSNQKGKQQQPQQQQLSPQHPQTGAPVPVQQYPVAPEYNAAYQSQPSISGPPDHHQPQQHQVQGPPPQHWEGYPPQPQHGPIDSQVPPGQLQQQPSRQFPPTGQPPHEEKKRGRKPKSRKASDSGINTSHQLGGQVRSTSVGGTGKPVTKRSRMGCLTCRQRKKRCCETRPKCTECARLRLNCVWPKPGTEHKNKPKDQKEDENTIEHAEFGRIKVLRGIVEYRSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.35
3 0.36
4 0.39
5 0.44
6 0.44
7 0.43
8 0.44
9 0.49
10 0.53
11 0.49
12 0.49
13 0.44
14 0.43
15 0.45
16 0.47
17 0.43
18 0.42
19 0.43
20 0.41
21 0.4
22 0.35
23 0.35
24 0.3
25 0.26
26 0.26
27 0.25
28 0.26
29 0.25
30 0.26
31 0.24
32 0.26
33 0.32
34 0.35
35 0.39
36 0.38
37 0.38
38 0.4
39 0.44
40 0.42
41 0.39
42 0.35
43 0.31
44 0.33
45 0.36
46 0.4
47 0.36
48 0.36
49 0.31
50 0.32
51 0.31
52 0.28
53 0.25
54 0.21
55 0.21
56 0.2
57 0.22
58 0.22
59 0.23
60 0.22
61 0.25
62 0.29
63 0.29
64 0.35
65 0.39
66 0.4
67 0.41
68 0.43
69 0.4
70 0.39
71 0.37
72 0.3
73 0.26
74 0.24
75 0.21
76 0.21
77 0.23
78 0.22
79 0.25
80 0.25
81 0.28
82 0.33
83 0.36
84 0.36
85 0.38
86 0.38
87 0.39
88 0.43
89 0.42
90 0.41
91 0.41
92 0.45
93 0.43
94 0.41
95 0.43
96 0.45
97 0.49
98 0.49
99 0.46
100 0.43
101 0.47
102 0.47
103 0.44
104 0.4
105 0.39
106 0.4
107 0.41
108 0.38
109 0.31
110 0.28
111 0.27
112 0.24
113 0.19
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.13
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.23
126 0.23
127 0.2
128 0.23
129 0.29
130 0.3
131 0.35
132 0.4
133 0.34
134 0.33
135 0.34
136 0.32
137 0.32
138 0.36
139 0.33
140 0.32
141 0.35
142 0.39
143 0.45
144 0.48
145 0.48
146 0.46
147 0.49
148 0.52
149 0.49
150 0.47
151 0.44
152 0.42
153 0.41
154 0.45
155 0.43
156 0.43
157 0.47
158 0.52
159 0.55
160 0.6
161 0.65
162 0.66
163 0.72
164 0.68
165 0.63
166 0.62
167 0.59
168 0.55
169 0.5
170 0.42
171 0.35
172 0.32
173 0.3
174 0.27
175 0.26
176 0.22
177 0.19
178 0.2
179 0.19
180 0.21
181 0.21
182 0.18
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.13
203 0.15
204 0.2
205 0.23
206 0.26
207 0.28
208 0.3
209 0.34
210 0.38
211 0.4
212 0.36
213 0.35
214 0.37
215 0.41
216 0.39
217 0.34
218 0.31
219 0.29
220 0.27
221 0.26
222 0.25
223 0.22
224 0.28
225 0.33
226 0.31
227 0.32
228 0.33
229 0.34
230 0.33
231 0.3
232 0.25
233 0.19
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.25
238 0.22
239 0.21
240 0.2
241 0.25
242 0.21
243 0.25
244 0.28
245 0.35
246 0.38
247 0.41
248 0.44
249 0.4
250 0.38
251 0.36
252 0.38
253 0.4
254 0.42
255 0.41
256 0.41
257 0.46
258 0.54
259 0.59
260 0.58
261 0.55
262 0.6
263 0.69
264 0.75
265 0.78
266 0.8
267 0.84
268 0.88
269 0.92
270 0.9
271 0.86
272 0.82
273 0.8
274 0.77
275 0.72
276 0.66
277 0.57
278 0.49
279 0.43
280 0.38
281 0.3
282 0.23
283 0.19
284 0.16
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.11
295 0.14
296 0.18
297 0.22
298 0.25
299 0.31
300 0.34
301 0.38
302 0.45
303 0.45
304 0.52
305 0.53
306 0.57
307 0.58
308 0.63
309 0.68
310 0.71
311 0.78
312 0.78
313 0.82
314 0.85
315 0.87
316 0.89
317 0.89
318 0.9
319 0.9
320 0.91
321 0.91
322 0.92
323 0.88
324 0.84
325 0.81
326 0.8
327 0.76
328 0.75
329 0.73
330 0.67
331 0.68
332 0.67
333 0.69
334 0.66
335 0.63
336 0.6
337 0.52
338 0.51
339 0.51
340 0.55
341 0.55
342 0.58
343 0.65
344 0.7
345 0.79
346 0.82
347 0.87
348 0.86
349 0.87
350 0.85
351 0.85
352 0.82
353 0.81
354 0.77
355 0.7
356 0.62
357 0.55
358 0.46
359 0.36
360 0.29
361 0.24
362 0.21
363 0.18
364 0.24
365 0.21
366 0.22
367 0.25
368 0.27
369 0.25
370 0.27
371 0.3