Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MD38

Protein Details
Accession C5MD38    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47SPKSNHRRSLNLFQHHKRMSHydrophilic
863-891IATSGDKKPSKKGSKRSRKGTVRKDVEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
461-463SRK
869-885KKPSKKGSKRSRKGTVR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, cyto 2.5, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004182  GRAM  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR031968  VASt  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ctp:CTRG_04139  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02893  GRAM  
PF16016  VASt  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51778  VAST  
CDD cd13220  PH-GRAM_GRAMDC  
Amino Acid Sequences MGLKLHRKKKTNDDTASSTSSQSFANSSPKSNHRRSLNLFQHHKRMSSSGTFAEDKSFRGMINSINRSHSQSRPQTNNVNTSQIESGNQTPRTLPSSPTISRSNSMTKTSGNALQLPQKDVDMPGTSLIISNDELERVVKQPEGASGVDISISPNNGSQLLLNVPDKQQTNTSQTSSQHPPTHQPPTKTSTLDSSSDLQEHQHHHHHQSQQPAKSESGGFLSMFLNTGPAKSATPQEGNIDPNDKKKEHTSFAARLDNLLKGVKHEESKASLTGEGGGAEEQTDREIGRTSTDMKSVHSLTQDVQFEPVRESPLKTLGNGDLKLDDFDANVPGGLPDTEFVGSRRPSFRSADSTTKRAISPDRENNSVPVGNQVQAISNGNDLKRLKRRSGMSNGDRQSSVGRSSFVDNQTILSSDDHRSTIGAIRSRTSEVQDDLDILSDSELENLDNIVDYSKKIKHASRKRDKEFHQVFKKLPSGEKLIDEFSCAFSKDILVQGKMYLSDHYICFNSNILGWVTNLIIPLQEVIQIEKKSTAVLFPNGMVIRTLHQKYVFATFLSRDTTFDLITNVWHRVMLENSDIDPKKLQATLERKRRRANSNLSQVSRDESYVDDSDDDLGGSDEDNDDSMADDESGDDTSLDNDDGDNSEEKGTDESDVNGASVAATSGSSKDGNTFKGLPVVGPLTHAPTSTGYTKDSSETFIVEDTIKAPPGVVFLILFGSDTAKYIGILKEQKNFDISESSIKGLSKDNKERNYTYIKPLGGAIGPKQTKCVIEDKVIEYSPDKYYEVEQTTQTPDVPSGNSFKVKTKIFLSWAANNETKIYIVTSIEWSGKSWIKGAIEKGTIDGQKDSMGSLISITNRIIATSGDKKPSKKGSKRSRKGTVRKDVEEEPTKAVVSEPVKPKSIGDQFGDLINSIGDLVPIPFLSNTLVGTIVLIFGMIISFSLFNKITHRHTPKTIEIIPSNLYSSKIQIDGEKYLVLPTIETNFNNERMRRQEEVGIWNWINERSNGKLNLSLNCDSFEKLSNEELKSKYNEQELKEIVRLTKLKLDKLSEKLNDINL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.74
3 0.71
4 0.61
5 0.52
6 0.42
7 0.35
8 0.29
9 0.23
10 0.2
11 0.18
12 0.26
13 0.27
14 0.3
15 0.37
16 0.46
17 0.54
18 0.59
19 0.64
20 0.62
21 0.69
22 0.72
23 0.76
24 0.76
25 0.77
26 0.79
27 0.78
28 0.81
29 0.75
30 0.69
31 0.61
32 0.55
33 0.51
34 0.46
35 0.44
36 0.37
37 0.39
38 0.38
39 0.35
40 0.38
41 0.33
42 0.3
43 0.3
44 0.28
45 0.22
46 0.23
47 0.24
48 0.25
49 0.34
50 0.38
51 0.36
52 0.4
53 0.42
54 0.46
55 0.5
56 0.49
57 0.5
58 0.54
59 0.61
60 0.63
61 0.68
62 0.71
63 0.71
64 0.72
65 0.65
66 0.61
67 0.52
68 0.48
69 0.43
70 0.35
71 0.31
72 0.26
73 0.3
74 0.32
75 0.33
76 0.3
77 0.3
78 0.32
79 0.35
80 0.33
81 0.29
82 0.27
83 0.34
84 0.35
85 0.38
86 0.4
87 0.39
88 0.39
89 0.41
90 0.44
91 0.39
92 0.41
93 0.39
94 0.35
95 0.34
96 0.36
97 0.37
98 0.31
99 0.31
100 0.3
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.33
105 0.28
106 0.27
107 0.25
108 0.26
109 0.21
110 0.19
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.13
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.16
130 0.19
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.23
153 0.24
154 0.24
155 0.27
156 0.29
157 0.34
158 0.35
159 0.37
160 0.37
161 0.38
162 0.42
163 0.45
164 0.47
165 0.46
166 0.44
167 0.48
168 0.51
169 0.6
170 0.58
171 0.56
172 0.54
173 0.55
174 0.57
175 0.52
176 0.46
177 0.42
178 0.4
179 0.38
180 0.35
181 0.32
182 0.28
183 0.28
184 0.27
185 0.22
186 0.23
187 0.26
188 0.28
189 0.33
190 0.36
191 0.4
192 0.47
193 0.53
194 0.52
195 0.58
196 0.61
197 0.58
198 0.59
199 0.57
200 0.5
201 0.45
202 0.42
203 0.32
204 0.27
205 0.23
206 0.17
207 0.15
208 0.15
209 0.12
210 0.12
