Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MD47

Protein Details
Accession C5MD47    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-65EYLTGFHKRKLQRQKKAQEYHKEQDRLHydrophilic
258-296AKPKSAVNKSKKKFRYLSKSERKDNLRKEKSKAKQRGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-55KRKLQRQKKA
67-79KIEERKRIREERK
259-296KPKSAVNKSKKKFRYLSKSERKDNLRKEKSKAKQRGKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019186  Nucleolar_protein_12  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_04148  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09805  Nop25  
Amino Acid Sequences MAVVKKNRDILTGGKKYIQQKAKKHLVEEVTFDKESRKEYLTGFHKRKLQRQKKAQEYHKEQDRLFKIEERKRIREERKRDAELELQKFNETIKNVKNFKGFSKDGDNENDDEDEDGIVGELVSEDDDDDWTEKVKISIKEDGEWTGFSENPKDNSDSDDDSDSDSDSEEEEKPVKGILHHTEVYKQEPSLSSISSSNGNGAIIDDETTVTIESLDNPNIIDLEELAKQNNVNLAKSEQILEKSIQRAKNYAVLCGVAKPKSAVNKSKKKFRYLSKSERKDNLRKEKSKAKQRGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.53
4 0.59
5 0.6
6 0.58
7 0.6
8 0.68
9 0.75
10 0.73
11 0.68
12 0.67
13 0.65
14 0.58
15 0.54
16 0.49
17 0.44
18 0.41
19 0.39
20 0.36
21 0.31
22 0.31
23 0.3
24 0.28
25 0.25
26 0.25
27 0.35
28 0.39
29 0.48
30 0.5
31 0.52
32 0.57
33 0.6
34 0.69
35 0.71
36 0.73
37 0.73
38 0.79
39 0.84
40 0.86
41 0.9
42 0.9
43 0.9
44 0.88
45 0.86
46 0.85
47 0.8
48 0.7
49 0.69
50 0.64
51 0.57
52 0.5
53 0.48
54 0.48
55 0.5
56 0.59
57 0.58
58 0.6
59 0.63
60 0.71
61 0.74
62 0.75
63 0.77
64 0.78
65 0.79
66 0.77
67 0.71
68 0.65
69 0.63
70 0.61
71 0.57
72 0.49
73 0.41
74 0.36
75 0.35
76 0.32
77 0.27
78 0.2
79 0.21
80 0.24
81 0.32
82 0.34
83 0.38
84 0.41
85 0.39
86 0.41
87 0.43
88 0.38
89 0.32
90 0.38
91 0.37
92 0.36
93 0.38
94 0.36
95 0.29
96 0.3
97 0.26
98 0.18
99 0.16
100 0.13
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.03
107 0.03
108 0.02
109 0.02
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.13
123 0.15
124 0.17
125 0.23
126 0.23
127 0.23
128 0.24
129 0.24
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.17
143 0.2
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.12
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.08
156 0.07
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.13
165 0.15
166 0.19
167 0.21
168 0.21
169 0.24
170 0.25
171 0.28
172 0.24
173 0.21
174 0.18
175 0.17
176 0.2
177 0.17
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.06
210 0.07
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.18
218 0.17
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.2
224 0.21
225 0.18
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.23
230 0.27
231 0.33
232 0.35
233 0.34
234 0.35
235 0.35
236 0.4
237 0.37
238 0.32
239 0.27
240 0.24
241 0.23
242 0.25
243 0.28
244 0.22
245 0.22
246 0.22
247 0.24
248 0.32
249 0.4
250 0.45
251 0.51
252 0.6
253 0.67
254 0.76
255 0.79
256 0.79
257 0.8
258 0.81
259 0.81
260 0.81
261 0.84
262 0.85
263 0.88
264 0.87
265 0.88
266 0.87
267 0.86
268 0.86
269 0.86
270 0.86
271 0.83
272 0.82
273 0.84
274 0.85
275 0.86
276 0.86