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.16
220 0.19
221 0.21
222 0.22
223 0.24
224 0.25
225 0.27
226 0.27
227 0.29
228 0.26
229 0.32
230 0.37
231 0.34
232 0.34
233 0.4
234 0.44
235 0.43
236 0.48
237 0.48
238 0.48
239 0.53
240 0.57
241 0.48
242 0.44
243 0.42
244 0.35
245 0.29
246 0.26
247 0.2
248 0.16
249 0.2
250 0.21
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.27
256 0.26
257 0.24
258 0.21
259 0.18
260 0.17
261 0.15
262 0.11
263 0.09
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.12
277 0.15
278 0.16
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.22
286 0.21
287 0.19
288 0.24
289 0.24
290 0.2
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.22
295 0.22
296 0.2
297 0.19
298 0.21
299 0.19
300 0.26
301 0.25
302 0.23
303 0.24
304 0.25
305 0.29
306 0.28
307 0.27
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.19
312 0.14
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.21
332 0.22
333 0.25
334 0.28
335 0.31
336 0.32
337 0.36
338 0.43
339 0.44
340 0.44
341 0.43
342 0.42
343 0.39
344 0.34
345 0.34
346 0.31
347 0.37
348 0.43
349 0.45
350 0.46
351 0.46
352 0.45
353 0.43
354 0.36
355 0.27
356 0.22
357 0.19
358 0.17
359 0.17
360 0.16
361 0.13
362 0.14
363 0.16
364 0.11
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.19
369 0.19
370 0.25
371 0.32
372 0.36
373 0.37
374 0.41
375 0.46
376 0.48
377 0.57
378 0.6
379 0.56
380 0.61
381 0.59
382 0.54
383 0.5
384 0.42
385 0.35
386 0.27
387 0.24
388 0.16
389 0.15
390 0.14
391 0.17
392 0.22
393 0.21
394 0.21
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.15
400 0.11
401 0.13
402 0.12
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.15
409 0.17
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.21
414 0.23
415 0.23
416 0.21
417 0.19
418 0.16
419 0.17
420 0.16
421 0.15
422 0.13
423 0.12
424 0.1
425 0.08
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.09
441 0.11
442 0.15
443 0.19
444 0.24
445 0.34
446 0.43
447 0.54
448 0.61
449 0.7
450 0.74
451 0.79
452 0.78
453 0.79
454 0.77
455 0.75
456 0.73
457 0.66
458 0.6
459 0.57
460 0.56
461 0.47
462 0.4
463 0.33
464 0.29
465 0.27
466 0.27
467 0.24
468 0.21
469 0.19
470 0.19
471 0.16
472 0.14
473 0.13
474 0.12
475 0.11
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.07
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.13
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.09
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.1
530 0.09
531 0.1
532 0.15
533 0.16
534 0.15
535 0.15
536 0.16
537 0.16
538 0.2
539 0.19
540 0.13
541 0.13
542 0.12
543 0.13
544 0.15
545 0.14
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.09
553 0.1
554 0.11
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.1
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.16
569 0.15
570 0.16
571 0.16
572 0.16
573 0.17
574 0.27
575 0.35
576 0.46
577 0.53
578 0.56
579 0.61
580 0.68
581 0.67
582 0.66
583 0.67
584 0.65
585 0.68
586 0.7
587 0.64
588 0.58
589 0.52
590 0.45
591 0.36
592 0.27
593 0.17
594 0.11
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.09
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.05
615 0.05
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.05
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.04
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.06
631 0.07
632 0.08
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.09
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.04
653 0.04
654 0.06
655 0.06
656 0.07
657 0.11
658 0.13
659 0.14
660 0.17
661 0.17
662 0.16
663 0.19
664 0.19
665 0.15
666 0.15
667 0.15
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.13
672 0.13
673 0.13
674 0.12
675 0.12
676 0.15
677 0.16
678 0.17
679 0.15
680 0.16
681 0.16
682 0.17
683 0.16
684 0.16
685 0.14
686 0.14
687 0.13
688 0.11
689 0.12
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.08
696 0.08
697 0.07
698 0.08
699 0.08
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.05
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.09
714 0.1
715 0.15
716 0.21
717 0.24
718 0.3
719 0.31
720 0.32
721 0.31
722 0.31
723 0.26
724 0.23
725 0.21
726 0.2
727 0.2
728 0.2
729 0.2
730 0.19
731 0.19
732 0.23
733 0.29
734 0.32
735 0.41
736 0.48
737 0.53
738 0.58
739 0.59
740 0.57
741 0.58
742 0.53
743 0.5
744 0.47
745 0.41
746 0.36
747 0.34
748 0.31
749 0.24
750 0.22
751 0.17
752 0.2
753 0.22
754 0.22
755 0.23
756 0.24
757 0.24
758 0.25
759 0.29
760 0.23
761 0.26
762 0.3
763 0.3
764 0.32
765 0.31
766 0.29
767 0.24
768 0.25
769 0.22
770 0.2
771 0.18
772 0.16
773 0.18
774 0.23
775 0.26
776 0.24
777 0.24
778 0.24
779 0.27
780 0.27
781 0.25
782 0.19
783 0.17
784 0.16
785 0.16
786 0.15
787 0.17
788 0.19
789 0.22
790 0.23
791 0.27
792 0.32
793 0.32
794 0.34
795 0.33
796 0.33
797 0.33
798 0.38
799 0.38
800 0.37
801 0.39
802 0.41
803 0.4
804 0.36
805 0.34
806 0.28
807 0.23
808 0.18
809 0.15
810 0.11
811 0.1
812 0.11
813 0.12
814 0.13
815 0.14
816 0.14
817 0.15
818 0.18
819 0.2
820 0.2
821 0.19
822 0.21
823 0.22
824 0.25
825 0.27
826 0.28
827 0.27
828 0.26
829 0.26
830 0.28
831 0.27
832 0.25
833 0.23
834 0.18
835 0.17
836 0.17
837 0.16
838 0.11
839 0.1
840 0.08
841 0.08
842 0.1
843 0.1
844 0.11
845 0.11
846 0.13
847 0.13
848 0.13
849 0.12
850 0.11
851 0.16
852 0.22
853 0.27
854 0.33
855 0.37
856 0.39
857 0.47
858 0.57
859 0.62
860 0.63
861 0.7
862 0.73
863 0.8
864 0.88
865 0.9
866 0.9
867 0.9
868 0.91
869 0.91
870 0.91
871 0.88
872 0.82
873 0.77
874 0.7
875 0.68
876 0.65
877 0.56
878 0.49
879 0.42
880 0.38
881 0.33
882 0.29
883 0.26
884 0.22
885 0.27
886 0.31
887 0.34
888 0.36
889 0.36
890 0.37
891 0.4
892 0.44
893 0.4
894 0.36
895 0.35
896 0.34
897 0.35
898 0.34
899 0.25
900 0.19
901 0.14
902 0.11
903 0.08
904 0.07
905 0.05
906 0.05
907 0.05
908 0.06
909 0.06
910 0.07
911 0.07
912 0.07
913 0.09
914 0.09
915 0.09
916 0.09
917 0.09
918 0.08
919 0.09
920 0.08
921 0.06
922 0.05
923 0.05
924 0.04
925 0.03
926 0.03
927 0.03
928 0.03
929 0.04
930 0.05
931 0.05
932 0.1
933 0.11
934 0.12
935 0.18
936 0.23
937 0.28
938 0.38
939 0.46
940 0.48
941 0.54
942 0.6
943 0.6
944 0.63
945 0.61
946 0.58
947 0.52
948 0.49
949 0.45
950 0.39
951 0.36
952 0.29
953 0.27
954 0.21
955 0.22
956 0.21
957 0.2
958 0.2
959 0.22
960 0.25
961 0.26
962 0.26
963 0.25
964 0.22
965 0.21
966 0.22
967 0.17
968 0.14
969 0.13
970 0.15
971 0.18
972 0.18
973 0.24
974 0.25
975 0.32
976 0.38
977 0.38
978 0.4
979 0.44
980 0.5
981 0.48
982 0.48
983 0.48
984 0.47
985 0.52
986 0.47
987 0.47
988 0.41
989 0.39
990 0.38
991 0.34
992 0.31
993 0.27
994 0.29
995 0.26
996 0.34
997 0.35
998 0.35
999 0.38
1000 0.39
1001 0.42
1002 0.44
1003 0.42
1004 0.35
1005 0.35
1006 0.34
1007 0.29
1008 0.28
1009 0.28
1010 0.24
1011 0.24
1012 0.3
1013 0.34
1014 0.36
1015 0.41
1016 0.41
1017 0.41
1018 0.45
1019 0.47
1020 0.46
1021 0.49
1022 0.52
1023 0.49
1024 0.54
1025 0.53
1026 0.51
1027 0.5
1028 0.48
1029 0.4
1030 0.42
1031 0.41
1032 0.36
1033 0.41
1034 0.41
1035 0.44
1036 0.47
1037 0.53
1038 0.52
1039 0.57
1040 0.63
1041 0.57
1042 0.58